Дисбактериоз у грудничка причины симптомы лечение: Дисбактериоз у детей — причины, симптомы, диагностика и лечение дисбактериоза кишечника у ребенка в Москве в детской клинике «СМ-Доктор»

Изучить состав кишечной микробиоты младенцев в связи с пренатальным стрессом матери и здоровьем младенцев	Вложенный дизайн случай-контроль ( n = 56)	Пренатальный стресс	Изменения в постнатальном микробиоме , 28, 80 и 110	Желудочно-кишечные симптомы и аллергическая реакция в возрасте 3 мес. 9000 5	У младенцев, подвергшихся пренатальному стрессу, чаще проявлялись желудочно-кишечные симптомы (38% по сравнению с 22%) и аллергические реакции (43% по сравнению с 0%), которые были связаны с изменениями микробиома.Этот микробиома был характеризован менее молочной кислотой бактерий и Akkermansia и более Escherichia , Serratia , и Serratia	83
83
Ожирение и метаболизм
для анализа, если в целом микробиота. связан с ИМТ у детей, и если использование антибиотиков изменяет эту связь	Вложенный дизайн случай-контроль из 2 когорт (группа Bibo, n = 87; когорта Flora, n = 75)	Лечение антибиотиками	Различия в кишечный микробиом в возрасте 3 мес.	ИМТ в возрасте 5–6 лет	связаны с ИМТ в возрасте 5–6 лет.Среди детей с многократными курсами антибиотиков в анамнезе тип Firmicutes был в значительной степени связан с ИМТ. Однако состав микробиома не измерялся ни в какой другой момент времени	84
диета с высоким содержанием жиров во время беременности и грудного вскармливания	Изменения в составе микробиома потомства	Сдвиги в микробных метаболических путях	В этом исследовании связь с конкретным результатом для здоровья не была установлена.Однако материнская диета с высоким содержанием жиров действительно изменила состав микробиома потомства макак, который сохранился у молодых макак. У потомства изменены метаболические пути в зависимости от материнской диеты. Кроме того, эти функциональные пути (аминокислотный, углеводный и липидный метаболизм) коррелируют с количеством специфических кишечных бактерий	44
= 24)	Нет	Различия в составе плацентарного микробиома	Масса тела при рождении	Младенцы с низкой массой тела при рождении демонстрируют более низкое богатство микробиома кишечника и различия в содержании определенных таксонов бактерий по сравнению с младенцами с нормальной массой тела при рождении. Процент Lactobacillus положительно коррелировал с массой тела при рождении	24
индуцированный	Воздействие LDP от рождения до отлучения от груди	Состав тела во взрослом возрасте	По сравнению с контрольной группой и мышами, подвергшимися длительному воздействию LDP, мыши, подвергавшиеся воздействию LDP в течение 4 или 8 недель после рождения, демонстрировали повышенное потребление калорий и более быструю общую массу и накопление жировой массы.Авторы также сообщают, что микробиота, отобранная пенициллином, может вызывать метаболические изменения при переносе на мышей GF	6
по сравнению со стандартной диетой)	Индуцированное антибиотиками	Импульсное лечение антибиотиками, завершенное вскоре после отлучения от груди	Состав тела в возрасте 3–6 недель	Импульсное лечение антибиотиками в раннем возрасте ускоряет рост общей массы и костей.Авторы также сообщают, что реакция на диету с высоким содержанием жиров изменяется в зависимости от конкретного антибиотика и количества курсов, используемых для нарушения микробиоты	85
потенциал	Вложенный дизайн случай-контроль ( n = 39)	Ожирение матери до беременности	Изменения в составе и функции микробиома младенцев	Метаболизм младенцев в возрасте 18 месяцев нормальный вес, тогда как бактериоиды были обогащены у детей, рожденных женщинами, страдающими ожирением. В этом исследовании связь с последствиями для здоровья младенцев не была установлена, но были выявлены дифференциальные метаболические функции микробиома, которые были основаны на том, родились ли младенцы от матерей с нормальной массой тела или от женщин, страдающих ожирением. исследовать влияние воздействия кадмия на микробиоту кишечника в раннем возрасте и метаболизм во взрослом возрасте	Модель SPF на мышах	Воздействие кадмия за 1 неделю до спаривания родителей	Изменения в составе микробиома, наблюдаемые в возрасте 8 недель и во взрослом возрасте (20 недель)	Состав тела, измеренный во взрослом возрасте	Воздействие кадмия на родительских мышей привело к повышенному накоплению жира у потомства мужского пола.Изменения в составе микробиома произошли до измерения состава тела. Кроме того, с помощью экспериментов по переносу микробиоты группа сообщила, что накопление жира было обусловлено микробиомом, подвергшимся воздействию кадмия	87
дизайн случай-контроль ( n = 49)	Нет	Изменения состава микробиома в возрасте от 6 до 12 месяцев	ИМТ, измеренный в возрасте 7 лет ожирение в младенчестве. Повышенное содержание бифидобактерий у детей с нормальной массой тела в младенчестве	88
)	Гестационный возраст и способ родоразрешения	Изменения микробиома в возрасте до 6 мес.	Ожирение в возрасте 18 мес. возраст.Младенцы, которые приобрели эти таксоны в 6 месяцев, показали самый низкий уровень ожирения в 18 месяцев. Кроме того, на приобретение этих бактериальных таксонов влияли продолжительность беременности и способ родов	89
Индуцированный антибиотиками	Изменения в микробиоме, измеренные перед умерщвлением	Состав тела, измеренный во взрослом возрасте (16–20 недель)	Авторы создали мышиную модель ожирения, подвергнув мышей в раннем возрасте воздействию антибиотиков.Изменения микробного состава до измерения ожирения не оценивались. Однако антибиотики изменили состав микробиома, метаболизм короткоцепочечных жирных кислот и метаболизм жирных кислот и липидов в печени	90
( n = 138)	Нет	Изменения в составе микробиома в течение первого года жизни	Оценка SD ИМТ между 1 и 3 годами ассоциируется с показателем SD ИМТ в возрасте от 1 до 3 лет. Избыточность Staphylococcus в 3 и 52 Wk обратно связана с BMI SD-баллом между 1 и 3 y	91
, чтобы определить, определяют ли ограниченный гнездовой стресс, использует потомство микробиоты, кортикостерон и кишечную проницаемость.	Крысиная модель ограниченного гнездового стресса	Ограниченный гнездовой стресс	Изменения в составе микробиома кишечника через 21 день после рождения (при отъеме)	Ограниченный гнездовой стресс со 2-го по 10-й дни после рождения кишечная проницаемость, снижение микробного разнообразия и вариации специфических микробных таксонов модель мыши	Питание матери с высоким содержанием жиров	Изменения состава кишечного микробиома у потомства	Поведенческие исследования потомства мышей в возрасте 7–12 недель	Материнская диета с высоким содержанием жиров вызывает изменения состава кишечного микробиома у потомства мышей. Мыши-потомки матерей на диете с высоким содержанием жиров, живущие вместе с мышами, рожденными от матерей, выращенных на обычной диете, демонстрировали нормальное социальное поведение. Кроме того, повторное введение L reuteri (отсутствующего у потомства мышей, матери которых получали диету с высоким содержанием жиров) восстанавливало нормальное социальное поведение у этих мышей	93
профили	Проспективный когортный анализ людей ( n = 89)	Группа 2 с большей вероятностью находилась на грудном вскармливании, с меньшей вероятностью была рождена путем кесарева сечения и ассоциировалась с белой этнической принадлежностью.Наличие старших братьев и сестер было связано с повышенным альфа-разнообразием	3 группы субъектов были выделены на основе анализа их 1-летнего микробиома	Когнитивные результаты в возрасте 1 и 2 лет	Три группы субъектов были выделены на основе их микробиом. Группа 1 показала высокую численность Faecalibacterium , группа 2 показала высокую численность Bacteroides , а группа 3 показала высокую численность ruminococcaceae. Индивидуальные шкалы Маллена различались между группами.α-разнообразие было отрицательно связано с отдельными шкалами Маллена в возрасте 2 лет (выразительная речь и визуальная рецепция)	94
Определить, влияет ли материнский пренатальный стресс на микробную внутриутробную среду и поведение потомства	Модель пренатального стресса на мышах	Пренатальный стресс	Изменения микробиома плаценты и фекального микробиома потомства	Тревожное поведение у потомства	Пренатальный материнский стресс был связан с изменениями микробиома самок, потомства и плаценты.Кроме того, пренатальный стресс связан с повышением уровня IL-1β в плаценте и снижением нейротрофического фактора головного мозга в плаценте и миндалевидном теле взрослого потомства	7
	Крысиная модель (стресс, вызванный разлучением с матерью)	Разлучение с матерью в раннем возрасте (с 4 по 19 день)	Изменения микробиома и функции кишечника у потомства	Активность гипоталамо-гипофизарно-надпочечниковой оси	Повышение уровня кортикостерона и изменение Барьерная функция слизистой оболочки толстой кишки у крысят, разлученных с матерью. Введение пробиотиков (состоящих из штаммов Lactobacillus rhamnosus и Lactobacillus helveticus ) крысятам в раннем возрасте улучшает эти результаты и сохраняется до взрослого возраста	95
	Крысиная модель (стресс, вызванный разлучением с матерью)	Разлучение с матерью в раннем возрасте	Изменения в составе микробиома у крысят	Симптомы психических расстройств и синдрома раздраженного кишечника	Повышение уровня кортикостерона в плазме и повышение уровня фактора некроза опухоли интерферон-γ.Кроме того, состав микробиома различался в группе, разлученной с матерью, по сравнению с крысами, которые не были разлучены с матерью	96
активность и тревожное поведение	Крысиная модель	Нет	Пре- и постнатальное воздействие ЛПС или пропионовой кислоты	Поведенческие черты у потомства	Пренатальное введение пропионовой кислоты повышает тревожноподобное поведение у потомства мужского и женского пола. Постнатальная пропионовая кислота усиливала тревожное поведение только у потомства женского пола. Пренатальная пропионовая кислота и LPS-индуцированные задержки развития (включая задержку открывания глаз)	97
Определить, влияет ли колонизация микробиотой кишечника в раннем возрасте на развитие мозга и поведение взрослых	Модели мышей GF и SPF	Нет Потомство ранее колонизированных мышей GF с микробиотой SPF	Поведение во взрослом возрасте	Потомство взрослых колонизированных мышей демонстрировало сходное поведение с мышами SPF.Эти мыши тратили меньше времени на изучение открытых рукавов в лабиринте (меньшая двигательная активность). Кроме того, колонизированные мыши экспрессировали меньше синаптофизина и PSD-95 в стриатуме по сравнению с мышами GF, что позволяет предположить, что микробиом участвует в программировании развития мозга	98
поведение потомства	Мышиная модель, колонизированная микробиотой в форме материнской диеты с высоким содержанием жиров -жировая диета- или контроль кишечного микробиома, связанного с диетой с низким содержанием жиров. Потомство этих мышей демонстрировало измененное поведение в зависимости от пола. Потомство мышей проявляло меньше стресса после разлучения с матерью. Потомство мужского пола демонстрировало снижение исследовательского и когнитивного поведения, что свидетельствует о повышенной тревожности. У самок мышей наблюдалось увеличение ожирения и массы тела	99
Для анализа микробных и молекулярных механизмов, лежащих в основе оси кишечник-мозг	GF и модели мышей, выращенных традиционным способом	Нет	колонизированных мышей	Активность нейронов в миндалевидном теле	Отсутствие микробиоты в раннем возрасте приводит к дифференциальной экспрессии генов, использованию экзонов, редактированию РНК и регуляции восходящих генов в миндалевидном теле.Это было аналогично мышам, которые выращивали GF на протяжении всей своей жизни, но различались по сравнению с обычными мышами	100
Пренатальный стресс	Изменения в микробиоме влагалища матери и новорожденного	Метаболическое и неврологическое программирование и у потомства	Содержание Lactobacillus снижено во влагалищном микробиоме и у новорожденных, рожденных от самок, подвергшихся раннему внутриутробному стрессу. Обилие других бактериальных популяций также варьировало у потомства, подвергшегося раннему внутриутробному стрессу. Ранний пренатальный стресс изменил метаболические профили и доступность аминокислот в головном мозге	101
Иммуноопосредованные заболевания (ВЗК, СД1 и т. д.)
астма	Модель индуцированного оксазолоном колита на мышах	Нет	SPF-колонизация во время беременности приводит к колонизации SPF потомства	Колит, индуцированный в более позднем возрасте Индуцированный COLITE	76
	мышей, получавших ЛДП, продемонстрировали транзиторный микробный состав кишечника все изменения, в том числе эрадикация сегментоядерных нитчатых бактерий.Кроме того, после индуцированного DSS колита у мышей с ЛДП наблюдалось снижение симптомов колита, экспрессия IL-17 и дифференцировка Th27 в подвздошной кишке по сравнению с мышами, подвергшимися воздействию метронидазола, энрофлоксацина, и контрольной группой. Наконец, авторы сообщают, что эффекты пенициллина зависят от эрадикации сегментированных нитчатых бактерий, вовлекая микробиом в качестве посредника между этим воздействием в раннем возрасте и развитием колита	102
	Модель NOD на мышах	Индуцированное антибиотиками	Лечение антибиотиками в раннем возрасте (от зачатия до 40 недель после рождения)	Спонтанный диабет в более позднем возрасте	Антибиотики вводили мышам NOD с момента зачатия до 40 недель постнатального развития.Лечение антибиотиками увеличивало заболеваемость СД1 у самцов мышей. Лечение антибиотиками также приводило к почти полной абляции кишечного микробиома в возрасте 8 недель, что может частично объяснить повышенную заболеваемость СД1 у самцов мышей	103
модель на мышах	Антибиотико-индуцированный	Пренатальное лечение антибиотиками вызвало изменения микробиомов потомства и матери	Спонтанный диабет в более позднем возрасте	Пренатальное лечение неомицином и ванкомицином привело к дифференциальным сдвигам в потомстве и материнском микробиоме. Потомство, получавшее пренатально неомицин, было защищено от развития СД1, тогда как потомство, получавшее пренатально ванкомицин, демонстрировало ускоренное развитие СД1. Лечение антибиотиками также приводило к изменению иммунных профилей, например усилению воспаления, опосредованного Т-клетками, у мышей, получавших ванкомицин, и изменению фенотипов антигенпрезентирующих клеток у мышей, получавших неомицин	104
-отрицательные кишечные бактерии в разные моменты жизни в раннем возрасте при развитии СД1	Модель NOD на мышах	Антибиотико-индуцированный	Пренатальное лечение антибиотиками вызвало изменения в микробиоме потомства	Спонтанный диабет в более позднем возрасте	смесь антибиотиков (неомицин, полимиксин В и стрептомицин) были защищены от СД1 по сравнению с мышами, получавшими постнатальное лечение.Перенос микробиоты от этих мышей к нелеченым мышам привел к защите от СД1	105
	Импульсное лечение антибиотиками вызывало изменения микробиома в возрасте 6 недель	Спонтанный диабет в более позднем возрасте	Импульсное постнатальное лечение тилозином изменяло микробиом мышей и ускоряло развитие СД1 по сравнению с мышами, получавшими субтерапевтический пенициллин от беременности до 12-й недели	106
Для анализа ассоциации между младенцем кишечниками и разработкой T1D	потенциальный анализ человека человека ( N = 33)	None	Вариации в микробиоме до диагностики с диагностикой T1D	T1D при ~3 лет	T 1D болезненное состояние можно было отличить по составу кишечного микробиома. Сероконверсия субъектов с диагнозом СД1 показала заметное снижение α-разнообразия до постановки диагноза по сравнению с сероконверсией субъектов без диагноза СД1 и несероконверсией субъектов	107
потомство	Мыши с нокаутом SPF IL-10 в сочетании с DSS-индуцированным колитом	Антибиотико-индуцированный	Послеродовое лечение антибиотиками, индуцированное дисбиозом кишечника у потомства, который сохраняется во взрослом возрасте	Спонтанный колит в более позднем возрасте	цефоперазон увеличивает риск спонтанного колита у потомства.Антибиотики также способствуют перекосу иммунитета и способствуют дисбактериозу кишечника, который сохраняется во взрослом возрасте. Кроме того, как показала фекальная трансплантация самкам с нокаутом GF IL-10, перекос иммунной системы опосредован вызванным антибиотиками дисбиозом	108
дифференциация у потомства	SPF GPR41-/- модель мыши	Материнская диета с высоким содержанием клетчатки во время беременности и грудного вскармливания	Повышение SCFAs в плазме	Повышение тимуса и периферических Т-регуляторных клеток	По сравнению с потомством мышей-матерей, которых кормили матерями диета, диета с высоким содержанием клетчатки во время беременности и грудного вскармливания приводила к увеличению SCFAs в плазме у потомства. У этих потомков также наблюдалась более высокая частота тимических и периферических Т-регуляторных клеток, что может быть вызвано повышенным уровнем SCFA	46

внутри нашего желудочно-кишечного тракта и отвечают за жизненно важные метаболические, иммунные и питательные функции. Дисбактериоз, означающий неадекватный дисбаланс микробиома, связан со многими распространенными заболеваниями и является мишенью для терапии.

Цель

Обсуждение

Триллионы бактерий, вирусов, грибков, архей и эукариотических организмов живут в желудочно-кишечном тракте человека и составляют то, что в совокупности называется кишечным микробиомом. Эти организмы составляют более 50% клеток человеческого организма и весят в среднем до 2 кг у взрослого человека. ^1,2 В желудке и тонком кишечнике относительно мало микроорганизмов из-за кислой среды, присутствия желчи и панкреатического сока, а также эффектов перистальтики, которые ограничивают стабильную колонизацию.Таким образом, подавляющее большинство (10 ¹² ) микробиоты живет и взаимодействует с человеком-хозяином именно в толстой кишке. Наши знания о микробиоме кишечника человека как в здоровом, так и в болезненном состоянии за последние 10 лет быстро расширились благодаря увеличению доступности и снижению стоимости секвенирования генов. ³ Это убедительно свидетельствует о жизненно важной роли микробиома кишечника в нормальном обмене веществ, питании, иммунной функции, физиологии и профилактике заболеваний. Помимо прямого воздействия на слизистую оболочку кишечника и кишечную нервную систему, многие химические медиаторы, продуцируемые кишечным микробиомом, попадают в кровоток и взаимодействуют с дистальными органами, такими как мозг, сердце и печень. ⁴

Микробиом здоровья

Хотя не существует стандартного определения микробиома здорового кишечника, важными характеристиками являются микробиом с высоким уровнем разнообразия, стабильности, устойчивости к изменениям, связанным со стрессом (антибиотики, инфекции, иммуносупрессия) и высокий уровень избыточности метаболических путей. ⁵

Развивающийся кишечный микробиом

Исторически кишечник внутриутробно воспринимался как стерильная среда; однако новые данные свидетельствуют о том, что микробный контакт начинается еще до рождения с материнской микробиотой. ⁶ Более обширная колонизация начинается при рождении и во время родов защитными вагинальными микробами, такими как Lactobacillus . Однако дети, рожденные с помощью кесарева сечения, и те, кто не находится исключительно на грудном вскармливании, могут быть колонизированы кожными и внутрибольничными бактериями, такими как Staphylococcus и Acinetobacter , что приводит к изначально менее разнообразному и здоровому микробиому. ^6,7 Эти младенцы более склонны к развитию астмы, аллергического ринита, диабета и глютеновой болезни. ⁸ Развивающийся кишечный микробиом в первый год жизни подобен таковому у матери, но вскоре на него влияют различные факторы, в том числе диета, пищевые привычки и окружающая среда. ⁹ Зрелый микробиом кишечника формируется в возрасте от одного до трех лет и после этого остается относительно стабильным. К этому времени он в основном состоит из анаэробных бактерий, представленных более чем 50 типами и 1000 видами. Несмотря на это разнообразие, большинство микробов происходят из двух бактериальных типов: Bacteroidetes и Firmicutes. ¹⁰

Метаболические и сигнальные функции

Микробиом кишечника отвечает за ряд жизненно важных метаболических и сигнальных функций, многие из которых не достижимы только человеческим организмом. К ним относятся синтез всех витаминов группы В (В ₁ – В ₁₂ ) и витамина К, ¹¹ переработка пищи, переваривание иначе неусвояемых сложных полисахаридов (крахмалов, целлюлозы и камеди), синтез незаменимых аминокислот, биотрансформация желчи для содействия метаболизму глюкозы и холестерина, а также производство метаболитов короткоцепочечных жирных кислот, таких как бутират и ацетат, которые действуют как источник энергии для кишечных бактерий и могут оказывать противовоспалительное действие. ¹² Некоторые частично перевариваемые продукты могут, в свою очередь, обогащать определенные полезные микробные популяции, хотя прямая польза для здоровья еще не установлена. Примерами этих продуктов, часто называемых пребиотиками, являются злаки, спаржа, лук-порей, артишоки, бобовые, капуста и листовая капуста. ¹² Микробиота кишечника может также связываться с центральной нервной системой через несколько путей, включая блуждающий нерв, гипоталамо-гипофизарно-надпочечниковую ось, выработку нейротрансмиттеров или их предшественников, включая серотонин, триптофан, гамма-аминомасляную кислоту, дофамин, l -допа и норадреналин, а также через гормоны, такие как кортизол, грелин, лептин и глюкагоноподобный пептид-1. ¹³

Защитные иммунные функции

Нормальная микробиота кишечника является нашей первой внутренней линией защиты от патогенов и токсинов, защищая организм от болезней в тандеме с иммунной системой хозяина. Одной из ключевых функций здорового микробиома является предотвращение колонизации патогенов за счет барьерного эффекта. Это происходит за счет производства антимикробных соединений, таких как бактериоцин, и вытеснения патогенов за питательные вещества и места прикрепления за счет одной только силы численности. ³ Кишечные бактерии также являются неотъемлемой частью развития системы врожденного иммунитета слизистой оболочки за счет прямого взаимодействия с эпителиальными клетками кишечника. Раннее воздействие различных бактерий обеспечивает своего рода тренировку иммунной системы, так что возникают нормальные защитные реакции на комменсалов и соответствующие воспалительные реакции на воздействие патогенов. И наоборот, снижение микробного разнообразия и воздействие в раннем возрасте может привести к чрезмерной реакции иммунной системы на антигены, предрасполагая к аутоиммунным и аллергическим заболеваниям. ¹⁴

Микробиом и болезнь

Многие желудочно-кишечные заболевания связаны с изменениями микробиома кишечника, равно как и нарушения обмена веществ, заболевания печени, некоторые неврологические расстройства и расстройства настроения, артриты и иммунологические состояния. ¹⁵ Дисбактериоз, означающий дисбаланс или неадекватное состояние микробиома, встречается почти во всех этих состояниях, хотя в большинстве случаев не установлено, является ли это причиной или следствием. Мы рассматриваем эти условия с наибольшим количеством доказательств и обсуждаем исследования модуляции кишечных бактерий в качестве терапии.

Clostridium difficile – спорообразующий грамположительный анаэроб, продуцирующий токсины А и В; последний отвечает за воспаление толстой кишки и развитие псевдомембранозного колита. Заболеваемость и тяжесть инфекции C. difficile (CDI) в Австралии и во всем мире растут: в 2012 г. в австралийских больницах было зарегистрировано более 12 000 случаев, что привело к атрибутивной смертности 6–7%. ¹⁶ C. difficile редко вызывает заболевание у здоровых взрослых; скорее, это требует нарушения нормальных механизмов резистентности и флоры хозяина, чаще всего вызванных антибиотиками широкого спектра действия, иммуносупрессией или использованием ингибиторов протонной помпы. ¹⁷

Традиционное лечение ИКД заключалось в применении метронидазола или ванкомицина и отмене антибиотика-триггера; однако это оказывается все более неэффективным с частотой рецидивов до 50% и увеличением частоты фульминантного заболевания.Согласно публикации Академического медицинского центра в Амстердаме, опубликованной в 2013 году, ¹⁸ коррекция основного дисбактериоза с помощью трансплантации фекальной микробиоты (ТФМ) оказалась более эффективной и долговечной, чем антибиотикотерапия при рецидивирующей ИКД. Эти результаты были воспроизведены в Австралии. ¹⁹ Непосредственное влияние ТФМ на тяжелый псевдомембранозный колит показано на рис. 1.

Рисунок 1. Тяжелая инфекция Clostridium difficile у пациента в возрасте 79 лет.
А. Псевдомембранозный колит; B. Через пять дней после трансплантации фекальной микробиоты

Воспалительные заболевания кишечника

Язвенный колит и болезнь Крона представляют собой хронические воспалительные состояния неизвестной этиологии, основной патогенез которых, по-видимому, связан с множеством факторов, включая генетическую предрасположенность, экологические триггеры, измененную иммунную функцию и аномальные реакции микробиома кишечника. Дисбактериоз присутствует у пациентов с воспалительным заболеванием кишечника (ВЗК), характеризующимся более высоким соотношением патогенных и комменсальных бактерий, сниженным количеством бактерий в областях активного воспаления и областями бактериальной инвазии слизистой оболочки, что редко, если вообще наблюдается у здоровых людей. лица. ²⁰ Модуляция кишечных бактерий антибиотиками, такими как ципрофлоксацин и метронидазол, является признанным методом лечения для уменьшения послеоперационного рецидива болезни Крона, в то время как пробиотики могут быть эффективны при илеите, связанном с ВЗК, после колэктомии. ^21,22 В ряде исследований ТФМ рассматривалась как средство лечения ВЗК, но с противоречивыми результатами. Систематический обзор небольших серий случаев показал общую эффективность 36%, при этом пациенты с болезнью Крона чаще реагируют, чем пациенты с язвенным колитом. ²³ Австралийское рандомизированное плацебо-контролируемое исследование показало аналогичную эффективность при язвенном колите (44% ремиссия без стероидов) с использованием интенсивного протокола ТФМ с помощью колоноскопии и клизм в течение восьми недель. ²⁴ В двух дополнительных рандомизированных контролируемых исследованиях язвенного колита одно не показало преимуществ по сравнению с плацебо, ²⁵ , в то время как в другом ТФМ достигла ремиссии в 24% случаев по сравнению с 5% в группе плацебо. ²⁶

Синдром раздраженного кишечника

Синдром раздраженного кишечника (СРК) — распространенное заболевание, характеризующееся дискомфортом в животе и изменением характера стула при отсутствии основной органической причины.Патофизиология СРК остается неясной, но, вероятно, является многофакторной, с важными изменениями моторики и обработки пищи, висцеральной гиперчувствительностью, генетической предрасположенностью и изменениями микробиома кишечника. ²⁷ Лица с СРК с преобладанием диареи имеют дисбактериоз, характеризующийся более низкой экспрессией филотипа Clostridium thermosuccinogenes , ²⁸ , тогда как у лиц с СРК и запорами наблюдается увеличение количества бактерий, которые производят и используют лактат, что приводит к более высокому производству сульфидов и водорода. ²⁹ Кроме того, СРК, возникающий после гастроэнтерита, хорошо известен (постинфекционный СРК), и у больных наблюдаются изменения Bacteroidetes и Clostridia по сравнению со здоровыми людьми из контрольной группы. ³⁰ Изменение кишечных бактерий с помощью антибиотиков может помочь, а рифаксимин, наиболее хорошо изученный, показал умеренную симптоматическую пользу при СРК с преобладанием диареи. Это привело к его одобрению в США, но не в Австралии, для этого показания. ³¹ Систематический обзор и метаанализ показали, что пробиотики оказывают умеренное благотворное влияние на общую абдоминальную боль, вздутие живота и метеоризм при СРК, при этом комбинированные схемы более эффективны. ³² Из-за неоднородности исследований невозможно было выделить конкретные полезные штаммы или режимы дозирования. Было показано, что диета с низким содержанием FODMAP, направленная на снижение ферментируемых олигосахаридов, дисахаридов, моносахаридов и полиолов, эффективна при СРК, но сама по себе может ограничивать количество фекальных бактерий, включая полезные бактерии. ³³

Болезнь обмена веществ

Всемирная эпидемия ожирения и связанных с ним метаболических заболеваний в первую очередь связана с диетой и отсутствием физических упражнений; однако теперь ясно, что кишечный микробиом также является и другом, и врагом. Микробиота кишечника необходима для увеличения веса, вызванного диетой (рис. 2А), при этом мыши без микробов набирают минимальный вес, несмотря на диету с высоким содержанием жиров/сахаров, тогда как идентичные мыши, содержащие кишечные бактерии, страдают ожирением. ³⁴ Дисбиоз, характеризующийся снижением численности Bacteroidetes и увеличением количества Firmicutes, изменяющим их нормальное соотношение, вызывает ожирение у мышей и людей; ³⁵ Однако два недавних метаанализа объединенных исследований на людях не смогли выявить эти изменения в типах бактерий, при этом наблюдалось лишь незначительное снижение микробного разнообразия и богатства. ^36,37 Тем не менее, метаболические фенотипы ожирения и худобы у мышей могут передаваться через ТФМ (рис. 2B), ^38,39 процесс, в большей степени зависящий от микробиоты, чем от генетики (рис. 2С), поскольку ТФМ от однояйцевых близнецов не соответствует ожирению по-прежнему приводил к передаче худощавого или тучного фенотипа у мышей. ⁴⁰ Совместное размещение двух групп, в которых мыши поедали фекалии друг друга, привело к фенотипу худобы, который, как предполагается, был связан с повторной инвазией специфических Bacteroidetes в мышей с ожирением. ⁴⁰ В недавнем исследовании у пациентов с метаболическим синдромом ТФМ от худощавого донора улучшила чувствительность к инсулину всего за шесть недель, эффект отчасти обусловлен увеличением количества кишечных бактерий, продуцирующих бутират. ⁴¹

Рисунок 2. Ожирение и микробиом
A. Безмикробные мыши устойчивы к ожирению, вызванному диетой; B. Метаболический фенотип передается через трансплантацию микробиоты, при этом худые доноры производят худых мышей, а доноры с ожирением производят мышей с ожирением; С.Трансплантация микробиоты от однояйцевых близнецов, диссонирующих по ожирению, также передает метаболический фенотип стерильным мышам, однако при совместном размещении преобладает худощавый фенотип; GF, без микробов; L, обедненный N, нормальный; О, тучный

Неалкогольная жировая болезнь печени

В дополнение к изменениям микробиоты при ожирении изменения кишечных бактерий при неалкогольной жировой болезни печени (НАЖБП) и неалкогольном стеатогепатите (НАСГ) связаны с транслокацией кишечных бактерий, что приводит к увеличению доставки липополисахаридов, свободных жировых кислоты и другие токсины непосредственно в печень из воротной вены. ⁴² Кроме того, пациенты с НАСГ имеют большее количество бактерий семейства Escherichia , группы, которая ферментирует углеводы и производит эндогенный этанол. ⁴³ Это приводит к повышению уровня алкоголя на периферии, возможному кофактору в патогенезе жировой болезни печени. В настоящее время проводится ряд исследований для оценки роли пробиотиков, FMT или других процедур, модулирующих кишечник, у пациентов с НАЖБП.

Изменение микробиома кишечника

Трансплантация фекальной микробиоты

FMT впервые был использован в современной медицине в 1958 году, когда четыре пациента с псевдомембранозным колитом были вылечены фекальной клизмой. ⁴⁴ Существуют данные о роли FMT в рецидивирующей ИКД, а также появляются данные о ее роли в ВЗК и метаболических заболеваниях. ¹⁵ Процесс, лежащий в основе FMT, относительно прост. Доноры проверяются на наличие всех известных патогенов, передающихся через кровь и стул, и должны быть здоровыми, стройными и не иметь каких-либо заболеваний, потенциально передающихся кишечными бактериями. Пожертвованный стул смешивают со стерильным физиологическим раствором/глицерином и могут давать в свежем или замороженном виде. Стул, замороженный при –80°C, жизнеспособен и эффективен в течение как минимум шести-девяти месяцев. ¹⁹ Донорский стул может быть доставлен через назоеюнальный зонд или в слепую кишку при колоноскопии. В целом процедура безопасна; общие побочные эффекты включают вздутие живота, диарею и субфебрилитет, которые проходят в течение 48 часов. ¹⁵ Серьезные явления, связанные с эндоскопической процедурой, такие как перфорация кишечника и аспирация, встречаются редко. Долгосрочные эффекты ТФМ неизвестны и, вероятно, могут включать индукцию хронических заболеваний, связанных с изменениями в кишечных бактериях, или передачу неизвестных в настоящее время инфекционных агентов. ¹⁵ Исследователи из банка стула OpenBiome в США, среди прочего, разработали фекальную капсулу, которая может сделать эту изменяющую кишечник терапию более доступной в будущем.

Антибиотики

Воздействие на кишечные бактерии антибиотиками, такими как ципрофлоксацин и метронидазол, уже некоторое время используется для лечения кишечных расстройств, таких как болезнь Крона; однако их способность уменьшать количество патогенных грамотрицательных бактерий, паразитов и анаэробов достигается за счет снижения разнообразия и устойчивости бактерий, а также ИКД. ¹² В последнее время малоабсорбируемый антибиотик широкого спектра действия рифаксимин получил признание благодаря своей эффективности при печеночной энцефалопатии и СРК и низкому потенциалу развития бактериальной резистентности. ¹²

Пробиотики

Пробиотики определяются Всемирной организацией здравоохранения как «живые бактерии или дрожжи, которые при введении в адекватных количествах приносят пользу для здоровья потребителя». Однако доказательства их эффективности неоднозначны. Наиболее хорошо изученными бактериальными пробиотиками являются виды Lactobacillus , Bifidobacterium и Lactococcus , а наиболее часто используемыми дрожжами являются Saccharomyces boulardii . ¹² Пробиотики временно колонизируют кишечник и могут оказывать благотворное воздействие за счет усиления естественного кишечного барьера (как физического, так и слизистого слоя), стимуляции секреции IgA, подавления продукции воспалительных цитокинов и прямого антагонизма с патогенами. ⁴⁵ На основании мета-анализов рандомизированных контролируемых исследований пробиотики умеренно эффективны для уменьшения общих симптомов СРК (число, необходимое для лечения [NNT] = 8), ³² и для уменьшения антибиотикоассоциированной диареи у детей в возрасте от одного месяца до 18 лет (NNT = 10) ⁴⁶ и взрослые в возрасте до 64 лет (относительный риск = 0.47), но не у пожилых людей. ⁴⁷ Продолжительность использования пробиотиков (5–21 день) не влияла на положительный эффект, и в разной степени результаты были штаммоспецифичными; наибольший эффект был получен от Lactobacillus и S. boulardii . ⁴⁷ При других заболеваниях результаты могут зависеть от препарата, поскольку только дорогостоящий комбинированный пробиотик VSL#3 (восемь видов Lactobacillus , Bifidobacterium и Streptococcus ; 130 долларов США) эффективен для профилактики и лечения резервуарного илеита у ВЗК после колэктомии, ²² и Lactobacillus casei и смешанный исследовательский препарат L. acidophilus , L. delbruecki var bulgaris , Streptococcus thermphilus и B. bifidu в течение пяти дней, уменьшая продолжительность и тяжесть симптомов у детей с острой инфекционной диареей. ⁴⁸ Доказательства того, что пробиотики помогают при внекишечных заболеваниях или помогают поддерживать общее состояние здоровья, остаются спорными. Большинство коммерческих пробиотиков состоят из смеси штаммов, эффективность которых обычно приписывается конкретным штаммам и их количеству. Однако недавнее исследование показало, что только 58% из них имеют правильную маркировку. ⁴⁹ Кроме того, существуют проблемы с сохранением жизнеспособности пробиотиков во время хранения и их способностью противостоять кислоте и желчи, чтобы достичь толстой кишки, где может произойти колонизация. ⁵⁰ В то время как пробиотики кажутся безопасными для большинства людей, сообщения о случаях указывают на возможность оппортунистической инфекции из-за влияния на комменсальную микрофлору, особенно у критически больных взрослых и новорожденных, у которых иногда сообщалось о бактериемии и фунгемии после введения Lactobacillus rhamnosus и S. буларди . ⁵¹ Крупные рандомизированные исследования не подтвердили повышенный риск; тем не менее, при использовании пробиотиков рекомендуется оценка риска и пользы.

Заключение

Микробиом кишечника является сложной и важной частью нашего тела, которая обеспечивает жизненно важную поддержку нормальной метаболической функции и защиту от болезней. Дисбактериоз связан с множественными болезненными состояниями и является целью для терапии и будущих исследований.

Благодарности

Авторы выражают благодарность г-ну Эндрю Барнсу за помощь в оформлении рисунка 2.

Авторы

Mayenaaz Sidhu MBBS, продвинутый стажер-гастроэнтеролог, больница Вестмид, Сидней, Новый Южный Уэльс

Дэвид ван дер Поортен Бакалавр медицинских наук, MBBS (с отличием), доктор философии FRACP, штатный специалист-гастроэнтеролог, больница Вестмид, Сидней, Новый Южный Уэльс, и клинический адъюнкт-профессор Сиднейского университета, Сидней, Новый Южный Уэльс. [email protected]

Конкурирующие интересы: Нет

Происхождение и экспертная оценка: по заказу, внешняя экспертная оценка.

Является ли дисбактериоз кишечника причиной персистирующей диареи?

ЯВЛЯЕТСЯ ЛИ УСТОЙЧИВАЯ ДИАРЕЯ ИНФЕКЦИОННЫМ ЗАБОЛЕВАНИЕМ…

Персистирующая диарея — это особая форма заболевания, определяемая как эпизод продолжительностью более 14 дней (свыше 30 дней он называется «хронической диареей»). Был определен уровень смертности, связанный с персистирующей диареей (54% всех смертей, вызванных диареей), но ее патогенез до сих пор плохо изучен: это прогрессирование острого эпизода или самостоятельное заболевание? При обзоре литературы выявлено, что персистирующая диарея большинством исследователей рассматривается как инфекционное заболевание, связанное с колонизацией кишечника болезнетворными бактериями, будь то после острого или другого эпизода. ²⁰ Этой колонизации может способствовать недоедание и другие факторы (особенно воздействие антибиотиков), способные вызвать дисбиоз кишечника.

… ИЛИ ЭТО ИЗ-ЗА МИКРОБНОГО ДИСБИОЗА?

Среди других этиологических гипотез набирает обороты теория бактериальной вспышки. Он родился из наблюдения, что обильное присутствие комменсальных бактерий, особенно Escherichia coli , нарушает всасывание лактозы. Соединительный дисбактериоз кишечника, уровень Е.coli и постоянная диарея могут дать несколько ключей к выяснению ее патогенеза. В этой связи некоторые пробиотики показали свою эффективность в снижении продолжительности острой диареи и персистирующей диареи у детей. ^{21, 22}

ВЫЯВЛЕННЫЕ ФАКТОРЫ РИСКА

Анализ научной литературы позволил составить проект модели патогенеза заболевания. К первой категории факторов риска относятся очень ранний возраст (младше 1 года, риск х 3), недоедание (риск х 2) и низкая масса тела при рождении (риск х 1).8). Вторая категория включает инфекцию в предыдущем месяце (риск x 2) и персистирующую диарею в анамнезе (риск x 3–6). Третья категория связана с привычками питания (диета, заменители грудного молока. ..), которые могут увеличить риск в 4 раза. Также были выявлены другие факторы, включая прием антибиотиков. Потенциальная этиология и подтвержденные факторы риска подчеркивают важность тесного сотрудничества между педиатрами, гастроэнтерологами, диетологами и биологами.Междисциплинарность может помочь получить более глубокое понимание взаимосвязей между инфекцией, диетическими привычками и патогенными и комменсальными микроорганизмами.

Синдром избыточного бактериального роста: предыстория, патофизиология, эпидемиология

Ассоциированный с кишечником цГМФ опосредует колит и дисбактериоз в мышиной модели активирующей мутации в GUCY2C | Журнал экспериментальной медицины

Активирующие мутации в рецепторе гуанилилциклазы С (GC-C), мишени желудочно-кишечных пептидных гормонов гуанилина и урогуанилина, и бактериальных термостабильных энтеротоксинов вызывают раннюю диарею и хроническое воспалительное заболевание кишечника (ВЗК). GC-C регулирует секрецию ионов и жидкости в кишечнике посредством продукции цГМФ и активации цГМФ-зависимой протеинкиназы II. Мы характеризуем новую модель мыши, содержащую активирующую мутацию в Gucy2c , эквивалентную мутации, наблюдаемой в пораженной норвежской семье. Мыши-мутанты продемонстрировали повышенный уровень цГМФ в кишечнике и повышенное содержание воды и натрия в фекалиях. Базальный и линаклотид-опосредованный тонкокишечный транзит был выше у мутантных мышей, и они были более восприимчивы к индуцированному DSS колиту.Анализы фекального микробиома и экспрессии генов в ткани толстой кишки выявили дисбиоз, активацию генов, стимулируемых интерфероном, и неправильную регуляцию генов, связанных с ВЗК у человека и моделями колита у животных. Таким образом, эта новая мышиная модель обеспечивает молекулярное понимание множественных ролей цГМФ эпителиальных клеток кишечника, кульминацией которых является дисбактериоз и индукция воспаления в кишечнике.

Описаны моногенные дефекты кишечного эпителия, способствующие развитию воспалительного заболевания кишечника (ВЗК) у детей, которые с трудом поддаются современным схемам лечения (Leung and Muise, 2018; Nambu and Muise, 2021). Среди генов, связанных с очень ранним началом ВЗК, есть мутации в гене рецептора гуанилатциклазы С ( GUCY2C ; Bose et al., 2020; Crowley et al., 2020). Рецептор, кодируемый этим геном, гуанилатциклаза С (GC-C), является мишенью для желудочно-кишечных гормонов гуанилина (кодируется GUCA2A ) и урогуанилина (кодируется GUCA2B ; Arshad and Visweswariah, 2012; Basu et al. , 2010). GC-C преимущественно экспрессируется вдоль желудочно-кишечного тракта, где он регулирует транспорт жидкости и ионов через эпителий кишечника (Waldman and Camilleri, 2018).Связывание лиганда с GC-C приводит к повышению уровня 3’5′-циклического гуанозинмонофосфата (цГМФ) в клетках кишечника и активации цГМФ-зависимой протеинкиназы II (PKGII; Lohmann et al., 1997). PKGII фосфорилирует регулятор трансмембранной проводимости при муковисцидозе (CFTR) и натрий-водородный обменник, NHE3 (Chen et al., 2015; Golin-Bisello et al., 2005). Фосфорилирование CFTR увеличивает секрецию ионов хлорида и бикарбоната, в то время как фосфорилирование NHE3 ингибирует поглощение натрия эпителиальными клетками кишечника (IEC; Chen et al. , 2015). Последующий осмотический дисбаланс в IEC вызывает отток воды из клетки, необходимой для гидратации слизи и прохождения пищевого комка по кишечнику (Arshad and Visweswariah, 2013).

Семейный GUCY2C Синдром диареи (FGDS) был впервые описан в норвежской семье, где более 30 человек сообщили о диарее различной степени тяжести, начиная с младенчества (Fiskerstrand et al., 2012). Аутосомно-доминантная мутация, картированная в GUCY2C , привела к замене Ser840 на изолейцин, присутствующий в домене гуанилатциклазы.Мутация привела к гиперактивации GC-C, вследствие чего мутантный рецептор вызывал более высокие уровни цГМФ при стимуляции лигандами. Эти повышенные уровни цГМФ, по-видимому, сверхактивируют нижестоящую передачу сигналов, что приводит к увеличению секреции жидкости и ионов и диарее (Fiskerstrand et al., 2012). Впоследствии мы охарактеризовали еще четыре активирующие мутации у неродственных детей в Европе, у которых также была тяжелая и изнуряющая диарея, обнаруживаемая внутриутробно как сильно вздутый живот у плода (Müller et al. , 2016). Мутации (Lys507Glu, Leu775Pro, Arg792Ser и Asn850Asp) присутствовали в различных доменах рецептора, включая домен гомологии киназы, линкерную область и каталитический домен (Bose et al., 2020; Mishra et al., 2018). ). Пациенты, страдающие ФГДС, и дети с мутациями de novo в GUCY2C , помимо диареи, имеют симптомы, подобные болезни Крона (БК), и колит (Fiskerstrand et al., 2012; Müller et al., 2016).

GC-C является мишенью для бактериальных термостабильных энтеротоксинов (СТ), продуцируемых энтеротоксигенной Escherichia coli , одной из основных причин водянистой диареи в развивающихся странах (Schulz et al., 1990). Одобренные Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов препараты линаклотид и плеканатид, которые используются для лечения запоров, содержат богатую цистеином основную последовательность ST или урогуанилина, соответственно, и активируют GC-C, чтобы индуцировать выработку цГМФ (Shah et al. , 2018) . Тем не менее, нет доступных лекарств для облегчения диареи, опосредованной GC-C, хотя молекулы, которые могут ингибировать белки ниже по течению от GC-C, кажутся многообещающими (Bijvelds et al., 2018).

Мышей с нокаутом GC-C изучали в течение нескольких лет (Schulz et al., 1997). Хотя у них нет явных признаков запора, отчеты указывают на то, что они демонстрируют неврологические симптомы (Brierley, 2012; Mann et al., 2019), а подавление опосредованной урогуанилином передачи сигналов GC-C у мышей приводит к ожирению (Valentino et al., 2011). Мы продемонстрировали, что мыши GC-C ^-/- более восприимчивы к пероральной инфекции Salmonella enterica enterica serovar Typhimurium (Majumdar et al., 2018). Сообщалось об инактивирующих мутациях в GUCY2C , у младенцев с мекониевой непроходимостью при рождении.Эти дети были результатом кровного родства с мутациями, присутствующими в гомозиготном состоянии (Romi et al. , 2012; Smith et al., 2015; Woods et al., 2019).

Отсутствие моделей диарейных заболеваний, опосредованных гиперактивным GC-C, для исследования связи между GC-C, цГМФ и воспалением кишечника побудило нас разработать мутантную мышь, содержащую мутацию в Gucy2c , эквивалентную мутации S840I, обнаруженной в норвежская семья.Здесь мы подтверждаем эту модель с точки зрения увеличения частоты прохождения водянистых фекалий, регуляции активности Cftr и Nhe3 in vivo и повышенной восприимчивости этих мышей к колиту. Анализ фекального микробиома у мутантных мышей и глобальной экспрессии генов толстой кишки предоставил основное объяснение воспаления, наблюдаемого у пациентов с активирующими мутациями GC-C. Следовательно, эта мутантная мышь служит доклинической моделью секреторной диареи, опосредованной GUCY2C , связанной с ВЗК, и более распространенного инфекционного диарейного заболевания, вызванного активацией GC-C.

Уровни транскриптов Gucy2c и урогуанилина ( Guca2b ) были одинаковыми в подвздошной кишке и толстой кишке мышей дикого типа и мышей S839I, в то время как уровни гуанилина ( Guca2a ) были значительно ниже у мышей S839I (рис. 2А). Кишечник является основным местом синтеза гуанилина и урогуанилина; следовательно, уровни пропептидов в сыворотке отражают уровни, продуцируемые в кишечнике.Однако мы не наблюдали значительного снижения уровня пропептидного гормона в сыворотке мышей S839I (рис. S3). Вестерн-блоттинг показал, что экспрессия GC-C была сходной у мышей дикого типа и мышей S839I (рис. 2В), как и связывание ST с мембранами, полученными из эпителиальных клеток (рис. 2С).

Было высказано предположение, что присутствие GC-C с гиперактивирующими мутациями в кишечнике пациентов приводит к повышению внутриэпителиального клеточного цГМФ в ответ на гуанилин и/или урогуанилин (Fiskerstrand et al., 2012; Мюллер и др., 2016). Как показано на рис. 2D, стационарные уровни цГМФ в эпителиальных клетках были примерно в 5-10 раз выше у мышей S839I. Таким образом, мутантный мышиный GC-C действительно вызывал больший ответ с точки зрения продукции цГМФ в ответ на эндогенные лиганды.

Пациенты с ФГДС продемонстрировали задержку прохождения кишечного содержимого из-за регургитации содержимого кишечника в тонкую кишку (von Volkmann et al., 2017, 2016). Мы оценили кишечный транзит у мышей дикого типа и мышей S839I, но не обнаружили никаких изменений у мышей S839I (рис. 2E).

У пациентов с активирующими мутациями в GUCY2C отмечается многократный водянистый стул (Fiskerstrand et al., 2012). Мы отслеживали количество фекальных гранул, переданных мышами за 10 минут, и заметили, что мыши S839I передали большее количество фекальных гранул (рис. 2F). Содержание воды в фекалиях, производимых мышами S839I, было выше (рис.2 Г). Эти фенотипы отражают симптомы диареи, наблюдаемые при FGDS, что позволяет предположить, что мышей S839I можно использовать для понимания процессов, которые регулируют частые эпизоды опорожнения кишечника, наблюдаемые у пациентов с FGDS.

Повышенные уровни цГМФ в IEC стимулируют повышенную секрецию хлоридов и бикарбонатов посредством CFTR после фосфорилирования цГМФ-зависимой протеинкиназой G II (рис. 3А; Golin-Bisello et al., 2005; Лин и др., 1992). Кроме того, ингибирующее фосфорилирование натрий-водородного обменника NHE3 (SLC9A3) приводит к уменьшению импорта ионов натрия в клетки и последующему увеличению содержания натрия в просвете и фекалиях (Chen et al., 2015). Уровни транскрипта PrkgII были снижены в толстой кишке мышей S839I, как и уровень белка (рис. S3B), что позволяет предположить, что некоторые эффекты цГМФ в толстой кишке могут быть независимыми от PKGII. В то время как транскрипты Cftr были одинаковыми как у мышей дикого типа, так и у мышей S839I, уровни Nhe3 были ниже как в подвздошной, так и в толстой кишке у мышей S839I (фиг.3 Б).

Мы измерили скорость транзита по тонкому кишечнику у мышей дикого типа и мышей S839I. Опорожнение желудка (GE) было слегка усилено у мышей дикого типа после лечения ингибитором Cftr, но незначительно, хотя сообщается, что GE усиливается у пациентов с CFTR (Collins et al., 1997). Никаких изменений в GE не наблюдалось у мышей S839I (рис. 3C, верхняя панель) ни в присутствии, ни в отсутствие ингибитора Cftr. Однако степень миграции красителя в тонком кишечнике, измеренная по геометрическому центру (ГЦ), была значительно выше у мышей S839I (рис.3С, нижняя панель), обработанная только носителем. При введении ингибитора Cftr наблюдалось увеличение GC у мышей дикого типа (рис. 3C, нижняя панель), что согласуется с парадоксальным наблюдением о том, что у пациентов с кистозным фиброзом увеличивается транзит через верхние отделы тонкой кишки (Hedsund et al., 2012). Важно отметить, что резкое снижение GC наблюдалось у мышей S839I, получавших ингибитор Cftr (рис. 3C, нижняя панель), демонстрируя, что увеличение скорости базального транзита у мышей S839I было почти исключительно связано с активацией CFTR.

Затем мы вводили линаклотид для более мощной активации GC-C (Bryant et al., 2010). GE был выше у мышей S839I (рис. 3D, верхняя панель), когда мышам вводили через зонд только буфер, в отличие от того, что наблюдалось у мышей, получавших через зонд носитель, используемый для растворения ингибитора Cftr (рис. 3C, верхняя панель) . Сообщалось об экспрессии GC-C и урогуанилина в желудке млекопитающих, хотя и на низких уровнях (Date et al., 1999; London et al., 1997), а повышенный уровень ГЭ может быть следствием гиперактивности ГК-Х в желудке. При лечении линаклотидом GC увеличивался как у мышей дикого типа, так и у мышей S839I (рис. 3D, нижняя панель). Однако транзит был значительно выше у мышей S839I. Следовательно, опосредованная лигандом активация гиперактивного GC-C вызывает более быструю миграцию вниз по тонкому кишечнику.

Мы наблюдали снижение транскрипции Nhe3 как в подвздошной, так и в толстой кишке мышей S839I по сравнению с мышами дикого типа (рис.3 Б). Мы отслеживали экспрессию Nhe3 и наблюдали значительное снижение экспрессии белка как в подвздошной, так и в толстой кишке мышей S839I (рис. 3E). Повышенный отток бикарбоната из клетки из-за повышенных уровней цГМФ и активности Cftr, наряду со сниженной экспрессией Nhe3, должен повышать уровень натрия и рН просвета кишечника. В соответствии с этим pH просвета в подвздошной кишке мышей S839I был выше, чем у мышей дикого типа (фиг. 3F). Однако значительное увеличение просветного натрия наблюдалось только в толстой кишке (рис.3G) и коррелировало с более высоким содержанием натрия в кале (рис. 3H). Это говорит о том, что Nhe3 может не вносить основной вклад в импорт натрия в тонкой кишке. Однако подавление Nhe3 в сочетании с ингибированием его активности из-за повышенных уровней цГМФ в толстой кишке проявляется в повышенной экскреции натрия с фекалиями, как это наблюдается у детей с гиперактивирующими мутациями в GC-C, у которых наблюдается врожденная натрий-секреторная диарея (Müller и др., 2016).

Мы оценили, в какой степени Nhe3 ингибируется повышенными уровнями цГМФ в кишечнике у мышей S839I при введении тенапанора, специфического ингибитора Nhe3.В то время как GE снова был выше у мышей S839I, которым вводили только носитель (рис. 3I, верхняя панель), никакого дальнейшего увеличения не наблюдалось как у мышей дикого типа, так и у мышей S839I после введения тенапанора. Однако, в соответствии с более ранними исследованиями (McHugh et al., 2018), введение ингибитора мышам дикого типа увеличивало GC (рис. 3 I, нижняя панель). У мышей S839I уже повышенный базальный транзит дополнительно усиливался при лечении тенапанором (рис. 3I). Мы связываем это повышенное увеличение транзита по тонкому кишечнику с преобладающими более низкими уровнями Nhe3, присутствующими у мышей S839I, и эффективным ингибированием тенапанором.

Пациенты, несущие активирующие мутации в GUCY2C , имеют различные степени воспаления в кишечнике (например, эзофагит, синдром раздраженного кишечника [СРК], БК и язвенный колит [ЯК]; Fiskerstrand et al., 2012; Müller et al. , 2016). Введение DSS мышам вызывает гибель эпителиальных клеток и нарушает барьерную функцию (Wirtz et al., 2017). Мы вводили DSS мышам и наблюдали за потерей веса и повреждением толстой кишки.Мыши S839I были более восприимчивы к DSS, о чем свидетельствует большая потеря веса (рис. 4А, левая панель) и более высокий индекс активности заболевания (рис. 4А, правая панель). Укорочение толстой кишки наблюдалось как у мышей дикого типа, так и у мышей S839I после лечения DSS (рис. 4В).

Уровни транскриптов GC-C и гуанилина снижены в биоптатах, взятых у людей, больных ЯК и БК (Brenna et al., 2015; Lan et al., 2016). После индукции колита с помощью DSS уровни транскриптов Gucy2c и Guca2a были снижены как у мышей дикого типа, так и у мышей S839I (фиг.4 С).

Гистологическая оценка толстой кишки у мышей дикого типа и мышей S839I не выявила различий в архитектуре толстой кишки или изменений в глубине крипт, что указывает на то, что обновление IEC было сходным у мышей S839I (рис. S3C). После лечения DSS у мышей S839I наблюдалась большая степень абсцессов крипт и разрушения слизистой оболочки толстой кишки (рис. 4D). Одновременно с большим повреждением слизистой оболочки фекальный липокалин, чувствительный маркер воспаления в кишечнике (Chassaing et al., 2012), был повышен у мышей S839I (рис. 4Е). В совокупности наши результаты показывают, что мыши S839I, несущие активирующую мутацию в Gucy2c , обнаруживают роль цГМФ в регуляции функции кишечника и повышенной восприимчивости толстой кишки к повреждению в модели колита. Примечательно, что мыши с нокаутом GC-C устойчивы к DSS-индуцированному колиту (Steinbrecher et al., 2011).

Чтобы изучить глобальные изменения, наблюдаемые в кишечнике из-за присутствия гиперактивного GC-C, мы использовали беспристрастные подходы, охарактеризовав фекальный микробиом и транскриптом в ткани толстой кишки.

Изменение pH и концентрации ионов натрия в просвете кишечника может привести к дисбактериозу, который может предрасполагать к колиту. Поэтому мы провели секвенирование ампликона гена 16S рибосомной РНК (рРНК) образцов фекалий, собранных у мышей дикого типа и мышей S839I. Неограниченная ординация с помощью анализа основных компонентов с показателями несходства Брея-Кертиса показала четкое разделение между двумя наборами мышей (анализ сходства, значение P = 0.001; Рис. 5 А). Наблюдалась воспроизводимая тенденция к снижению альфа-разнообразия (P <0,1) в фекальном микробиоме мышей S839I (рис. 5B), а графики относительной численности продемонстрировали различия на уровне типов и родов (рис. 5C).

Повышенное количество потенциальных условно-патогенных микроорганизмов ( Anaeroplasma , Desulfovibrio , Mucispirillum и Paraprevotella ) наблюдалось у S839I (рис.5 Д). Представители рода Paraprevotella связаны с БК толстой кишки и продуцируют янтарную кислоту, повышенные уровни которой, как сообщается, связаны с дисбактериозом микробиома и воспалением кишечника у пациентов с ВЗК и животных моделей хронического колита (Macias-Ceja et al., 2019; Уолтерс и др., 2014). Род Mucispirillum также значительно выше у мышей S839I (рис. 5D). Воздействие на мышей Nod2 ^−/− Cybb ^−/− C57BL/6 грамотрицательного патобионта грызунов, Mucispirillum schaedleri, , вызывает развитие CD-подобного колит (Caruso et al., 2019). Desulfovibrio был значительно обогащен у мышей S839I, как видно из микробиома слизистой оболочки толстой кишки и фекального микробиома пациентов с ЯК и БК (Rowan et al., 2010).

Уровни защитных бактерий, таких как Colidextribacter , Dorea (продуценты короткоцепочечных жирных кислот), Dubosiella и Lactobacillus (обладающие противовоспалительными свойствами), были значительно снижены у мышей S839I (рис.5 Д). Colidextribacter и Dorea относятся к Clostridiales кластера IV и Clostridium кластера XIVa в типе Firmicutes, соответственно. Известно, что эти таксоны продуцируют жирные кислоты с короткой цепью, и, как сообщается, их меньше в образцах биопсии подвздошной кишки и фекалиях, выделенных от пациентов с БК (Nagao-Kitamoto and Kamada, 2017). Штаммы Lactobacillus восстанавливают комменсалов и гомеостаз кишечника при кишечных расстройствах (Blaser, 2014).Следовательно, более низкая распространенность этих родов у мышей S839I предполагает, что эти животные могут быть более восприимчивы к индуцированному окружающей средой колиту и воспалению в кишечнике, как сообщалось у пациентов с FGDS (Fiskerstrand et al., 2012).

Анализ предполагаемых функциональных последствий различий в количестве таксонов между мышами (Narayan et al., 2020) показал значительные различия в 28 путях KEGG (таблица S3).Те, которые связаны с иммунитетом хозяина, были обогащены у мышей S839I и включали передачу сигналов NOD-подобного рецептора, процессинг и презентацию антигена, передачу сигналов IL17 и дифференцировку клеток Th27 (рис. 5 F). Пути KEGG для бактериального хемотаксиса и сборки жгутиков, связанные с подвижностью клеток в микробиоме, были значительно выше у мышей S839I (таблица S3). Пути, которые были снижены, были связаны с деградацией полициклических ароматических углеводородов, что позволяет предположить, что мыши S839I могут иметь более высокие уровни этих генотоксичных соединений в кишечнике, что может предрасполагать их к канцерогенезу; напротив, пути, связанные с химическим канцерогенезом, были уменьшены (рис.5 Ф).

Таким образом, значительные различия в микробиоме мышей S839I напоминают изменения, наблюдаемые у пациентов с ВЗК и ФГДС (Tronstad et al., 2017), и более свежие данные, касающиеся фекальной микробиоты, наблюдаемые у пациентов с микроскопическим колитом (Hertz et al., 2021). . Следовательно, лежащие в основе нарушения функции эпителия толстой кишки и/или дисбаланс секреции жидкости и ионов из-за активирующей мутации Gucy2c оказывают сильное влияние на кишечную флору.

Мы сравнили глобальные изменения экспрессии генов в толстой кишке мышей дикого типа и мышей S839I с помощью анализа секвенирования РНК, предположив, что характер экспрессии генов может объяснить восприимчивость к воспалению, наблюдаемому у пациентов. Мы идентифицировали несколько дифференциально регулируемых генов, большинство из которых подавляется (рис. 6А). Дифференциально экспрессируемые транскрипты с скорректированной частотой ложных открытий (FDR) <0.05 и log 91 181 2 91 182 кратное изменение (FC) менее -2 и >1,5 дали 645 генов с пониженной регуляцией и 101 ген с повышенной регуляцией (рис. 6А). Анализ путей изобретательности (IPA) выявил канонические пути, которые нарушены у мышей S839I. Поразительно, но наблюдались повышенные уровни большого количества генов, регулируемых передачей сигналов IFN (Barrat et al., 2019), называемых IFN-стимулированными генами (ISG), включая Ifit1 , Ifit3 , Ifitm3 , Tap1. , Irf7 , Isg15 , Ido1 и Socs1 (рис.6 Б). Мы подтвердили уровни экспрессии этих генов с помощью RTqPCR и обнаружили, что экспериментально наблюдаемое увеличение уровней транскриптов согласуется с наблюдаемым в анализе РНК-seq (рис. 6C).

Затем мы искали доказательства измененной регуляции генов IFN типа I, типа II и типа III, которые могли бы управлять экспрессией ISG. Члены семейств IFN1 и IFNIII не были обнаружены в РНК-seq, а транскрипты также не были идентифицированы с помощью RTPCR (данные не показаны).Однако Ifng можно было обнаружить с помощью RTPCR (фиг. 6C), и уровни были выше у мышей S839I.

Многие из ISG являются мишенями STAT1, включая Socs1 , который является негативным регулятором передачи сигналов цитокинов. Stat1 повышал уровень экспрессии у мышей S839I, как и Socs1 , что дополнительно подтверждало результаты, полученные при анализе секвенирования РНК (фиг. 6C). Затем мы искали экспрессию Stat1 и его фосфорилированных форм с помощью вестерн-блоттинга с использованием экстрактов, приготовленных из цельной ткани толстой кишки.Значительное увеличение общих уровней Stat1, наряду с фосфорилированным Stat1 (по Ser727 и Tyr701), наблюдалось у мышей S839I. Также наблюдалось увеличение общего Stat1, возможно, поскольку Stat1 самостоятельно регулирует собственную транскрипцию (Fig. 6D). Значительное увеличение общего STAT1, возможно, также может быть следствием прямой индукции транскрипции в ответ на повышенные уровни цГМФ. Кроме того, уровни белков Isg15 (рис. 6E), Tap1 (рис. 6F) и Ido1 (рис. 6G), которые все регулируются Stat1 и чьи транскрипты были повышены у мышей S839I (рис.6 С), были увеличены. Примечательно, что повышенная активность STAT1 связана с тяжестью заболевания у пациентов с ВЗК (Cordes et al., 2020; Schreiber et al., 2002).

Учитывая увеличение общего Stat1, наблюдаемое у мышей S839I, возможно, что фракция может оставаться нефосфорилированной. Ранее сообщалось об индукции ISG, опосредованной нефосфорилированным STAT1, как части трехчастного транскрипционного комплекса STAT1, STAT2 и IRF9, в клеточных линиях толстой кишки (Wang et al., 2017). Действительно, анализ секвенирования РНК показал, что Stat2 и Irf9 также повышались у мышей S839I. Предполагается, что экспрессия ISG с помощью нефосфорилированного STAT1 является первичным механизмом для преодоления микробной инфекции (Cheon et al., 2013).

Повышенная экспрессия ISG у мышей S839I может быть причиной исходной патологии и последующей предрасположенности к тяжелому колиту, о котором мы сообщаем здесь (рис.4). Поэтому мы использовали функцию Analysis Match в IPA, чтобы сравнить измененную экспрессию генов, наблюдаемую у мышей S839I, с таковой у мышей после лечения DSS. Значительное количество генов продемонстрировало одинаковую тенденцию регуляции у мышей S839I и мышей, получавших DSS (рис. 7), что указывает на то, что признаки воспаления после лечения DSS, по-видимому, уже изменились у мышей S839I. IPA предсказывает z-показатель активации или ингибирования экспрессии генов, контролируемых вышестоящими регуляторами. Здесь снова общие вышестоящие регуляторы с сопоставимыми z-показателями активации были обнаружены у мышей S839I и у мышей с колитом, индуцированным DSS (рис.7).

Наконец, вышестоящие регуляторы в нашем наборе данных показали прогнозируемые z-показатели, аналогичные наблюдаемым в биопсиях толстой кишки пациентов с колитом (Zhao et al., 2015; рис. 7), подтверждая, что эти мыши S839I действительно могут служить доклинической моделью для изучения воспаление кишечника у людей, опосредованное гиперактивными мутациями GUCY2C (Crowley et al., 2020).

Здесь мы описываем новую доклиническую модель для понимания основных биологических механизмов, наблюдаемых у пациентов с редкими мутациями в GUCY2C .Наши результаты показывают, что гиперактивация GC-C приводит к потере общего гомеостаза, дисбалансу ионов жидкости, дисбактериозу кишечной микробиоты и предрасположенности к колитам. Поскольку появляется все больше свидетельств того, что межорганная коммуникация является основой общего фенотипа, наблюдаемого в организмах, а пациенты с FGDS имеют активирующую мутацию во всех тканях, где экспрессируется GC-C, мы решили разработать модель нокина всего тела.

Повышенный уровень цГМФ в МЭК у мышей S839I (фиг.2D) приводит к увеличению транзита через тонкий кишечник за счет активации Cftr (рис. 3, C и D). Ингибирование Nhe3 тенапанором также приводило к усилению транзита (Fig. 3I). Значительное снижение уровня транскрипта, а также уровня белка Nhe3 наблюдалось у мышей S839I (рис. 3, B и E). Поскольку более низкая экспрессия Nhe3 должна снижать поглощение Na ⁺ эпителиальными клетками, наблюдалось увеличение просвета натрия в толстой кишке и фекалиях, но не в подвздошной кишке (Fig. 3, G и H). Nhe3 ^-/- у мышей наблюдалась диарея с нарушением всасывания жидкости, повышенным содержанием ионов натрия в просвете кишечника и защелачиванием просвета кишечника (Schultheis et al., 1998; Xue et al., 2020), как мы видим здесь (рис. 3 F). Хотя сообщалось, что Nhe3 регулирует уровни натрия в тканях подвздошной кишки мышей (Murtazina et al., 2011), более поздние наблюдения показывают, что Nhe3 играет скромную роль в потоках натрия в дистальном отделе подвздошной кишки (Stephens et al., 2021). Следовательно, могут существовать дополнительные механизмы, с помощью которых поддерживается уровень натрия в подвздошной кишке.

Инактивирующие мутации в NHE3 приводят к врожденной натриевой диарее из-за мальабсорбции натрия (Janecke et al., 2015). Измененное и дефектное всасывание Na ⁺ считается одним из наиболее важных факторов диареи у пациентов с ВЗК (Seidler et al., 2006). Снижение экспрессии или активности NHE3 было зарегистрировано в биоптатах слизистой оболочки пациентов с ВЗК (Siddique et al., 2009; Yeruva et al., 2010). Сходным образом, мыши Il10 ^-/- , у которых развивается спонтанный колит, обнаруживают сниженную активность Nhe3 в энтероцитах (Larmonier et al., 2011; Sellon et al., 1998). Следовательно, снижение активности NHE3 в кишечнике пациентов с гиперактивными мутациями GUCY2C может способствовать возникновению симптомов, подобных болезни Крона, и колита.Недавно мы предположили, что нарушение транспорта натрия в кишечнике и его влияние на микробиом могут служить основным восходящим медиатором нижестоящей патофизиологии (Prasad and Visweswariah, 2021).

Снижение уровней транскриптов и экспрессии белка Nhe3 у мышей S839I предполагает роль цГМФ (и, возможно, PKGII) в снижении транскрипции Nhe3 . Транскрипция Nhe3 положительно регулируется факторами транскрипции Sp1/Egr-1 (Malakooti et al., 2006). Паратгормон-индуцированное ингибирование транскрипции Nhe3 в клетках проксимальных канальцев почек опоссума было опосредовано усиленным связыванием Egr-1 с основным промотором Nhe3 и активацией активности JAK-STAT3 (Neri et al., 2015). Недавнее исследование показало, что активация p38 в клетках Caco2 толстой кишки человека коррелирует со снижением транскрипции Nhe3 (Enns et al., 2020). Ранее мы показали, что PKGII активирует p38, что, в свою очередь, приводит к усилению рекрутирования Sp1 на промотор p21, что приводит к усилению транскрипции p21 (Basu et al., 2014). Что еще предстоит изучить с учетом наших результатов, описанных здесь, так это то, является ли ингибирование транскрипции Nhe3 результатом перекрестных помех между цГМФ, PKGII, p38, Sp1/Egr-1 и STAT1 в IEC.

Активация CFTR, приводящая к увеличению оттока хлоридов, является основной причиной диареи при кишечных инфекциях, вызывая повышенную секрецию хлоридов и бикарбонатов в просвет кишечника.У мышей с гиперактивацией Cftr обнаруживаются признаки диареи и ощелачивания просвета кишечника из-за повышенной секреции бикарбоната (Gelfond et al., 2017). Здесь мы показываем, что у мышей S839I также наблюдается защелачивание просвета тонкой кишки (рис. 3 F). Повышенный транзит в тонком кишечнике мышей S839I (рис. 3C) из-за активации Cftr и ингибирования Nhe3 предполагает, что CFTR может быть нацелен на пациентов с FGDS. Инактивирующие мутации в CFTR приводят к мекониевой непроходимости кишечника у новорожденных (Sathe and Houwen, 2017) и кишечной непроходимости у взрослых из-за снижения перистальтики кишечника и гидратации.Это имитирует то, что наблюдается у пациентов с инактивирующими мутациями в GUCY2C (Bose et al., 2020; Romi et al., 2012; Smith et al., 2015; Woods et al., 2019), что указывает на решающую роль Cftr. после передачи сигналов GC-C.

S839I наблюдалась более высокая частота испражнений и содержание воды в кале, что свидетельствует о симптомах, подобных диарее (рис. 2, F и G). Однако тяжелой водянистой диареи, отмеченной жидким стулом в подстилке клетки, а также влажными и обесцвеченными аногенитальными областями, у мышей S839I не наблюдалось. Это может быть частично связано с генетическим фоном мышей.Например, у мышей C57BL/6N при инфицировании мышиным патогеном Citrobacter rodentium развивается только умеренная диарея (Bhinder et al., 2013), тогда как у мышей FVB/N наблюдается тяжелая диарея и смертность (Borenshtein et al., 2008).

На нагрузку и разнообразие комменсального микробиома большое влияние оказывает транспорт эпителиальных ионов в кишечнике (De Lisle, 2007; Gurney et al., 2017; Keely et al., 2012). Потеря GC-C у мышей приводит к дисбактериозу микробиоты кишечника с более низким содержанием Lactobacillus (Majumdar et al., 2018). Известно, что комменсал Lactobacillus играет защитную роль против воспалительных заболеваний, влияя на функционирование Т-регуляторных клеток (Т-регуляторных клеток). Повышенное количество Proteobacteria с сопутствующим снижением Lactobacillus обнаруживается у пациентов с ВЗК (Sartor, 2008). У пациентов с ФГДС наблюдалось повышенное количество Enterobacteriaceae (γ Proteobacteria), что связано с воспалением кишечника и симптомами, сходными с болезнью Крона (Tronstad et al., 2017). В физиологических условиях эпителий толстой кишки подвергается β-окислению и истощает кислород в просвете, что приводит к анаэробной среде.Однако во время воспаления эпителиальные клетки толстой кишки теряют способность к β-окислению, что приводит к увеличению кислорода в просвете, дисбактериозу микробиома и цветению протеобактерий (Hughes et al., 2017). Это увеличение Proteobacteria и уменьшение Lactobacillus также наблюдается у мышей с нокаутом Nhe3 ^-/- (Larmonier et al., 2013). Таким образом, микробный дисбиоз, наблюдаемый у мышей S839I, напоминает таковой у пациентов с ВЗК и мышиными моделями колита (рис. 5).

Положительная роль передачи сигналов GC-C во время ВЗК подтверждается наблюдением, что у пациентов с ВЗК наблюдается значительное снижение уровней транскриптов GUCA2A , GUCA2B и GUCY2C , и потеря этих белков связана с тяжести заболевания у пациентов (Brenna et al., 2015; Лан и др., 2016). Мы наблюдали аналогичные изменения у наших мышей после лечения DSS (рис. 4 C). Однако, как это ни парадоксально, у пациентов с мутацией p.S840I в GC-C проявляются признаки БК, СРК и обструкции подвздошной кишки из-за воспаления (Fiskerstrand et al., 2012). Возможно, снижение экспрессии GC-C и лиганда после лечения DSS является компенсаторным механизмом, который может противодействовать повышению уровня цГМФ, наблюдаемому у мышей S839I. Кроме того, пути, не регулируемые непосредственно цГМФ, также могут неправильно регулироваться у этих мышей, что, в свою очередь, может иметь обратную связь с регуляцией GC-C и его лигандов.Поскольку мыши, лишенные Nhe3 , проявляют предрасположенность к колиту, индуцированному DSS (Kiela et al., 2009), поток электролитов и дисбаланс в кишечнике в сочетании с изменениями в микробиоме могут быть отдаленными факторами повышенной восприимчивости к химически индуцированному колиту. колит (Prasad and Visweswariah, 2021).

показало, что несколько генов, связанных с воспалением кишечника и колитом, неправильно регулируются у мышей S839I.Действительно, паттерн экспрессии генов аналогичен наблюдаемому в толстой кишке мышей, получавших DSS (Fig. 7), и, что важно, у пациентов с ВЗК (Lamas et al., 2016; Zhao et al., 2015). Почти все гены, экспрессия которых подтверждена в биоптатах пациентов с активным ЯК (Zhao et al., 2015), аналогичным образом активируются у мышей S839I. К ним относятся STAT1 , IRF1 , IRF9 , IFIT2 , IFIT3 , IFITM2 , OAS2