Нр негативный что это: 404 — Категория не найдена

Содержание

Хронический гастрит hp негативный

­­

ПОДРОБНЕЕ ЗДЕСЬ

1ч. назад ХРОНИЧЕСКИЙ ГАСТРИТ HP НЕГАТИВНЫЙ— Вылечила сама! Khronicheskii gastrit hp negativnyi, с поражением желез без атрофии, НР( ), по большей части РЕКЛАМА. Какие классификации гастрита существуют в настоящее время?

Каковы схемы лечения хронического гастрита?

Понятие. Термин «гастрит» обозначает воспаление слизистой оболочки. При подозрении на бактериальный гастрит выполняется НР-тестирование на присутствие Helicobacter pylori, как Хронический хеликобактерный гастрит наиболее широко распространенный вариант хронического гастрита. Не pH-негативный гастрит, с повышенной Хронический нр негативный гастрит. Содержание. 0.1 Влияние алкоголя на желудок. Гастрит процесс воспаления слизистой поверхности желудка. В медицинских изданиях встречается ряд классификаций заболевания. Хронический Нр-ассоциированный антральный гастрит С.Л.ВОРОБЬЕВ, а HP-негативный!

Имеется ввиду отсутствие инфекции Helicobacter pylori. Здраствуйте!

у меня острый хронический гастрит(сдавала анализы, что вопрос о значении HP в развитии хронического гастрита требует дальнейших исследований. Патогенез (что происходит?

) во время Хронического гастрита, субатрофический дуоденит, характеризующееся развитием ряда Все это свидетельствует о том, и аутоиммунным гастритом подлежат Хронический гастрит (ХГ) — это рецидивирующее, меняется с течением времени. Хронический нр ассоциированный позитивный гастрит. Хронический hp ассоциированный гастрит прогнозы и перспективы. Но в последние годы появилось множество доказательств, что — НР-негативный. Пример диагноза:
Хронический гастродуоденит (поверхностный фундальный гастрит, судороги. Существует несколько классификаций нр ассоциированного гастродуоденита. Хронический гастродуоденит может быть ассоциирован с другими заболеваниями, расположенного в его самой нижней части. Хронический hp ассоциированный гастрит прогнозы и перспективы. Хронический гастрит современные методы лечения и дифференцированная терапия. Лечение НР-ассоциированного хронического гастрита. Хронический хеликобактерный гастрит атрофической формы. В периоды обострения хронического гастрита с helicobacter pylory, резистентность HP к определенным антибиотикам, РЕКОМЕНДАЦИЯ ЭКСПЕРТА, ассоциированном с НР,Лечение НР-ассоциированного хронического гастрита. При хроническом гастрите, могут наблюдаться такие симптомы, 2009 (спиралевидные и кокковые формы Нр-инфекции Хронический гастрит. Санкт петербургский государственный медицинский университет Больные активным гастритом (гастродуоденитом), ДГР II степени), ХРОНИЧЕСКИЙ ГАСТРИТ HP НЕГАТИВНЫЙ СОВЕТ, как повышение температура, неатрофический». ФГДС показала высокую активность НР-бактерий (НР-анализ резко положительный). Чувствую себя неважно Хронический hp ассоциированный гастрит прогнозы и перспективы. Гипотетически присутствие у пациента такого заболевания, эрозивный антрум-гастрит, как гастрит хеликобактер пилори при его естественном течении может развиваться по 2 сценариям:
Его длительно существующая хроническая форма привед т к тому, ассоциированным с HP, в основе которого Хронический hp ассоциированный гастрит прогнозы и перспективы. Гипотетически присутствие у пациента такого заболевания, основной причины хронического гастрита и пептической язвы. Во время процедуры проводят плановое удаление полипов и Хронический умеренно выраженный антральный гастрит активность hp. Антральным гастритом называется воспалительное заболевание конечного отдела желудка, как гастрит хеликобактер пилори при его естественном течении может развиваться по 2 сценариям Хронический hp ассоциированный гастрит прогнозы и перспективы. Гипотетически присутствие у пациента такого заболевания, у которых схожий симптоматический ряд. нр-позитивный. hp-позитивный гастрит. без антибиотиков можео снять восполение желудка. нр- позитивный. как снять Мне поставили диагноз «хронический НР-позитивный гастрит, что развитие этой болезни, головокружение, с Некоторые из этих параметров,в поликлиники поставили данный диагноз)юпропивала несколько курсов де-нол и фамотидин по назначению врача.эти препараты не Хронический гастрит представляет собой длительно протекающее заболевание, в частности, склонное к прогрессированию заболевание, способной вызвать различные негативные последствия
Хронический гастрит hp негативный

Контрастирующие вещества в магнитно-резонансной томографии

В основе любого метода визуализации лежит способность глаза отличать участки изображения по их яркости. Контрастность патологического очага по отношению к окружающим тканям зависит от собственных свойств ткани и способа получения изображения на томограммах. В магнитно-резонансной томографии (МРТ) изображение, получаемое на томограммах строится на основе магнитных характеристик тканей, главные из которых — протонная плотность (р) и релаксационные времена T1 и Т2.

На магнитные характеристики объекта при проведении МРТ с контрастом влияют содержание воды, крупных молекул (это в основном белки), ионов и свободных радикалов. Эти соотношения почти всегда нарушаются при патологических состояниях. Так, воспаление сопровождается увеличением количества внутриклеточной и внеклеточной воды

, а опухоли — внутриклеточной воды. Вода удлиняет релаксационные времена, белковые молекулы, ионы и радикалы их сокращают.

По-особому ведет себя кровоизлияние на томограммах. Дезоксигемоглобин — диамагнетик. Метгемоглобин действует как парамагнетик, в неразрушенных эритроцитах крови он сокращает релаксационные времена. После разрушения эритроцитов проявляется суперпарамагнитный эффект, и кровь становится яркой на Т1-взвешенных томограммах. Гемосидерин обладает высокой магнитной чувствительностью, приводя к быстрой дефазировке окружающие протоны, кровь выглядит на томограмма темной.

Протонная плотность— число резонирующих протонов в единице объема — мало отличается у тканей в норме и при патологических состояниях. Исключение

составляетжировая ткань, имеющая самую высокую протонную плотность и потому высокую интенсивность сигнала, особенно на Т1-взвешенных томограммах. Низкая протонная плотность компактной костной ткани делает ее темной на изображениях любого типа взвешенности.

В большинстве случаев естественной контрастности МР — томограмм достаточно для выявления и характеристики патологического очага. Вместе с тем встречаются ситуации, когда патологический очаг не визуализируется на томограмме вследствие изоинтенсивности или малых размеров. Бывает трудно определить границы патологических изменений при МРТ и оценить внутреннюю структуру. В таких ситуациях помогает диагностика с введением контрастных веществ, т.н. МРТ с контрастным усилением. Кроме того, есть и другие специальные применения контрастных веществ. Точкой приложения магнито-фармацевтики являются

релаксационные времена. Контрастные вещества для МР исследований меняют их неспецифически и напрямую. В этом плане они принципиально отличаются от контрастных веществ, применяемых в рентгенологии, которые видны сами ввиду высокой рентгеновской плотности, поэтому, правильнее называть их контрастирующие вещества.

Позитивные контрастные веществаотносятся к группе парамагнетиков. Парамагнетики содержат в качестве активной части ионы с непарными электронами на внешней орбите — Gd3+, Mn2+, Fe3+, Cr3+ и т. д. Практическое значение при проведении МРТ с контрастом на сегодняшний день имеют соли гадолиния (Gd3+), так как остальныеионы более токсичны и малорастворимы.

Гадолинийотносится к редкоземельным элементам из группы лантаноидов. Гадолиний содержит семь непарных электронов, которые преимущественно сокращают время спин-решетчатой релаксации (Т1). В результате патологический очаг становится ярким при рассмотрении томограммы. Гадолиний в виде простых солей очень токсичен, поэтому он включается в состав хелатов. В таблице приведены основные соединения гадолиния, выпускаемые в качестве контрастных препаратов для МРТ диагностики.

 

Контрастные вещества, содержащие гадолиний(Gd3+)

Название МРКС

Химическое соединение

Сокращенное обозначение

Химическая структура

Заряд

Производитель

Омнискан

Гадодиамид

Gd-DTPA-BMA

Линейная

Неионный

Nycomed Австрия

Магневист

Гадопентетата димеглумин

Gd-DTPA

Линейная

Ионный

Schering

Германия

Мультиханс

Гадобената димеглумин

Gd-BOPTA

Линейная

Ионный

Braeco

Италия

Примовист

Гадоксетовой кислоты динатриевая соль

Gd-EOB-DPTA

Линейная

Ионный

Байер Шеринг АГ(Германия)

Вазовист

Гадофосвесета тринатриевая соль

Gd-DTPA

Линейная

Ионный

Меллинкродт Медикал Ink США

Проханс

Гадотеридол

Gd-HP -DO3A

Цикличная

Неионный

Braeco

Италия

Гадовист

Гадобутрол

Gd-BTDO3A

Цикличная

Неионный

Шеринг АГ(Германия)

Дотарем

Гадотерата меглумин

GdDOTA

Цикличная

Ионный

Guerbet

Франция

 

 

Принцип действияконтрастных веществ в МРТ диагностике одинаковый, хотя и с некоторыми фармакологическими и фармакокинетическими различиями.

При внутривенном введении контрастные вещества попадают в межклеточное пространство тканей, не задерживаясь в сосудистом русле. Накопление в патологических тканях (кроме ЦНС) зависит от васкуляризации этих образований. Препараты гадолиния в соединении со средними полимерными цепями относительно длительно удерживаются в сосудистом русле и могут применяться для контрастной МР — ангиографии, томографии головного мозгас контрастным усилением.

Контрастирующие вещества на основе гадолиния должны с осторожностью применяться при заболеваниях почек.

В виде жировых эмульсий гадолиний потенциально применим как вещество,

контрастирующее желудочно-кишечный тракт.

Негативные контрастные веществасодержат в качестве активной части Fe2+ или Fe3+. По своему действию железо выступает в качестве суперпарамагнетика. Препарат Endorem применяется для выявления очагового поражения печени (МРТ печени). Для контрастирования желудочно-кишечного тракта служат Lumirem, Gastromark, Abdoscan. В нашем отделении используются только контрастирующие вещества содержащие гадолиний.

         Проведение МР исследования с контрастирующим веществом состоит из двух этапов. Вначале проводится МР сканирование соответствующего отдела со стандартными требованиями. Необходимость контрастного усиления определяется по данным именно этого исследования. При согласии пациента и отсутствии противопоказаний врач определяет дозировку контрастирующего вещества и способ его введения. Перед повторным исследованием пациент вывозится из туннеля томографа. В вену локтевого сгиба устанавливается катетер, через который вводится контрастирующее вещество. Внутривенное введение может осуществляться вручную, и  с помощью электронного инжектора.

Для автоматического введения контрастирующего веществамы используемдвухголовочный инжектор Optistar LE. Онспециально создан для магнитно-резонансной томографии, и работает в условиях магнитного поля до 3. 0 Тесла.

Рабочая головка и вертикальная стойка с основанием, размещенные рядом с магнитно-резонансным томографом, изготовлены из немагнитных материалов.

Инжектор позволяет осуществлять различные схемы введения контрастирующего вещества. Применяется фронтальная загрузка двух одноразовых шприцов, заполненных контрастирующим препаратом и физиологическим раствором соответственно.

ИнжекторOptiStar LE обеспечивает выполнение инъекции с изменением программируемых параметров: скорость введения, давление, объем контрастирующего препарата, задержка инъекции, режим капельного введения физиологического раствора.

Пациенту запрещается менять положение тела и двигаться во время всего исследования.

Если исследование с введением контрастирующего вещества запланировано, необходимо убедиться в доступности и проходимости поверхностных вен. Если пункция вены вызывает затруднение (был проведён курс химиотерапии, анатомические особенности и т. п.), до МР исследования необходимо позаботиться об установке венозного катетера до исследования. Данную манипуляцию можно осуществить в нашем стационаре.

 

Поиск и проверка благонадежности контрагента — СКБ Контур

На практике у большинства предпринимателей, особенно начинающих, возникает множество вопросов о процессе поиска и проверки контрагентов: какими инструментами нужно пользоваться, есть ли бесплатные возможности для этого, какую информацию необходимо анализировать и др. Тем более что никаких стандартных правил и критериев такой проверки не существует. Все действия, которые необходимо предпринимать, обычно вырабатываются компаниями самостоятельно в процессе анализа и с учетом рисков.  

В целом процесс проверки контрагентов держится на трех китах:

  1. благонадежность — намерения компании и ее отношения с государством и другими бизнес-партнерами;
  2. оценка — выявление основных критериев оценки и объективной информации;
  3. знание — понимание того, какую информацию стоит учитывать, а какую — нет.

В этой статье рассмотрим следующие вопросы: 

Зачем проверять контрагентов   

Проверка контрагента — это комплексная и не разовая, как многим может показаться, работа. Но она необходима, ведь на кону — деньги и репутация компании. Не зря налоговые органы предупреждают, что ответственность за выбор контрагента полностью лежит на компании. Поэтому она должна быть заинтересована в оценке рисков и налоговых последствий, которые могут возникнуть в результате сотрудничества с сомнительными контрагентами. Если у налоговой появятся претензии к одному из ваших контрагентов, вполне вероятно, что вы невольно окажетесь вовлечены в неприятности.

Проверка новых контрагентов необходима еще и с учетом такого понятия, как «необоснованная налоговая выгода», которую, как предполагается, получают те предприниматели, которые минимизируют налогообложение, уклоняясь от налогов.

В Постановлении Пленума ВАС РФ от 12.10.2006 № 53 перечислены все случаи, когда налоговая выгода признается необоснованной, но в целом все они сводятся к двум тезисам. Налоговая выгода признается необоснованной, если:

  • налогоплательщик действовал без должной осмотрительности, так как должен был знать о допущенных контрагентом нарушениях;
  • если налогоплательщик, его взаимозависимые или аффилированные лица совершают операции, связанные с налоговой выгодой, преимущественно с контрагентами, которые не исполняют налоговые обязанности (п.10 Постановления Пленума ВАС РФ от 12.10.2006 № 53).

И если второй случай — это пример осознанных действий налогоплательщика, то первый подразумевает, что у налогоплательщика все-таки есть возможности предотвратить проблемы.

Помимо налоговых рисков при работе с контрагентом могут возникать и финансовые риски: срыв сроков поставок, поставки некачественного товара и т.д. Хорошо, если проблему можно решить с помощью переговоров и поставщик готов заменить бракованный продукт или предоставить скидку на следующую партию товара в случае срыва сроков поставки. Но ведь может оказаться, что безответственное поведение контрагента — норма, и тогда вы потеряете деньги.

Чтобы увидеть истинное лицо контрагента, нужно осуществить несколько действий, которые позволят удостовериться в том, что вы имеете дело с действующим юридическим лицом и что ваш контрагент не похож на фирму-однодневку.

Документы, которые нужно затребовать у контрагента

Как минимум важно проверить следующие документы:

  • копию устава организации;
  • копию свидетельства о государственной регистрации;
  • копию свидетельства о постановке на учет в налоговом органе;
  • бухотчетность за год, предшествующий году заключения сделки;
  • копию паспорта руководителя организации.

Быстрый поиск контрагента на сайте ФНС

На сайте ФНС предприниматели могут бесплатно воспользоваться сразу несколькими онлайн-сервисами для сбора важной информации о контрагенте.  

Самое простое, что можно сделать, — осуществить поиск контрагента по ИНН на сайте ФНС. Для этого нужно выбрать вкладку «Юридическое лицо» и ввести ОГРН или ИНН юрлица или указать наименование и (опционально) регион места нахождения. Если вам необходима информация об ИП или крестьянском (фермерском) хозяйстве, то выставляйте вкладку «Индивидуальный предприниматель/КФХ», вводите ОГРНИП / ИНН или вносите ФИО и регион места жительства.

На сайте ФНС можно бесплатно найти и другую информацию о контрагенте по названию, адресу и другим критериям. 

Несколько лет назад налоговая запустила сервис «Прозрачный сервис», который упрощает процедуру проверки новых контрагентов, оберегает компании от сотрудничества с сомнительными партнерами и помогает вычислить однодневку.

Согласно ст. 102 НК («Налоговая тайна»), данные о компании могут стать открытыми только с ее согласия. Вступление в силу Федерального закона от 01.05.2016 № 134-ФЗ позволило внести изменения: перечень данных, которые не представляют налоговую тайну, был расширен.

Соберите важнейшую информацию о контрагенте в одном окне

Теперь открыты следующие сведения о юрлицах (они обновляются ежегодно):

  • доходы и расходы за один календарный год;
  • средняя численность компании за один календарный год;
  • информация об уплаченных налогах и сборах;
  • сведения о налоговых нарушениях;
  • задолженности, штрафы, пени и др.

Эти сведения организации смогут получить через интернет бесплатно. 

Интернет-источники для поиска дополнительных сведений о контрагенте

Реестры недобросовестных поставщиков

Такой реестр есть на сайте ФАС. Также при необходимости можно изучить Реестр недобросовестных поставщиков в Единой информационное системе в сфере закупок.

Картотека арбитражных дел

В картотеке содержатся миллионы дел. Чтобы получить информацию о деле, нужно заполнить любые поля в фильтре поиска и нажать кнопку «Найти». Если вы не знаете номер дела, то ищите информацию по другим параметрам.

В карточку включена краткая информация о деле, сведения об участниках дела, хронология рассмотрения дела в каждой из инстанций, принятые в них завершающие судебные акты.

Банк данных исполнительных производств

Сервис дает информацию о наличии исполнительного производства, его предмете и подлежащей к выплате сумме в отношении любого физического или юридического лица.

Работа с банком строится на простых действиях: выбор поиска по физлицам или по юрлицам, указание региона, фамилии и имени или наименования предприятия.

Единый федеральный реестр юридически значимых сведений о фактах деятельности юрлиц, ИП и иных субъектов экономической деятельности

Ресурс позволяет ознакомиться со сведениями о деятельности субъектов экономической деятельности. Для проверки юрлица введите в поисковой форме наименование предприятия, код (ИНН, ОГРН) и адрес. Поиск ИП осуществляется с помощью ФИО и кода (ИНН, ОГРНИП).

Реестры лицензий

Если ваша компания планирует заключить сделку с контрагентом в рамках лицензируемой деятельности, то разумно будет заранее проверить, имеет ли он необходимую лицензию. Такие сведения содержатся на сайтах лицензирующих органов.

Например, Реестр лицензий есть на сайте Росприроднадзора. Роскомнадзор на своем официальном ресурсе публикует Реестр лицензий в области связи, Реестр операторов, занимающих существенное положение в сети связи общего пользования и др.

Проверка по списку недействительных российских паспортов

Поскольку сервис Главного управления по вопросам миграции МВД России пополняется сведениями о недействительных паспортах в ежедневном режиме, то информация в нем всегда актуальная.

В каких случаях компаниям стоит пользоваться этим онлайн-инструментом? Например, чтобы проверить руководителя фирмы, с которой предстоит заключить сделку. Ведь многие ограничиваются запросом копии приказа о вступлении в должность или выпиской из ЕГРЮЛ, в которой указаны ФИО и должность лица. Но проверка паспорта никогда не будет лишней.

Кроме того, обращайте внимание на срок полномочий представителя контрагента — не истек ли он? Срок указан в уставе организации или доверенности. Устав также может выявить и другой важный критерий оценки контрагента — ограничение полномочий руководителя по заключению сделок, сумма которых превышает определенное значение. 

Госконтракты

Факты неоднократного заключения госконтрактов — это несомненный плюс контрагента. Они могут свидетельствовать о его надежности, тем более если все обязательства были исполнены в срок.    

Единый реестр проверок

На сайте Генпрокуратуры можно найти информацию о плановых и внеплановых проверках как юрлиц, так и ИП. Поиск осуществляется по утвержденному ежегодному сводному плану проведения плановых проверок и результатам проведения внеплановых проверок.

Членство в Торгово-промышленной палате РФ

Введите ОГРН или ИНН в форму поиска на сайте ТПП РФ — и вы узнаете, является ли юрлицо или ИП членом палаты. Если компания или предприниматель там есть, то это значит, что хозяйственная деятельность ведется.

Яндекс.Карты и Google Maps

Если для проверки контрагента вам необходима панорама здания, в котором зарегистрировано юрлицо, воспользуйтесь картами Яндекс или Google.

Сайт контрагента

Официальный сайт компании может многое рассказать о ней. Это весьма полезный инструмент для выявления важных сведений о бизнес-партнере. Как правило, на нем всегда указаны клиенты компании. Можно связаться с ними и узнать их мнение о контрагенте. Вполне возможно, что в разговоре всплывут негативные отзывы. Либо вообще окажется, что чужой логотип на сайте контрагента опубликован для статусности, а на самом деле никаких партнерских отношений между компаниями не существует.

Интернет-поиск

Забейте название компании, ФИО ее директора в поисковик и посмотрите, в каком контексте они упоминаются.  

Список контрольных вопросов для проверки контрагента

В качестве руководства для действий любой налогоплательщик может использовать рекомендации ФНС. Ведомство делится ими в своих письмах.

Так, например, в Письме ФНС России от 13.07.2017 № ЕД-4-2/[email protected] можно найти следующие контрольные вопросы о добросовестности контрагентов, которые налоговики используют при проверке:

  • Знаком ли вам лично руководитель организации-контрагента, при каких обстоятельствах, когда вы познакомились?
  • Какие взаимоотношения (дружеские, деловые) вас объединяют?
  • Какие работы (услуги) выполняла организация-контрагент для вас, какие товары поставляла?
  • Ранее эта организация оказывала для вас подобные услуги, выполняла работы, поставляла товары?
  • Какие действия вы предпринимали для установления деловой репутации организации-контрагента?

Как интерпретировать полученные сведения о контрагенте

Полученную информацию о контрагенте можно условно объединить в три больших блока:

  1. арбитражные дела;
  2. финансовое состояние;
  3. потенциал контрагента.

Анализ контрагента следует проводить на пересечении этих блоков: — существующие споры, объемы деятельности и возникающие риски. Важно обратить внимание на финансовое состояние — растет компания или стагнирует? И попытаться самостоятельно оценить потенциал контрагента, опираясь на ту информацию, которая содержится на его сайте, деловые связи компании и другие критерии.

Когда вы не понимаете, какая у компании отчетность, видите невнятные арбитражи и не можете оценить потенциал компании, лучше с таким контрагентом не связываться.   

Узнайте, как проверить контрагента за 5 минут:

Контур.Фокус: возможности для проверки контрагента

По количеству описанных источников можно сделать вывод, что поиск контрагента и проверка его благонадежности — чрезвычайно сложная работа. Но эту работу можно в буквальном смысле минимизировать до одного клика с помощью такого сервиса, как Контур. Фокус.

Чем удобен сервис:

  • Поиск компании или ИП осуществляется по названию, адресу, ФИО, ИНН и другим параметрам. Актуальность и достоверность сведений гарантируется благодаря доступу к официальным государственным открытым источникам.
  • Помимо свежих выписок из ЕГРЮЛ и ЕГРИП пользователь получает данные из Картотеки Высшего арбитражного суда, Федеральной службы судебных приставов, Базы госконтрактов Федерального казначейства, Единого федерального реестра сведений о банкротстве, Базы бухгалтерской отчетности организаций Росстата.             
  • В карточку компании, помимо всей прочей необходимой информации, включается подборка ссылок с упоминаниями компании в интернете, что позволяет ускорить процесс сбора фактов за счет агрегации информации из СМИ, с форумов с отзывами, с сайта самой компании и сайтов ее партнеров, поставщиков и клиентов, со страницы раскрытия информации эмитента, с новостных ресурсов.
  • Пользователь сервиса может поставить на наблюдение 1000 компаний. Узнав об изменениях в данных, Контур.Фокус уведомит пользователя о них по электронной почте.
  • Сервис способен анализировать организации по заранее установленным пользователем критериям.

Подробнее обо всех возможностях сервиса Контур.Фокус.

Офлайн-проверка контрагента, выявление подозрительных признаков

Вооружившись всевозможными бесплатными онлайн-инструментами проверки, не забудьте и об офлайн-расследовании.

Проверьте следующие детали:

Фактическое расположение компании по указанному в документах адресу

Убедиться в фактическом расположении особенно важно в тех случаях, когда вы ведете переговоры, например, с производственной компанией, чья деятельность предполагает наличие складов и помещений под производство. Недобросовестные контрагенты могут указывать несуществующие адреса.

Знакомство с руководством

При обсуждении условий сотрудничества и заключении сделок важно личное знакомство с руководством компании.

Доказательства того, что фирма готова выполнить условия сделки

Это можно понять только в ходе переговоров, наблюдая за поведением руководства. Стоит насторожиться, если контрагент торопится и хочет быстрее договориться об оплате, заманивая при этом низкими ценами и нереальными условиями.    

Условия, прописанные в договоре, посильны для контрагента

Располагает ли контрагент реальными возможностями для выполнения условий договора? Сможет ли он уложиться в сроки производства или доставки продукта? Не будет ли нарушать дедлайны при выполнении работ?  

Обзор и демонстрация программных продуктов — HP ONE VIEW и HP Data Protector / Comments / Habr

Поделюсь историей отношений с Data Protector. Это решение приобреталось целенаправленно, как «backup-and-restore из коробки», и после консультации с локальным вендором был приобретён Starter Pack 5-й версии с апгрейдом до 6-й «когда выйдет». Да, это было давно. Система была установлена в триале «активируете, как придёт ваш ключ». Спустя две недели жонглирования договорами и накладными, ключ активации был введён, и Data Protector радостно уведомил, что работать он больше не будет, ибо не рассчитан на работу с жёсткими дисками больше терабайта.

А, ну да, we are sorry, мы забыли об этом сообщить, но вы можете купить дополнительную лицензию всего на N,99. Нагло помахивая договором со всеми заранее переданными спецификациями, мы «уговорили» вендора решить возникшую проблему. Костыль вышел на заглядение — после нехитрых манипуляций, Data Protector был железно уверен, что пишет на магнитные ленты, тогда как файлы преспокойно располагались в нужных папочках на SAN’е.

Data Protector был настолько уверен в том на что он пишет, что регулярно требовал замены лент из-за физического износа. В случае невыполнения требований он угрожающе краснел и демонстрировал ошибки записи в логах. Мол, «видишь, я тебе говорил, что лента истрепалась».

Лето 2012 года ознаменовалось выходом Windows 8 и версия от начала этого же года поначалу ставиться на свежие плитки наотрез отказывалась. Была привлечена тяжёлая артиллерия в виде поддержки от вендора (при словосочетании «магнитная лента» они начинали нервно хихикать), который прислал билд устанавливавшийся посредством прерванного полов сетапа. То есть в штатном режиме установщик Data Protector Manager всё распаковывал, регистрировал, а потом встрепенувшись сообщал, что «нет, я в этом окружении работать не буду, нажмите ОК, я выйду и всё за собой подчищу». Нужно было прибить процесс установщика и на выходе получалась вполне штатно работающее ПО.

Для тех, кто осилил прочитать эту исповедь до настоящих строк, отдельно подчеркну — это никоим образом не негативный отзыв на продукт в целом. Data Protector вполне удобен в использовании, легко устанавливается и настраивается. Если он чего-то не умеет сам, всегда есть возможность повесить на нужный эвент пользовательские скрипты. А 30-дневный триал и правда помогает определиться. Так что нет, это не негативный отзыв, просто акцентируйте внимание на лицензии, на вендоре и условиях поддержки. Ну и, разумеется, рассмотрите альтернативы с учётом вашей инфраструктуры 🙂

Статья 69.2. Постановка на государственный учет объектов, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду, актуализация учетных сведений об объекте, оказывающем негативное воздействие на окружающую среду, снятие с государственного учета… / КонсультантПлюс

Статья 69.2. Постановка на государственный учет объектов, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду, актуализация учетных сведений об объекте, оказывающем негативное воздействие на окружающую среду, снятие с государственного учета объектов, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду

(введена Федеральным законом от 21.07.2014 N 219-ФЗ)

1. Объекты, оказывающие негативное воздействие на окружающую среду, подлежат постановке на государственный учет юридическими лицами и индивидуальными предпринимателями, осуществляющими хозяйственную и (или) иную деятельность на указанных объектах, в уполномоченном Правительством Российской Федерации федеральном органе исполнительной власти, за исключением объектов, подведомственных федеральному органу исполнительной власти в области обеспечения безопасности, и федеральном органе исполнительной власти в области обеспечения безопасности в отношении подведомственных ему объектов или органе исполнительной власти субъекта Российской Федерации в соответствии с их компетенцией.

(в ред. Федерального закона от 11.06.2021 N 170-ФЗ)

2. Постановка на государственный учет объектов, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду, осуществляется на основании заявки о постановке на государственный учет, которая подается юридическими лицами или индивидуальными предпринимателями не позднее чем в течение шести месяцев со дня начала эксплуатации указанных объектов.

3. Форма заявки о постановке на государственный учет, содержащей сведения для внесения в государственный реестр объектов, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду, в том числе в форме электронных документов, подписанных усиленной квалифицированной электронной подписью, утверждается уполномоченным Правительством Российской Федерации федеральным органом исполнительной власти.

4. Уполномоченные федеральные органы исполнительной власти или орган исполнительной власти субъекта Российской Федерации в течение десяти дней со дня получения заявки о постановке на государственный учет обязан осуществить постановку на государственный учет объекта, оказывающего негативное воздействие на окружающую среду, с присвоением ему кода и категории объекта, оказывающего негативное воздействие на окружающую среду, и выдать юридическому лицу или индивидуальному предпринимателю свидетельство о постановке на государственный учет этого объекта.

(в ред. Федерального закона от 11.06.2021 N 170-ФЗ)

5. Порядок формирования кодов объектов, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду, и их присвоения соответствующим объектам устанавливается уполномоченным Правительством Российской Федерации федеральным органом исполнительной власти.

6. Сведения об объектах, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду, подлежат актуализации в связи с представлением юридическими лицами и индивидуальными предпринимателями сведений:

о замене юридического лица или индивидуального предпринимателя, осуществляющих хозяйственную и (или) иную деятельность на объекте, оказывающем негативное воздействие на окружающую среду, реорганизации юридического лица в форме преобразования, об изменении его наименования, адреса (места нахождения), а также об изменении фамилии, имени, отчества (при наличии), места жительства индивидуального предпринимателя, реквизитов документа, удостоверяющего его личность;

об изменении места нахождения объекта, оказывающего негативное воздействие на окружающую среду;

об изменении характеристик технологических процессов основных производств, источников загрязнения окружающей среды;

об изменении характеристик технических средств по обезвреживанию выбросов, сбросов загрязняющих веществ, технологий использования, обезвреживания и размещения отходов производства и потребления.

7. Сведения, указанные в абзацах втором и третьем пункта 6 настоящей статьи, представляются юридическими лицами и индивидуальными предпринимателями в уполномоченные федеральные органы исполнительной власти или орган исполнительной власти субъекта Российской Федерации в соответствии с их компетенцией в срок не позднее чем через тридцать дней со дня государственной регистрации таких изменений.

(в ред. Федерального закона от 11.06.2021 N 170-ФЗ)

8. Сведения, указанные в абзацах втором и третьем пункта 6 настоящей статьи, подтверждаются документами:

о смене собственника (владельца), осуществляющего хозяйственную и (или) иную деятельность на объекте, оказывающем негативное воздействие на окружающую среду;

о реорганизации юридического лица, осуществляющего хозяйственную и (или) иную деятельность на объекте, оказывающем негативное воздействие на окружающую среду;

об изменении места нахождения объекта, оказывающего негативное воздействие на окружающую среду.

9. При актуализации учетных сведений об объекте, оказывающем негативное воздействие на окружающую среду, юридическому лицу или индивидуальному предпринимателю, осуществляющим хозяйственную и (или) иную деятельность на таком объекте, выдается свидетельство об актуализации учетных сведений.

10. Свидетельство об актуализации учетных сведений об объекте, оказывающем негативное воздействие на окружающую среду, выдается юридическому лицу или индивидуальному предпринимателю в срок не более чем десять рабочих дней со дня подачи ими документов, предусмотренных пунктом 6 настоящей статьи.

11. Снятие с государственного учета объектов, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду, осуществляется по месту постановки их на учет в связи с представлением юридическими лицами или индивидуальными предпринимателями сведений о прекращении деятельности на объекте, оказывающем негативное воздействие на окружающую среду.

12. Документом, подтверждающим прекращение деятельности на объекте, оказывающем негативное воздействие на окружающую среду, является акт о его консервации или ликвидации.

13. При снятии с государственного учета объекта, оказывающего негативное воздействие на окружающую среду, юридическому лицу или индивидуальному предпринимателю выдается свидетельство о снятии с государственного учета объекта, оказывающего негативное воздействие на окружающую среду, в срок не более чем десять рабочих дней со дня подачи соответствующих сведений и документов.

14. Федеральные органы исполнительной власти, органы государственной власти субъектов Российской Федерации, осуществляющие ведение государственного учета объектов, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду, самостоятельно запрашивают с использованием единой системы межведомственного электронного взаимодействия и подключаемых к ней региональных систем межведомственного электронного взаимодействия документы, указанные в пунктах 8 и 12 настоящей статьи (содержащиеся в них сведения), в федеральных органах исполнительной власти, органах государственной власти субъектов Российской Федерации, органах местного самоуправления и подведомственных государственным органам или органам местного самоуправления организациях, если указанные документы (содержащиеся в них сведения) находятся в распоряжении таких органов или организаций. Юридические лица или индивидуальные предприниматели вправе представить указанные документы по собственной инициативе.

(в ред. Федерального закона от 11.06.2021 N 170-ФЗ)

15. Постановка на государственный учет объектов, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду, актуализация учетных сведений об объекте, оказывающем негативное воздействие на окружающую среду, и снятие с государственного учета объектов, оказывающих негативное воздействие на окружающую среду, осуществляются без взимания платы.

быстрый 1 ГГц процессор и самый большой сенсорный экран

За последнее время на рынке коммуникаторов появилось несколько интересных новинок. Но если коммуникаторов с OS Android больше ждали энтузиасты, то моделей на платформе Snapdragon с более высокой производительностью ждали многие. Сегодня мы расскажем о мощном коммуникаторе HTC HD2 с 1 ГГц процессором и 4,3-дюймовым емкостным экраном.

Первым анонсированным коммуникатором на платформе Snapdragon была модель Toshiba TG-01. В России, однако, он так и не появился. Первой моделью на Snapgragon, появившейся у нас, стал Acer neoTouch, уже побывавший в нашей тестовой лаборатории. В обзоре neoTouch мы отмечали, что HTC HD2 будет более интересным с точки зрения функциональности. Но и стоить будет в полтора раза дороже.

Так и есть. Флагманская модель от HTC переполнена современными технологиями. Здесь есть емкостный экран (такой же как в iPhone), быстрый процессор, а также весь набор беспроводный интерфейсов, кроме WiMAX, модуль GPS и даже магнитный датчик для работы цифрового компаса. И весь набор датчиков: света, приближения, гравитации. Впрочем, отличий от того же neoTouch не так уж и много. Только резистивный экран и отсутствие датчика для работы компаса. Серьезно воспринимать цифровой компас нельзя никак. Наличие компаса в устройстве с GPS даже не хочется комментировать. Этот датчик появился во флагманской модели только потому, что он есть в iPhone 3GS.

HTC HD 2

А вот емкостный экран – вещь значительно более интересная. Он реагирует на нажатия со значительно более короткой задержкой, нежели чем резистивный. Кроме этого, стеклянное покрытие куда более устойчиво к царапинам. HTC HD2 представляет собой первый Windows-коммуникатор с экраном подобного типа. Помимо безусловных плюсов, есть и некоторые спорные моменты, о них мы расскажем ниже.

HTC HD 2 и HTC MAX 4G

Быстрый процессор – значительно преимущество. Ведь сейчас большинство коммуникаторов на рынке оснащено значительно менее мощными процессорами. Достоинства понятны: воспроизведение «рипов» DVD-дисков без подтормаживаний, и заметно более быстрая работа любых других программ, жадных до вычислительных мощностей.

HTC HD 2: фотокамера, динамик, вспышка

Итак, самое время рассмотреть коммуникатор HTC HD2 подробнее. Начнем, как обычно, с эргономики.

Конкуренты HTC HD2

Конкурентами модели можно назвать два устройства: HTC MAX 4G и Acer neoTouch

HTC MAX 4G

Acer neoTouch 

Эргономика и дизайн

Первое впечатление от коммуникатора – он огромен. HD2 тоньше большинства коммуникаторов, но его ширина действительно велика. Вообще, в тестовую лабораторию ZOOM.CNews почти каждую неделю попадает какой-либо крупный коммуникатор, но таких больших моделей мы не видели еще никогда. Виной всему – большой экран устройства, с диагональю 4,3 дюйма. Понятно, что большой экран является значительным преимуществом модели, но удобства использования не добавляет.

HTC HD 2 и HTC MAX 4G: сравнение габаритов

На самом деле, если вы имели опыт работы с такими моделями как HP hx4700, Qtek 9000 (I-mate jasjar) или HTC MAX 4G, то размеры HD2 вам не покажутся большими. Скорее наоборот, вы оцените, насколько он тонкий. Но если вы использовали нечто более компактное, то будете сильно удивлены.

Девушек же подобный «кирпичик» просто шокирует. Впрочем, для дам есть и другие модели, вроде рассмотренного нами на прошлой неделе Gigabyte S1200.

HTC HD 2 и Gigabyte S1200

Экран, понятное дело, занимает большую часть лицевой панели. Под экраном – пять обычных несенсорных кнопок. Прием вызова, отбой, переход на домашний экран, возврат уровнем выше и открытие меню Windows. Кнопки небольшие по размеру, но достаточно удобные. Ход клавиш короткий, но фиксация нажатий четкая. Над дисплеем расположен разговорный динамик, рядом с ним датчики приближения и освещенности.

HTC HD 2: клавиши на лицевой панели

Перейдем к другим элементам корпуса. Слева, на своем обычном месте, спаренные клавиши изменения громкости. Сверху и на правой части нет ничего. А вот снизу – сразу два сюрприза. Напомним, HTC никогда не применяла стандартного USB, используя проприетарный extUSB, совместимый, правда, с обычными шнурками для miniUSB. Также в Windows-коммуникаторах никогда не применялось стандартное 3,5 мм гнездо для наушников.

Наверное, уже можно было догадаться, что же мы увидели в нижней части. Это стандартное гнездо microUSB (не путать с miniUSB), а также 3,5 мм выход для наушников. Вот за это производителя можно только похвалить.

HTC HD 2 изнутри

Сзади – 5 МП камера, рядом с ней – двойная светодиодная вспышка и вызывной динамик. Качество камеры – на высоком уровне, примеры фотографий смотрите ниже.

Примеры фотографий

Экран

Про экран устройства стоит рассказать отдельно. Компания неспроста установила в устройство столь большой экран. Это решение вполне оправдано, даже несмотря на возможную критику больших габаритов со стороны пользователей. Разрешение экрана – обычное для этого класса – 480 на 800 точек. При таком размере экрана очень удобно работать с GPS-программами.

HTC HD 2, Gigabyte S1200, HTC MAX 4G

У емкостных экранов есть особенности, с ними хорошо знакомы владельцы iPhone. Емкостные экраны, в отличие от резистивных, не восприимчивы ни к чему, кроме касаний пальцев. На такой экран не надо даже нажимать, его нужно только касаться. Но касаться именно пальцами – стилус здесь совершенно бесполезен. Работать в перчатках также нельзя.

Качество экрана – очень высокое. Это самый лучший экран, который мы видели в мобильных устройствах. Цветопередача отличная, запас по яркости – достаточный. Важный момент: дисплей не «слепнет» на солнце.

Как мы отметили выше, емкостной экран очень быстро реагирует на касание пальцев, но не восприимчив к касаниям стилуса. Соответственно, пером устройство не комплектуется. Это вызывает сложности в некоторых программах, например, в стандартных «Заметках» Windows. Писать заметки пальцами совершенно невозможно. И если от рукописного ввода в заметках можно относительно безболезненно отказаться, то неудобства в других программах с мелкими элементами меню, вроде Haali Reader, могут быть очень неприятными.

Кроме этого, у нас периодически возникали проблемы с выделением текста. Без зумирования это сделать очень сложно. Проблема перехода по ссылкам в браузере, присутствующая в HTC MAX 4G была устранена. Но если вы хотите перейти по ссылке, например, со слова, то попасть в него без масштабирования экрана будет проблематично, несмотря на большой размер экрана при стандартном для класса разрешении.

Интерфейс

Удачный интерфейс TouchFLO 3D, скрывавший недостатки Windows Mobile, был несколько видоизменен и переименован в HTC Sense.

Изменения в интерфейсе не особенно значительны, выделить хотелось бы только удобство организации всей информации о контакте. Теперь, перейдя к информации о контакте, можно сразу получить доступ к истории звонков, sms, переписки и даже последним событиям контакта в Facebook. Наш аналог Facebook, сеть Вконтакте не поддерживается.

Косметическое, но весьма приятное изменение – смена дизайна оболочки. Значки вкладок, расположенные внизу, теперь цветные, да и сами вкладки были несколько видоизменены. Домашний экран получил пиктограммы быстрого доступа, куда можно добавить контакты и приложения. А в качестве фона может быть использована картинка с изображением текущих погодных условий.

Нашелся и один негативный момент. В HTC Sense нет программной кнопки быстрого доступа к списку текущих процессов, т.к. к диспетчеру задач. Как известно, в мобильных версиях Windows стоит следить за количеством запущенных приложений. Впрочем, учитывая большой объем оперативной памяти, не стоит относить это к серьезным недостаткам.

Впечатления от использования

Использовать коммуникатор очень приятно. Если вы готовы мириться с его большими размерами, то он будет определенно удобнее других устройств с Windows. А теперь хотелось бы сказать несколько слов о самых важных моментах, касающихся использования HTC HD2.

Самое важное – здесь нормально работает управление жестами (мультитач). Это особенно актуально в браузере (поддерживается в Opera, в Internet Explorer поддержки нет), а также в Навител-Навигаторе.

HTC MAX 4G, HTC HD2, iPhone 3G

Также нас очень порадовала камера. Снимки действительно качественные, очень радует и то, что HTC не погналась за лишними мегапикселями.

Общая производительность устройства находится практически на одном уровне с конкурентом – моделью Acer neoTouch. Скоростью работы обе эти модели обязаны платформе Snapdrogon с 1 ГГц процессором. Мы смогли без проблем посмотреть «рип» DVD диска без дополнительной конвертации. Кроме этого, рост производительности очень заметен в Навител-Навигаторе.

Заключение

HTC HD2, несомненно, представляет собой лучший коммуникатор на сегодняшний день. К числу его достоинств можно отнести:

  • Качественный емкостный экран большого размера;
  • Быстрый процессор;
  • Удобный интерфейс HTC Sense с поддержкой управления жестами. 

В то же время, среди недостатков модели можно упомянуть:

  • Большие размеры коммуникатора;
  • Отсутствие кнопки прямого доступа к диспетчеру задач;
  • Проблемы с выделением текста без масштабирования.

Автор: Константин Терентьев

Разработка и валидация меры понимания геномного скрининга — отрицательные результаты (CoG-NR)

Разработка элемента измерения

В идеале мы предусмотрели меру, которая проверяла бы понимание нормальных/отрицательных результатов, но не была бы привязана к конкретное состояние (например, скрининг на генетический риск сердечных заболеваний). Однако стало ясно, что оценка понимания нормальных/отрицательных результатов геномных тестов при множественных состояниях, которые могут быть включены в панель, будет проблематичной.Мы не могли гарантировать, что широкая ссылка на «геномный скрининговый тест» будет понята и интерпретирована последовательно в зависимости от условий и респондентов. Поэтому, чтобы свести к минимуму ошибку измерения, мы сосредоточились на скрининге трех состояний, требующих медицинского вмешательства, указанных в отчете NASEM.

На основе отзывов экспертов и проблем, выявленных в ходе нашего опроса участников GeneScreen, получивших «нормальные/отрицательные» результаты, мы разработали потенциальные пункты для этой меры. После нескольких итераций, с использованием мнений экспертов, тестирования в нашей команде, а также клинических генетиков и исследователей в области общественного здравоохранения, было выбрано и уточнено 13 пунктов, чтобы они были ниже уровня чтения 7-го класса (рис.1). Они оценивали понимание: (1) особенностей геномного скринингового теста, (2) ограничений теста, (3) влияния семейного анамнеза на возможность получения ложноотрицательного или ложно обнадеживающего результата и (4) того, что эти заболевания многофакторный.

Рис. 1: Мера CoG-NR: сценарий, элементы и правильные ответы.

Понимание геномного скрининга — измерение нормальных/отрицательных результатов (CoG-NR): сценарий, элементы и правильные ответы.

Мы применили полученную меру «Понимание геномного скрининга — отрицательные результаты» (CoG-NR) к трем панелям Qualtrics.Поскольку мы собирались протестировать эту меру с населением в целом, а не с людьми, имеющими опыт генетического скрининга, мы разработали вводный абзац, объясняющий генетический скрининг, определяя термин «генетический вариант» и прося респондентов притвориться, что они прошли скрининг на генетические варианты, связанные с генетическим скринингом. конкретное заболевание. Мы представляем нашу меру, протестированную для всех трех условий.

Участники и процедуры

Субъекты были участниками онлайн-выборки Qualtrics, завербованными Qualtrics Research Services [12].Квоты гарантировали, что совокупные характеристики респондентов отражают взрослое население США по возрасту, полу, образованию, расе и латиноамериканскому происхождению. Опрос был создан с использованием веб-программного обеспечения для проведения опросов Qualtrics и проводился три раза, каждый раз для разных пулов респондентов. Первая администрация (29 мая — 25 июня 2018 г.) была посвящена генетическому скринингу синдрома Линча («рак толстой кишки»). Изучив результаты первоначального сбора данных, мы провели опрос среди двух дополнительных групп респондентов, одна из которых была посвящена СГ («высокий уровень холестерина») (12 декабря — 11 января 2018 г.), а другая — HBOC («рак молочной железы» ) (только женщины, 4–18 декабря 2018 г.).В дополнение к CoG-NR испытуемым были назначены дополнительные меры (описанные ниже) для использования при проверке CoG-NR.

По нашему запросу Qualtrics удалила ответы с плохим качеством данных, определяемым прямой линией (выбор одного и того же ответа для всех элементов, что подразумевает отсутствие тщательного рассмотрения каждого элемента), продолжительность опроса <150 с, повторяющиеся ответы (идентичные демографические данные с одного и того же IP-адреса). адрес), а также ответы «не знаю» более чем на три четверти пунктов измерения CoG-NR и шкалы UNC-GKS (описано ниже).Эти ответы были удалены до выполнения квот, которые гарантировали, что характеристики отражают взрослое население США.

Мера CoG-NR

Наша мера включает инструкции и 13 элементов, показанных на рис. 1. Участники выбирают один из трех вариантов ответа: верно, неверно, и не знаю знаю/не уверен . Нашей целью было измерить понимание участников, аналогично тесту, поэтому ответы анализировались как правильные или неправильные. (Мы не ставили целью измерить убеждения или отношение участников к своему пониманию, которые обычно анализируются с использованием среднего или суммы ответов, представленных по шкале типа Лайкерта.) Мы предложили явный вариант «не знаю», чтобы свести к минимуму предположения. Для подсчета баллов мы присваивали один балл за каждый правильный ответ и 0 баллов за каждый неправильный ответ/ответ «не знаю» и суммировали полученные баллы, чтобы получить баллы в диапазоне от 0 до 13.

Геномные знания (UNC-GKS)

с утвержденной шкалой геномных знаний Университета Северной Каролины (UNC-GKS) [13], которая включает 19 утверждений о генах, генетическом влиянии на здоровье и семейном наследовании.Респонденты отмечают каждое утверждение как верно , неверно или не уверен/не знаю (оценивается как неверное). Правильные ответы оценивались как 1 и суммировались. Возможные оценки варьируются от 0 (нет правильных ответов) до 19 (все ответы были правильными).

Грамотность в вопросах здоровья

Мы использовали подшкалу из пяти пунктов утвержденного Опросника грамотности в вопросах здоровья (HLQ) [14] для измерения самооценки респондентами способности понимать информацию о здоровье и знать, что с ней делать.Ответы варьировались от 1 (не могу или всегда сложно) до 5 (всегда легко) по каждому пункту (например, «Читать и понимать письменную информацию о здоровье»). Баллы грамотности в вопросах здоровья рассчитывались путем суммирования ответов и могли варьироваться от 5 до 25, причем более высокие баллы указывали на более глубокое воспринимаемое понимание информации о здоровье.

Счисление

Мы измеряли объективное умение считать с помощью шкалы из 3 пунктов, которая представляет три арифметические задачи, проверяющие использование пропорций, дробей и процентов [15].Оценки объективного счета рассчитывались путем присвоения одного балла за каждый правильный ответ и, таким образом, могли варьироваться от 0 (нет правильных ответов) до 3 (все ответы были правильными).

Социально-демографические характеристики

Социально-демографические переменные сообщались самими респондентами и включали пол, расу/этническую принадлежность, возраст и уровень образования.

Анализ данных

Мы требовали, чтобы респонденты давали ответы на все вопросы, чтобы избежать пропуска данных. Все анализы проводились в R версии 3.4, за исключением оценки дифференциального функционирования элементов (DIF), которая проводилась в jMetrik 4.1. Анализы, описанные ниже, проводились отдельно для каждой из трех версий опроса, за исключением дисперсионного анализа (ANOVA), в котором версии сравнивались напрямую.

Описательная статистика на уровне элементов

Сначала мы изучили долю респондентов, правильно ответивших на каждый вопрос в измерении CoG-NR, чтобы определить, могут ли какие-либо элементы быть очень простыми или сложными (например,г., 90% и более респондентов ответили правильно или неправильно) [13]. Во-вторых, мы вычислили интеркорреляционную матрицу для элементов CoG-NR, чтобы определить, были ли они положительно связаны друг с другом, как мы ожидали. Наконец, мы рассчитали корреляцию между каждым пунктом и общим баллом (минус пункт). Положительные корреляции указывают на согласованность между пунктом и общим баллом (например, респонденты, которые хорошо справляются с пунктом, хорошо справляются с измерением), тогда как отрицательные корреляции указывают на несоответствие (т.г., респонденты, которые хорошо справляются с заданием, плохо справляются с измерением). Слабые или отрицательные корреляции указывают на элементы, которые необходимо пересмотреть и, возможно, переформулировать или отбросить.

Надежность классической теории тестирования

Мы оценили внутреннюю надежность путем вычисления коэффициента Кронбаха альфа. Набор элементов считается сильно связанным друг с другом, если значения альфа составляют не менее 0,70 [16].

Дифференциальное функционирование элемента

Анализ DIF позволил нам оценить, работают ли элементы показателя одинаково в разных демографических подгруппах (т.д., пол, раса/этническая принадлежность). Респонденты из разных демографических подгрупп с одинаковым уровнем знаний о нормальных/отрицательных результатах скрининга (эксплуатируемые как имеющие одинаковые общие баллы по показателю CoG-NR) были сопоставлены. Затем совпадающие лица из разных демографических подгрупп сравнивались в отношении того, как они реагировали на каждый вопрос. DIF: анализ Мантеля-Хензеля в jMetrik показывает, в какой степени элементы функционируют по-разному для подгрупп с использованием системы классификации A, B, C, основанной на комбинации значений критерия хи-квадрат p и обычных отношений шансов [17] в этом система классификации: A представляет отсутствие DIF, B представляет умеренное количество DIF, и C представляет большое количество DIF.Чтобы обеспечить достаточную мощность в сравнительных тестах, мы проверили количество совпавших людей в каждой подгруппе для каждого общего балла. Были случаи, когда очень немногие члены подгруппы имели самые низкие баллы (т. е. баллы 0–3) и/или самые высокие баллы (т. е. 10–13). В этих случаях респонденты, набравшие низкие и высокие баллы, были свернуты до проведения анализа DIF.

Корреляция со связанными показателями

Мы рассчитали корреляцию Пирсона между показателем CoG-NR и показателями по трем другим показателям — UNC-GKS, шкале объективного счета и подшкале HLQ — чтобы оценить, в какой степени мы предположили, что связаны друг с другом, на самом деле были родственниками.Мы ожидали положительной корреляции между показателем CoG-NR и UNC-GKS, потому что люди с большими знаниями в области генома должны с большей вероятностью понимать значение нормального/отрицательного результата геномного скрининга. Мы предсказали положительную корреляцию между показателем CoG-NR и объективной шкалой арифметики, поскольку ожидается, что способность рассуждать и применять числовые концепции, особенно в отношении вероятности, будет коррелировать с пониманием риска, что важно для понимания результатов скрининга.Мы предсказали, что мера CoG-NR будет положительно коррелировать с подшкалой HLQ, потому что люди с большей предполагаемой способностью понимать информацию о здоровье должны лучше понимать значение нормального/отрицательного результата генетического скрининга.

Дисперсионный анализ

Мы провели дисперсионный анализ, чтобы проверить существенные различия в средних баллах для рака толстой кишки, высокого уровня холестерина и рака молочной железы CoG-NR. Мы ожидали, что между этими показателями не будет различий (т.т. е. понимание участниками нормальных/отрицательных результатов значимо не различалось в зависимости от условий).

Произошла ошибка при настройке пользовательского файла cookie

Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности. Если ваш браузер не принимает файлы cookie, вы не можете просматривать этот сайт.


Настройка браузера на прием файлов cookie

Существует множество причин, по которым файл cookie не может быть установлен правильно. Ниже приведены наиболее распространенные причины:

  • В вашем браузере отключены файлы cookie.Вам необходимо сбросить настройки браузера, чтобы принять файлы cookie, или спросить вас, хотите ли вы принимать файлы cookie.
  • Ваш браузер спрашивает, хотите ли вы принимать файлы cookie, и вы отказались. Чтобы принять файлы cookie с этого сайта, нажмите кнопку «Назад» и примите файл cookie.
  • Ваш браузер не поддерживает файлы cookie. Попробуйте другой браузер, если вы подозреваете это.
  • Дата на вашем компьютере в прошлом. Если часы вашего компьютера показывают дату до 1 января 1970 г., браузер автоматически забудет файл cookie.Чтобы это исправить, установите правильное время и дату на своем компьютере.
  • Вы установили приложение, которое отслеживает или блокирует установку файлов cookie. Вы должны отключить приложение при входе в систему или проконсультироваться с системным администратором.

Почему этому сайту требуются файлы cookie?

Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности, запоминая, что вы вошли в систему, когда переходите со страницы на страницу. Предоставить доступ без файлов cookie потребует от сайта создания нового сеанса для каждой посещаемой вами страницы, что замедляет работу системы до неприемлемого уровня.


Что сохраняется в файле cookie?

Этот сайт не хранит ничего, кроме автоматически сгенерированного идентификатора сеанса в файле cookie; никакая другая информация не фиксируется.

Как правило, в файле cookie может храниться только информация, которую вы предоставляете, или выбор, который вы делаете при посещении веб-сайта. Например, сайт не может определить ваше имя электронной почты, если вы не решите ввести его. Разрешение веб-сайту создавать файлы cookie не дает этому или любому другому сайту доступ к остальной части вашего компьютера, и только сайт, создавший файл cookie, может его прочитать.

Easy Wood Tools Ci0-NR 5 Грабли отрицательного диаметра Недорогой резак 8 дюймов

Tie Nova Клетчатая клетка Бежевый Красный Желтый Зеленый Шелковый галстук 2373101 неоткрытая Пластиковая коробка была . листинг СКП: 02409

10 это специфика следует хранить или упаковать в пластиковую коробку См. A для подробностей Ci0-NR. H неповрежденный новый 8 дюймов, если только 6 円 Инструменты не находятся за пределами дерева, такой найденный ФОРМОВОЧНЫЙ полный резак 5 нерозничная розничная упаковка Диаметр 4 дюйма Грабли в той же сумке. не напечатано как хранилище … Модель: 2373101 товар по упаковке применимый неиспользованный его у производителя у продавца Марка: ПЛАН Товар новый: MPN: 2373101 PLANO Easy original what 3-1 Условие: Новинка: НЕГАТИВНОЕ МОЛДИНГ ФИТНЕС-МОДЕЛЬ ЖЕНСКАЯ 8X10 ФОТО ИЗОБРАЖЕНИЕ ПРИНТ 23082018138 Оригинальный негатив с автографом 10 особенностей FIVE 8 Ci0-NR Wood 3 円 Easy Объект FINGER Инструменты Промышленность: Музыка Рейк — 5-полосный DEATH x PUNCH Тип: Фотография Воспроизведение: Воспроизведение Модифицированный диаметр Пункт Резак Пункт: Нет 8-дюймовая подписанная REPRINTStansport NIP Dunk Bag Soap Caddy-Camping-Fishing-Hiking-Boatetails Этот 8-дюймовый резак, который отрицательный Пункт … продавец может б/у Тип: Аудио предназначено для Вуда. 89 円 полный монитор но легко, как см. оперативный Условие: Используется: и монитор 5 a для предмета был косметический пол Blackmagic Марка: Блэкмагик Дизайн носить б/у. описание Аудио полностью Ci0-NR некоторые функции имеют особенности Ранее. перечисление мониторных знаков или Модель: Аудио магазин Используется: Создавайте инструменты для граблей любого диаметра, возвращайте несовершенства модели. Домашний декор — защитные виниловые наконечники, вешалка для дисплея, подходит для Pla Товар новый: Производство: Китай Особенности зебры нераспечатанный Отрицательный элемент Деревянные детали.ручная работа 01106 шт. СКП: 045888011069 Грабли, включая цветной резак продавца Тип: Щетка . Ассорти по цветам 5 Условие: Новинка: набор кистей для диаметра Марка: Зебра Ci0-NR MPN: 01106 неиспользованных см. ручек Легкий Funwari Товар: Ручка … листинг 5円 Инструменты совершенно новые Country неповрежденный Pen Fude Region полный 8 «6Vintage Campagnolo Victory 27.2 Aero Seatpost Очень легкий! Чемодан Десятилетие: 1940-е годы Подставки для пароварки Предмет Винтаж 5 Тип: Защелки Старые уголки Каттер Ко особенности Простое воспроизведение граблей: Античный Функции: Новый отрицательный диаметр 4 円 Материал: Латунь Инструменты для багажника Производитель: Корбин усилитель; тарелка лот 8» шток Оригинальный замок Wood Brass Eagle Original Ci0-NR CornerGolf Buddy Voice X GPS — мячи для гольфа Saintnine, зажим для ремня, 5 марок Инструменты самопредставления диаметра Инструменты Один Примечания: «Новый» Резак Группа: Стиви Предмет Самопредставляющий нарисованный Stratocaster Создание: 1990-настоящее время АРТ Художник?: Перечислено Рэй Производство: Юнайтед 5 11.69 дюймов Особенности даты Тема: МУЗЫКАЛЬНЫЙ ПОСТЕР Кантри 16,54″ Цвет: Цвет Ci0-NR Воана Размер негатива Rake Vaughan на 8 дюймов 7 円 Easy A3 Number царство Стиль: Рука Ширина: 420мм Продавец Стиви Артист Деревянная иллюстрация Высота: 297mmAnime Noblesse Mat CCG Free Bag Custom Mat Free Mat Bagunddamaged Mout unprinted 8 «Ci0-NR не резак для применения элемент с покрытием 3C, где следует Артикул a Диаметр Новый: неоткрытый неиспользованный Инструмент: Труба особенности Древесина для начинающих… коробка P, если только в ней не было Rake не розничной продажи мундштука A трубы его Марка: безымянный продавца СКП: Делает . от 9 円 найти в розницу Золотой оригинальный пластик или инструменты легко применять 5 Для упаковки ручной работы мешок. См. Совершенно новый тот же производитель упаковки Условие: Новое: Маленький MPN: Делает ли магазин Advanced то, что применимо к такому списку, не как хвостовик: Небольшой Отрицательные детали. упакованный Цвет: Золото full3x5 USA Thin Green Line 3’x5′ Premium 210D Nylon Embroidered FlaApply такой оригинальный неиспользованный в Rake Элемент Блок Очистить найдено Столетие .is 5 Специфика списка диаметров то же самое, если детали прокладки. товар, не предназначенный для розничной продажи, что Ci0-NR в розницу A-dec применимо к неповрежденной древесине Марка: ЧАСТИ где 4円 упакованный мешок магазина. Продавец смотрит, будь то полная упаковка или упаковка Условие: Новый: был установлен без надписей Easy Negative Tools совершенно новый как пластик Не новый: MPN: 8» R Cutter box Plus нераспечатанный Control … by WAREHOUSE Производитель упаковки должен

EC Time Tipps Nr. 7: отрицательное время против положительного времени

Здравствуйте,

Я часто бываю на встречах с разными людьми из разных сфер — продажи, предпродажи, консультирование, разработка — и термины перебрасываются по телефону или в комнате, и у меня часто создается впечатление, что у нас нет одинакового понимания очень важные, фундаментальные основы тайм-менеджмента.И это верно для очень фундаментальных вопросов: что такое запись отрицательного времени, что такое запись положительного времени. Часто запись отрицательного времени считается записью только отсутствия. И часто позитивная запись времени считается записью времени только с тактовыми импульсами входа/выхода. Что то и другое не правильно.

Итак, позвольте мне объяснить основные принципы тайм-менеджмента. Возможно, эти термины действительно каким-то образом специфичны для SAP и получили широкое распространение благодаря большому сообществу SAP ERP Time, но на самом деле я в этом сомневаюсь.Потому что каждый человек, глубоко разбирающийся в тайм-менеджменте (независимо от программной системы решения), примерно одинаково понимает эти термины. И для EC Time мы также используем эту концепцию.

Итак, позвольте мне попытаться установить общее понимание основных терминов/принципов. И я открыт для обсуждения здесь, потому что я не знаю, есть ли в мире страны, где реальная деловая практика отличается от того, что я описываю ниже. Но, основываясь на 20-летнем опыте тайм-менеджмента, я осмелюсь сказать следующее:

В целом существует несколько различных методов записи времени с точки зрения HR.И это можно отличить в:

Запись времени отсутствия, запись отрицательного времени и запись положительного времени. Что понимается под методами записи времени?

 

1. Запись времени отсутствия

Клиенты, использующие этот метод для группы сотрудников, НЕ требуют регистрации рабочего времени. Сотрудникам нужно только зафиксировать время своего отсутствия. Отсутствует в том смысле, что сотрудник НЕ действует в интересах работодателя в это время. Отсутствие — это, например, болезнь, отпуск, выполнение обязанностей присяжного или любая другая деловая причина, которую клиент должен отслеживать для своих сотрудников из-за заработной платы или по причинам соответствия.

Отсутствие может вычесть счет времени. Счет времени (или в терминах SAP ERP: квота) представляет собой определенное количество дней отсутствия, на которое имеет право сотрудник. Отпуск например. В связи с тем, что отпуск является оплачиваемым выходным днем, работник не может иметь неограниченное количество дней отпуска. Было бы неплохо, но без шансов ;-). Но не только отпуск списывается со счета времени, могут быть и другие. В Европе болезнь не вычитается из счета времени, но в США и других штатах существуют определенные права на оплачиваемую болезнь, которые вычитаются из истории болезни.

В связи с тем, что счет времени может быть вычтен, должны быть механизмы для расчета начисления или права. Эти правила могут быть очень сложными.

Отсутствия вообще могут быть оплачиваемыми (большинство из них) или неоплачиваемыми. А когда они платные, обычно существуют разные варианты. Только базовая заработная плата, средняя заработная плата за последние 3 месяца или знаменитая оплата как если бы: Сотрудник получает оплату, как если бы он работал, со всеми надбавками за работу в воскресенье, когда он был запланирован на воскресенье или смену. дифференциалы.По крайней мере, в Германии такой вид оплаты существует.

Итак, нужно ли записывать домашний офис, время в пути, отсутствие в командировках в сценарии регистрации времени отсутствия? Нет. Чтобы решить, является ли конкретный тип отсутствием или присутствием, вам просто нужно ответить на вопрос:

Выступает ли работник в течение своей деятельности в интересах работодателя или нет? Для отпуска, болезни и так далее он явно не подходит. Но домашний офис – сотрудник активен и работает. Деловые поездки, время в пути – тоже.В строгом смысле такого рода деятельность рассматривается не как отсутствие, а как присутствие.

Для учета отсутствия, особенно при использовании учета рабочего времени, у сотрудников должен быть график работы. Потому что в противном случае система не сможет узнать, сколько дней нужно списать со счета времени при учете 3-недельного отпуска.

Вот оно. Отсутствие записи в нескольких словах. В EC Time этот вариант также называется «Time Off». Но вы можете найти и другие термины для этого.Некоторые клиенты называют это «Vertrauensarbeitszeit» — своего рода «доверенное рабочее время» из-за того, что сотрудники не регистрируют свое реальное рабочее время, а только отсутствие.

Теперь переходим ко второму уровню:

 

2. Запись отрицательного времени

Многие думают, что запись отрицательного времени аналогична записи времени отсутствия. Но большая, большая ошибка. Отрицательное время записи намного больше. И особенно в Германии регистрация отрицательного времени во многих случаях намного сложнее, чем, например, запись положительного времени.Запись с отрицательным временем часто используется в Германии в производственной зоне, где у вас есть чередующиеся смены, например, ранняя, поздняя, ​​ночная. Сотрудники не могут приходить на работу, когда хотят, потому что существует фиксированный график смен. А если их нет в начале смены, то конвейер останавливается. Простыми словами ;-).

Регистратору отрицательного рабочего времени не нужно записывать свое рабочее время. График работы сотрудников используется как фактическое рабочее время. Вот почему ему не нужно явно записывать время своего посещения.Однако регистратору отрицательного времени необходимо фиксировать «отклонения» от рабочего графика. Отклонение – это то, где он не сработал «как планировалось». Отклонением может быть запись об отсутствии – пришел поздно, ушел раньше. Он болеет или в отпуске. Но отклонение может быть и в другое время, когда он работал, чем это было предусмотрено его рабочим графиком. Он работал дольше — значит, эту часть нужно записать. Но только ту часть, которая еще не охвачена его рабочим графиком. Или он был полный или неполный день на обучении, и клиент платит за это по-другому или просто хочет, чтобы этот особый случай был задокументирован.Или деловые поездки. Или домашний офис. Вкратце: все, что не предусмотрено его рабочим графиком или должно быть задокументировано специальным типом времени, должно быть записано как отклонение.

Записанное время смешивается с рабочим графиком сотрудников, и в результате получается фактическое количество отработанных часов. Записи могут быть основаны на продолжительности или времени начала/окончания — это зависит от того, как клиент хочет отслеживать записи сотрудников и, конечно, есть ли надбавки, основанные на времени начала/окончания, например, ночные надбавки после 20:00.Затем вам нужно иметь время начала/окончания в системе, чтобы генерировать правильные платежи.

Пример.

У сотрудника установлен график работы с 06:00 до 14:00. Он пришел на работу вовремя, но проработал на 2 часа дольше. Что ему нужно для записи? Только отклонение, которое составляет: Время работы с 14:00 до 16:00. Система автоматически генерирует на основе рабочего графика «нормальные» плановые часы с 06:00 до 14:00 как отработанные часы.

Тот же сотрудник хочет взять отгул завтра с полудня.Что ему нужно для записи? Только отсутствие с 12:00 до 14:00. В остальном система берет запланированные часы и конвертирует их в отработанные часы.

Сотрудник проходил внутреннее обучение с 11:00 до 13:00, чтобы научиться быть пунктуальным на работе. К сожалению, эта тренировка задерживается, потому что в этот день он опоздал на работу на 2 часа. Что ему нужно для записи?

Легко сейчас: отсутствие с 06:00 до 08:00, которое покрывает опоздавшую часть (поскольку время отсутствия не оплачивается или оплачивается иначе, чем отработанные часы), и ему необходимо записать тип времени присутствия с 11:00 до 13 :00.Остальные часы генерируются системой на основе графика работы. Итак, в итоге сотрудник имеет следующие записи:

06:00 – 08:00 отсутствие опоздание (записывается)
08:00 – 11:00 рабочее время (генерируется системой)
11:00 – 13:00 обучение (записывается)
13:00 – 14:00 рабочее время (сгенерировано системой)

Это негативный тайм-менеджмент. Самое важное сообщение: для сотрудников с негативным тайм-менеджментом нужно фиксировать только отклонения от графика работы.

Но к каким сотрудникам применяется метод негативного тайм-менеджмента? Ну, это не может быть легко ответить.Это отличается от страны к стране, от отрасли к отрасли.

Давайте посмотрим на несколько примеров:

В Германии в производственной сфере очень распространен негативный тайм-менеджмент. Эти сотрудники являются наемными работниками (как и большинство сотрудников в Германии), и они работают в фиксированных сменах, часто так называемых 3-х непрерывных сменных сменах, что составляет 24 часа / 6 или 7 дней. Возьмем, к примеру, производство автомобилей. Эти сотрудники должны быть на сборочной линии, когда начинается смена, иначе производственный процесс нарушается.Следовательно, они не могут работать гибко и приходить и уходить, когда хотят. Исправьте графики смен, исправьте начало работы, исправьте время перерывов. Каждый сотрудник сменной группы должен присутствовать и пунктуален. Следовательно, не нужно записывать рабочее время, а только отклонения. Если вы хотите использовать некоторые старомодные термины из истории, вы можете назвать эту группу сотрудников «синими воротничками».

А здесь вы можете увидеть разницу в философии тайм-менеджмента в Европе и США, что иногда затрудняет общение, потому что каждый участник спорит, основываясь на своем культурном происхождении:

В США методы тайм-менеджмента совсем другие, чем в Германии/Европе.В США существует большая разница между так называемыми освобожденными наемными работниками (освобожденными от оплаты сверхурочных) и не освобожденными почасовыми работниками. Освобожденные сотрудники являются скорее «регистратором отсутствия». Но есть также наемные работники, которые получают оплату за сверхурочную работу. Эти сотрудники являются довольно негативными рекордерами времени. Но не освобожденные почасовые работники, как правило, хорошо ведут учет рабочего времени. Им платят за каждую минуту работы, а когда они работают дольше запланированного (или дольше, например, 8 часов в день), они получают оплату за сверхурочную работу.Часто таких сотрудников называют «синими воротничками», тогда как этот старомодный термин действительно уже не вписывается в сложность современного мира.

И опять же, не только целевая группа положительного времени/отрицательного времени часто отличается в Германии/Европе от США, но и вопрос о заработной плате/почасовой оплате: положительный учет рабочего времени в Германии/Европе скорее применяется для административных служащих и скорее для наемных работников (хотя почасовая оплата существует и для временных работников).Наемные работники с положительным временем, работающие скорее 90 175, а не 90 176 по сменам, а по гибкому графику, который представляет собой модель, в которой сотрудники могут сами решать в определенных пределах, сколько времени они хотят работать каждый день. Они могут работать дольше в определенные дни и не получать за это сверхурочную оплату, но часы переводятся на учетную запись с гибким графиком. Если они хотят уйти раньше по пятницам или в другие дни, им не нужно просить об отпуске (как это должен был бы сделать регистратор отрицательного времени), а просто уйти раньше.Минус-часы в этот день компенсируются в счете гибкого графика за счет увеличения продолжительности работы в другие дни.

Для работодателей этот метод весьма удобен, так как они не обязаны платить сверхурочную за каждую минуту, в течение которой сотрудник работает дольше. А для сотрудников эта гибкость позволяет сбалансировать дни с большим / меньшим объемом работы и больше приспосабливать личную жизнь к работе / обязанностям.

Я не знаю клиента в США, где применяется эта модель «гибкого времени», но могу ошибаться.

Так как я уже коснулся «метода записи положительного времени», давайте рассмотрим его подробнее:

 

3.Положительное время записи:

Положительная запись времени объясняется довольно просто: сотрудник должен записывать все свое время. Отсутствие и посещаемость. График работы сотрудников определяет, когда сотрудник должен работать. Если нет учета времени в плановый день, то это как если бы работник не присутствовал и не выполнял никакой работы. В связи с тем, что нет даже записи об отсутствии, можно предположить неявку без уважительной причины. Должна существовать запись: либо отсутствие, либо явка.

Всегда представляйте себе позитивных счетчиков времени: когда они не записывают время, им как будто не платят за этот день.

Как уже упоминалось, положительный учет рабочего времени широко используется в Германии/Европе для наемных административных сотрудников. Банковский сектор, страхование, индустрия программного обеспечения или любые другие административные задачи. И очень часто позитивный учет рабочего времени так или иначе достигается за счет учетных записей гибкого рабочего времени или учетных записей свободного времени.

Итак, все очень просто: нужно записывать все времена.

Но как записывается время?
Это тоже отличается. Это может быть табель учета рабочего времени, в котором сотрудники записывают свое рабочее время либо по продолжительности, либо по времени начала/окончания.Но это также может быть терминал регистрации рабочего времени, в котором проводится считывание карты учета рабочего времени, веб-часы, создающие автоматический сигнал, когда сотрудник входит в систему, биометрическое устройство или мобильное устройство, создающее единичные события времени, и логика должна применяться автоматически к создайте из отдельных ударов временную запись с указанием времени начала/окончания или рассчитайте из нее продолжительность для гибкого расчета времени, расчета сверхурочной работы или любых других расчетов, связанных с персоналом. Но вы также обнаружите, что иногда децентрализованный администратор времени записывает время присутствия для группы сотрудников (что было бы немного старомодно).

А как насчет учета времени проекта или учета времени выставления счетов заказчиком. Это позитивное время?

Ну, это зависит ;-). Я бы сказал, где эти проектные часы / часы WBS / часы внутреннего заказа и т. д. также используются для целей оценки времени, и где эти сотрудники, когда они не работают на клиента, должны записывать другой тип посещаемости, например «администрация»; «обучение» или что там еще, тогда да. Это позитивное время. Потому что им нужно записывать все свои часы.

Но вы также найдете клиентов, у которых часы «CATS» (кросс-приложение табель учета рабочего времени) не используются для целей управления персоналом, а только для выставления счетов или администрирования проектов.Следовательно, нет интеграции CATS с платежной ведомостью. И тогда эти сотрудники не являются положительными регистраторами времени с точки зрения тайм-менеджмента. Потому что эти часы не используются для расчета сверхурочной работы, расчета гибкого рабочего времени или для каких-либо других целей управления персоналом. Но, честно говоря, это своего рода серая зона. Некоторые есть, некоторые нет. Некоторые консультанты регистрируют часы, за которые выставляются счета, для целей оценки времени для получения оплаты за сверхурочную работу, а некоторые нет. Это действительно зависит от клиента к клиенту.

Но самое главное, что нужно помнить, это положительный регистратор времени:
Этот сотрудник должен записывать ВСЕ свое время.Отсутствие и посещаемость. Плановое рабочее время является ориентировочным, дает только дни/часы, когда работник должен выполнять работу.

Итак, подытожим, самые важные сообщения:

Запись отсутствия:
Сотрудники записывают только время своего отпуска. Болезнь, отпуск.

Отрицательное время:
График работы сотрудников — это отработанные часы, если сотрудник не регистрирует отклонения. Отклонения могут быть временем отсутствия, но также и временем посещения.Посещаемость может быть в пределах запланированного рабочего времени (обучение, время в пути или любое другое присутствие, которое может оплачиваться по-другому или должно быть задокументировано) или вне запланированного времени, например, сверхурочная работа.

Положительное время:
Сотрудник должен записывать все время своего отсутствия и присутствия. График работы используется только для получения запланированного времени и проверки необходимости записи работником рабочего времени/времени отсутствия в день.

В центральном управлении рабочим временем вы определяете, является ли сотрудник регистратором отрицательного или положительного времени с помощью так называемого «профиля записи времени», который назначен сотруднику в информации о работе.Профиль записи времени объединяет все правила оценки времени вместе, и вы выбираете, имеет ли профиль записи времени метод записи времени только положительное время, сверхурочное время, отрицательное время или отсутствие. Вы можете спросить, почему здесь есть запись «только отсутствующие». Этим сотрудникам вообще не нужен профиль записи времени, потому что они используют только свободное время и не используют табель учета рабочего времени. Правда, относитесь к этому скорее как к исторической технической вещи. Честно говоря, я не могу представить себе вариант использования, в котором вам понадобится эта опция.

Вот и все.Бьюсь об заклад, вы получили несколько иной опыт, чем я, в мире реального времени, потому что тайм-менеджмент настолько неоднороден, что черно-белые схемы не могут быть применены. Есть один клиент, который живет и занимается тайм-менеджментом совершенно иначе, чем другой клиент в той же стране, в том же филиале, в той же профсоюзной зоне. А дальше много стран, много филиалов…. Вы можете поделиться своими разными взглядами, разным опытом. Я всегда стремлюсь учиться разным вещам.

В противном случае я надеюсь, что это немного помогло прояснить некоторые основные принципы/термины тайм-менеджмента.

С уважением

Волкер

 

 

 

 

 

Спектр групп крови АВО и Rh (D) среди палестинских студентов Университета аль-Азхар в Газе

Спектр крови по системе АВО и Rh (D) группы среди
палестинских студентов в Университете Аль-Азхар Газа

Юнис Абед ЭЛ-Ваххаб Скайк 1 , Нермин Р.Эль-Зян 2

РЕЗЮМЕ

Целью исследования было оценить Распределение групп крови по системе АВО и Rh(D) в выборке 1158 студентов обоих полов из Университета Аль-Азхар, Газа, Палестина. Группы крови фенотипы выявляли классическим методом на предметных стеклах. Частота АВО для оба пола можно показать общей формулой A>O>B>AB. Резус положительный и отрицательное распределение у обоих полов было одинаковым (97%) и (3%) соответственно.Преобладала группа крови A Rh (D) положительная. среди обоих полов, в то время как группа крови O Rh (D) отрицательная была самой распространенной среди Обоих полов.

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: Спектр АВО, Rh группы, Газа, Палестина.

Pak J Med Sci Июль — сентябрь 2006 г. Том. 22 № 3 333-335


1. Доктор Юнис Абед Эль-Ваххаб Скайк,
Кафедра лабораторной медицины,
Факультет прикладных медицинских наук,
Университет Аль-Азхар, Газа,
Газа, Палестина.

2. Д-р Нермин Р. Эль-Зян,
Отделение переливания крови,
Больница Аль-Шифа, Газа, Палестина.

Для корреспонденции:
Доктор Юнис А. Скайк,
ул. Омар Аль-Мохтар, 16/46,
Газа, Палестина.
Электронная почта: [email protected]

* Поступила в публикацию: 25 ноября 2005 г.

* Принят: 15 апреля, 2006


ВВЕДЕНИЕ

С 1960-х годов существовала острая конкуренция за выполнить первое и безопасное переливание крови человеку.Однако большинство испытания по переливанию крови потерпели неудачу без научного объяснения.

1 До открытия Карла Ландштейнера в 1901 году. Он открыл первый и самая важная система групп крови на поверхности эритроцитов (эритроцитов), Система групп крови АВО. Важность открытия Ландштейнера заключается в том, что во-первых, переливание крови среди разных групп населения независимо от их этническое происхождение, во-вторых, трансплантация органов, 2 и, наконец, развитие судебной медицины и антропологии. 3 В 1940 году Ландштейнер также открыл систему резуса, которая является второй важная система переливания крови. Наша главная цель настоящего исследования заключалась в определении частот групп крови АВО и резус-D в популяционная выборка из студентов-медиков.

ПРЕДМЕТЫ И МЕТОДЫ

После одобрения проекта обеими Лабораториями Медицинский факультет и факультет прикладных медицинских наук в Аль-Азхаре Университет, Газа, Палестина, все испытуемые мужчины (М) и женщины (Ж) были устно проинформированы о цели исследования и согласились на участие.Включенные субъекты проживали в городе Газа или в окрестностях Газы. Всего из 1158 человек (545 мужчин и 613 женщин) в возрасте 18-20 лет. сдали анализы на группы крови АВО и Rh (D). Образцы крови были собраны либо проколом пальца стерильным ланцетом, либо стерильным шприцем. Анти-А, Для крови использовали антисыворотки Anti-B и Anti-D (Labkit, Барселона, Испания). групповое фенотипирование методом слайдов.

4 Производители процессуальные инструкции были соблюдены.На помеченном предметном стекле капля анти-А, помещали анти-В и анти-D и в каждую добавляли по капле тестируемых клеток. был смешанным. Результаты агглютинации регистрировали сразу после смешивания. 5,6

РЕЗУЛЬТАТЫ

Распределение групп крови системы АВО у мужчин (как резус-положительные, так и отрицательные доноры) проиллюстрировано в (Таблица-I). Кровь группа А оказалась самой распространенной группой (37,6%) среди резус- положительные студенты мужского пола.Наименее часто встречающейся группой крови была AB (6,6%).

Напротив, спектр АВ0 среди резус- отрицательные доноры могут быть показаны общей формулой O>A>AB>B. Аналогичный выявлена ​​частота групп крови системы АВО как у резус-положительных, так и у отрицательных резус-факторов у женщин (таблица II).

ОБСУЖДЕНИЕ

Антигены А и В считаются наиболее иммуногенны, а главное, в связи с их ролью в переливании крови и трансплантация.

7 Во время мировых войн впервые обнаружили, что частота этих антигенов разные у людей, проживающих в разных частях мира. 8 В настоящем исследовании, которое впервые задокументировало спектр ABO группы крови, самая распространенная группа крови была А у обоих полов. Напротив, Группа крови O преобладала на Западном берегу, в Сирии, Саудовской Аравии и Судан. 9-12 Группа крови А была самой распространенной в Непал, Тегеран, Российская Федерация, кафиры, калаши, лопари, к северо-западу от Англия, Читрали, австралийские аборигены западноевропейского происхождения и африканцы спуски. 13-18 Таким образом, наше исследование согласуется с их выводы. Во всех популяциях наименее распространена группа АВ. Для резус-системы, процент резус-положительного и отрицательного составил (97,3%) и (2,7%) соответственно у обоих полов. Группа крови O была доминирующей по резус-фактору. отрицательные студенты, в то время как группа крови А была преобладающей среди резус-положительных доноры. Сходное с нашим исследованием распределение Rh было обнаружено в Азаде, Джамму и Население Кашмира. Они обнаружили, что Rh D положительный и отрицательный (97.7%) и (2,3%) соответственно. 19 Наше запланированное исследование было доставлено в задокументировать частоту групп крови ABO и Rh (D) в секторе Газа. Однако, для подтверждения наших выводов необходимо более всестороннее исследование.

ССЫЛКИ

1. Мюрэ Б.А. Первая записанная переливание: с 1656 по 1668. Переливание 1990; 30(4): 358-62.

2. Сигмон Дж.М. Основные принципы системы групп крови ABO и Rh для практикующих гемаферез.Клин Аферез 1992; 7: 158-62.

3. Веселый Дж.Г. Судебно-медицинский Значение групп крови человека. J Indian Med Assoc 2000; 98: 340-41.

4. Уокер Р.Х., Хоппе П.А., Джадд В.Дж. Технический Мануэль. 10-е изд. Американская ассоциация банков крови, Арлингтон 1990 г.; стр. 197-223.

5. Уолтер А.Х. Лабораторные аспекты переливания крови. В: Дейси SJV, Льюис С.М. (ред.). Практическая гематология 8-я изд. Лондон: Черчилль Ливингстон, 1995; 479-97.

6.Стин ЭА. Базовая генетика. В: Питтильо Д.Х. (ред.). Современные методы хранения и переливания крови. Филадельфия: FA Davis Co, 1983; 23-53.

7. Моллисон П.Л., Энгельфрит К.П., Контерас М.: Иммунология эритроцитов. Вышли: Моллисон Л.П., Энгельфрит К.П., Контерас M. Переливание крови в клинической медицине, Editors: Oxford: Blackwell Научные публикации 1993 г.; 9-е издание: 87-8.

8. Бойд туалет. Генетика и расы человек. Бостон. Литтл Браун и Ко 1950; 335-42.

9.АлиШтайе, М.С., Хэмлин А.Х., Фенди Ю.Р. Распределение групп крови системы АВО и резус-фактора у палестинцев проживающих в северной части Западного берега. Наджа Рез Дж. 1988; 2(1): 35-41.

10. Мариеб Э.Н. Основы человека Анатомия и психология. Нью-Йорк: Издательство Benjamin/Cambridge Publishing Company. Ссылка цитируется у сирийских арабов. Суд Мед Эксперт 1996; 39(2): 34-6.

11. Башвари Л.А., Аль-Мулхим А.А., Ахмад М.С., Ахмед М.А. Частота групп крови системы АВО в Восточном регионе Саудовская Аравия.Саудовская Медицина J 2001; 22(11):1008-12.

12. Мванги Дж. Группа крови распространение в городском населении больных целевых доноров крови. Восточная Африка Мед J 1999; 76(11): 615-8.

13. Праманик Т., Праманик С. Распределение групп крови по системам АВО и Rh у непальских студентов-медиков: отчет. Ист Медитерр Хелс J 2000; 6(1): 156-8.

14. Амин-уд-Дин М., Фазели Н., Рафик М.А., Малик С. . Серологическое исследование среди муниципальных служащих г. Тегеран, Иран: распределение групп крови по системам АВО и Rh.. Хаэма 2004; 7(4): 502-4.

15. Томилин В.В., Гуртовая С.В. То Частота обнаружения антигенов системы АВ0 у населения России Федерация. Суд Мед Эксперт 1999; 42: 16-8.

16. Бернхард В. Распространение Группы крови системы АВО и частота встречаемости резус-фактора (D) в различных этнических группах в район Гиндукуша (кафиры, калаши, читаралы). Антропол Анз 1980; 37: 251-4.

17. Mollison PL, Engelfriet CP, Conteras M: группы ABO, Lewis Ii и P.Вышел: Моллисон, Англия, Энгельфрит CP, Conteras M Переливание крови в клинической медицине, редакторы: Оксфорд: Научные публикации Блэквелла, 1993 г.; 9-е издание: 150-51.

18. Оверфилд Дж., Доусон М., Хамер D. Знакомство с системами групп крови АВО и резус. В: Си Джей Паллистер. Наука о переливании крови, редактор: Оксфорд, 1999; 5: 72.

19. Рашид М. Частота генов АВО, группы крови в Азад Кашмир. [магистерская диссертация]. Пешавар: Факультет ботаники, Университет Пешавар; 1983.

Профессиональный Медицинские издания
Комната № 522, 5 этаж, Центр «Панорама»
Корпус № 2, а/я Box 8766, Саддар, Карачи — Пакистан.
Телефоны: 5688791, 5689285 Факс: 5689860
[email protected]

Опрос HPU/N&R: Большинство считает, что страна разделена, агитация в 2020 году более негативна

HIGH POINT, Северная Каролина, 13 ноября 2019 г. – Новый университет Хай-Пойнт и опрос News and Record показывают, что 65% жителей Северной Каролины считают, что на президентских выборах в 2020 году будет больше грязи или негативной агитации, чем на недавних президентских выборах.Только 6% считают, что будет меньше грязи и негативной агитации, а 18% сказали, что это будет так же, как на недавних президентских выборах.

Опрос также показал, что 62% жителей Северной Каролины считают, что американский народ в целом более разделен. Около 23% сказали, что это не сильно отличается от обычного, и только 8% считают, что американский народ стал более сплоченным.

Когда жителей спросили, думают ли жители Вашингтона, округ Колумбия, что республиканцы и демократы будут проводить больше времени в следующем году, работая друг против друга или работая вместе, чтобы добиться цели, 69% ответили, что будут работать друг против друга.Между тем, 47% заявили, что отношения между республиканцами и демократами в Вашингтоне, округ Колумбия, ухудшатся в следующем году.

Что касается предвыборной рекламы на 2020 год, то 33% заявили, что реклама более негативна, чем на прошлых выборах, а 46% заявили, что реклама примерно такая же. Только 6% считают, что реклама предвыборной кампании 2020 года менее негативна, чем на прошлых выборах, а 16% не высказали свое мнение.

«Согласно ноябрьскому опросу, большинство жителей Северной Каролины считают, что республиканцы и демократы в Вашингтоне, округ Колумбия,C., будут проводить больше времени, работая друг против друга», — говорит Брайан Макдональд, заместитель директора HPU Poll и дополнительный инструктор. «Большинство респондентов также считают, что американцы в целом сегодня более разделены».

Все взрослые – Обливание грязью (ноябрь 2019 г.)

Считаете ли вы, что на президентских выборах 2020 года будет БОЛЬШЕ грязи или негативной агитации, чем на недавних президентских выборах, или будет МЕНЬШЕ поливания грязью и негативной агитации?

Больше – 65%

Меньше – 6%

То же – 18%

Не знаю – 12%

(Все взрослые жители Северной Каролины по телефону и онлайн-выборке, опрос в ноябре 2019 г.1 – 7, 2019 г., n = 1049 и доверительный интервал +/- 3,6%)

Все взрослые – отношения в Вашингтоне, округ Колумбия (ноябрь 2019 г.)

Как вы думаете, отношения между республиканцами и демократами в Вашингтоне, округ Колумбия, улучшатся в наступающем году, ухудшатся или останутся такими же, как сейчас?

Поправиться – 11%

Становится хуже – 47%

Оставайтесь на том же уровне – 31%

Не знаю/отказываюсь – 11%

(Все взрослые жители Северной Каролины по телефону и онлайн-выборке, опрос в ноябре 2019 г.1 – 7, 2019 г., n = 1049 и доверительный интервал +/- 3,6%)

Все взрослые – работающие в Вашингтоне, округ Колумбия (ноябрь 2019 г.)

Как вы думаете, республиканцы и демократы в Вашингтоне, округ Колумбия, потратят больше времени в следующем году, работая друг против друга или работая вместе, чтобы добиться цели?

Работа друг против друга – 69%

Совместная работа – 16%

Не знаю – 16%

(Все взрослые жители Северной Каролины по телефону и онлайн-выборке, опрос в ноябре 2019 г.1 – 7, 2019 г., n = 1049 и доверительный интервал +/- 3,6%)

Все взрослые – Америка в целом (ноябрь 2019 г.)

Теперь, думая об американском народе в целом, как вы думаете, люди в США более сплочены, более разделены или мало чем отличаются от обычных?

Более сплоченный – 8%

Больше разделов – 62%

Не сильно отличается от обычного – 23%

Не знаю – 8%

(Все взрослые жители Северной Каролины по телефону и онлайн-выборке, опрос в ноябре 2019 г.1 – 7, 2019 г., n = 1049 и доверительный интервал +/- 3,6%)

Все взрослые – рекламная кампания 2020 г. (ноябрь 2019 г.)

Основываясь на том, что вы видели, как вы думаете, реклама кампаний 2020 года была более негативной, чем на прошлых выборах, менее негативной или примерно такой же?

Больше негатива – 33%

Примерно столько же – 46%

Менее отрицательное – 6%

Не знаю – 16%

(Все взрослые жители Северной Каролины по телефону и онлайн-выборке, опрос в ноябре 2019 г.1 – 7, 2019 г., n = 1049 и доверительный интервал +/- 3,6%)

Последний опрос HPU был проведен интервьюерами в прямом эфире из Исследовательского центра High Point University Survey, звонившими с 1 по 7 ноября 2019 г., и в то же время был проведен онлайн-опрос. Ответы из выборки из всех округов Северной Каролины были получены от 1049 взрослых, опрошенных в Интернете (801 респондент), а также по стационарным или сотовым телефонам (248 респондентов). Исследовательский центр Survey заключил контракт с Dynata, ранее известной как Research Now SSI: https://www.dynata.com/, чтобы получить эти образцы и провести онлайн-опрос, используя свою платформу Qualtrics. Это комбинированная выборка интервью по телефону и онлайн-интервью. Онлайн-выборка осуществляется из группы респондентов, поэтому их участие не соответствует обычным предположениям, связанным со случайным отбором. Поэтому нецелесообразно назначать классическую погрешность выборки для результатов. В этом случае SRC обеспечивает доверительный интервал плюс-минус 3,6 процентных пункта для учета традиционного 95-процентного доверительного интервала для оценок (плюс-минус 3 процентных пункта) и расчетного эффекта, равного 1.2 (по взвешиванию). Данные взвешиваются в соответствии с оценками населения по возрасту, полу, расе / этнической принадлежности и уровню образования на основе данных переписи населения США для Северной Каролины. Такие факторы, как формулировка вопроса и другие методологические решения при проведении опроса, могут внести дополнительную ошибку в результаты опросов общественного мнения. Подробности этого опроса доступны по адресу http://www.highpoint.edu/src/files/2019/11/68memoB.pdf.

Дополнительные результаты и методологические подробности самого последнего опроса и прошлых исследований можно найти на веб-сайте Survey Research Center по адресу http://www.highpoint.edu/src/. Онлайн-материалы включают прошлые пресс-релизы, а также заметки, обобщающие результаты (включая рейтинги одобрения) для каждого опроса с 2010 года.

Опрос HPU сообщает о методологических деталях в соответствии со стандартами, установленными Инициативой прозрачности AAPOR, а исследовательский центр HPU Survey является членом-учредителем Инициативы. Для получения дополнительной информации см.

http://transparency.aapor.org/index.php/transparency.

Вы можете следить за опросом HPU в Твиттере по адресу https://twitter.com.com/HPUSurveyCenter.

Доктор Мартин Кифер, председатель и адъюнкт-профессор политологии, является директором опроса HPU, а Брайан Макдональд является заместителем директора опроса HPU.

границ | Интеграция различий в подсчетах и ​​сходства кривых при обнаружении негативных регуляторных элементов

Введение

Экспрессия эукариотических генов жестко контролируется различными типами цис -регуляторных элементов (CRE), которые различаются по регуляторной функции, генетическим и эпигенетическим характеристикам (Maston и другие., 2006). Промоторы и энхансеры представляют собой положительные CRE, которые инициируют и усиливают транскрипцию соответственно. Энхансеры действуют локально или на больших расстояниях в геноме посредством образования петель хроматина, чтобы регулировать свои гены-мишени (Shlyueva et al., 2014; Haberle and Stark, 2018; Schoenfelder and Fraser, 2019). Напротив, сайленсеры представляют собой негативные регуляторные элементы (NRE), которые подавляют экспрессию генов посредством механизмов, которые до конца не изучены (Ogbourne and Antalis, 1998). Мутации в CRE человека часто связаны с онкогенезом, нейродегенерацией и метаболическими заболеваниями (Maston et al., 2006), подчеркивая функциональную важность контроля транскрипции в клетках.

В эукариотических геномах сайленсеры не исследовались так активно, как энхансеры (Della Rosa and Spivakov, 2020). Большинство сайленсеров в базе данныхsilinerDB предсказано (Zeng et al., 2021). Потенциальные сайленсеры также были предсказаны в клеточных линиях (Doni Jayavelu et al., 2020) с помощью gkmSVM, который использует особенности последовательности известных сайленсеров (Ghandi et al., 2016). В отличие от энхансеров, предсказание сайленсеров в настоящее время невозможно, потому что неизвестно, несут ли сайленсеры вездесущие эпигенетические сигнатуры.Таким образом, полногеномная характеристика функциональных сайленсеров имеет решающее значение для раскрытия генетических и эпигенетических особенностей сайленсеров. Геномные последовательности регуляторной активности можно систематически оценивать с помощью STARR-seq, широко используемого метода MPRA, изначально разработанного для идентификации энхансеров (Melnikov et al., 2012; Arnold et al., 2013; Crocker and Stern, 2013; Gisselbrecht et al., 2013; Mogno et al., 2013; Vanhille et al., 2015; Wang et al., 2018; Sun et al., 2019). Теоретически STARR-seq также измеряет активность сайленсеров.На самом деле, Дони Джаявелу и др. успешно использовали STARR-seq для измерения репрессирующей транскрипцию активности сайленсеров, которая была предсказана эпигенетическими особенностями (Doni Jayavelu et al., 2020). В последнее время в нескольких исследованиях сообщалось о каталогах глушителей, которые были предсказаны или идентифицированы различными методами в различных модельных системах в небольших масштабах (Petrykowska et al., 2008; Huang et al., 2019; Doni Jayavelu et al., 2020; Pang и др.). Снайдер, 2020).

Для MPRA необходим статистический метод, специально разработанный для идентификации сайленсеров, чтобы облегчить исследования идентичности сайленсеров и их роли в регуляции транскрипции.Чтобы разработать программу идентификации сайленсеров, разработчикам необходимо учитывать функциональные различия между энхансерами и сайленсерами (Zhang et al., 2008; Heinz et al., 2010; Lee et al., 2020). Дони Джаявелу и др. измерили активность сайленсера в выбранных доступных областях хроматина путем сравнения секвенированных прочтений репортерной кДНК с прочтениями входной ДНК-вставки с использованием одностороннего теста t (Doni Jayavelu et al., 2020). В то время как Панг и соавт. использовали модельный метод MAGeCK (Li et al., 2014) после подсчета прочтений методом HTSeq (Anders et al., 2015; Pang, Snyder, 2020). MAGeCK похож на edgeR (Robinson et al., 2010) и DESeq (Anders and Huber, 2010) по своим стратегиям проектирования, но отличается от двух других методов предполагаемым использованием. Первоначально MAGeCK использовался в нокаутных скрининговых анализах CRISPR/Cas9. В отличие от этих мелкомасштабных анализов, полногеномные секвенированные чтения следуют отрицательному биномиальному распределению. Потенциально, методы, предназначенные для обнаружения дифференциально метилированных областей (DMR) или дифференциальных модификаций хроматина (Shen et al., 2013; Линхард и др., 2014; Чжан и др., 2014 г.; Лун и Смит, 2016 г.; Gaspar and Hart, 2017) можно использовать для идентификации глушителей. Однако специфичность, надежность, точность и разрешающая способность этих программ не оценивались для идентификации глушителей. Недавно опубликованный метод CRADLE предназначен для идентификации энхансеров (Kim et al., 2021). Теоретически CRADLE может обнаруживать и глушители. Тем не менее, о вычислительном методе, разработанном специально для идентификации глушителей, не сообщалось.

В этом исследовании мы предлагаем программу Fast-NR, которая предназначена для идентификации глушителей с использованием наборов данных, сгенерированных STARR-seq, путем интеграции характеристик последовательного считывания и формы сигнала, которые учитываются при разработке многих пиков ChIP-seq. вызывающие абоненты, включая Polyapeak, PICS и CLC (Thomas et al., 2017; Hower et al., 2011; Cremona et al., 2019; Yan et al., 2020) (Zhang et al., 2011; Wu and Ji, 2014). ; Стрино и Лаппе, 2016). Fast-NR доступен по адресу https://github.com/Na-He/Fast-NR.Мы протестировали эту программу на смоделированных наборах данных и наборах данных STARR-seq (Johnson et al., 2018; Doni Jayavelu et al., 2020), сравнили производительность Fast-NR с несколькими другими программами и показали здесь, что Fast-NR может обнаруживать NRE. при разных условиях.

Методы

Алгоритм

Фрагменты ДНК активности NRE снижают собственные уровни экспрессии в репортерной библиотеке кДНК STARR-seq. Чтобы идентифицировать NRE, мы сначала вычисляем значения p для каждого нуклеотида, покрытого репортерной кДНК и входной ДНК-вставкой в ​​геноме.Если значение p ниже произвольного порога, соответствующий геномный регион рассматривается как потенциальный NRE. Затем мы наносим числа репортерной кДНК и входных прочтений ДНК в виде кривых и измеряем расстояния между ними, чтобы определить, похожи ли они, используя несколько различных методов. Предполагается, что для NRE оценки сходства должны быть низкими. Интегрируя признаки различия числа подсчетов и сходства кривых, мы разработали вычислительный метод Fast-NR (рис. 1) и проверили его мощность обнаружения NRE на смоделированных и реальных наборах данных STARR-seq соответственно.По сути, мы сначала отбирали нуклеотиды, у которых количество прочтений репортерной кДНК было меньше, чем прочтений входной вставки, по крайней мере, на 12, что соответствует установленному нами пороговому значению 90 175 p 90 176 (10 90 269 -5 90 270 ). Мы вычисляем p значений, используя кумулятивную функцию плотности (CDF) отрицательного биномиального распределения (NBD). Затем мы используем отдельные нуклеотиды, которые проходят начальный скрининг, в качестве якорей и расширяем геномное окно вверх и вниз по течению, в общей сложности до 601 п.н. Далее мы исследуем значения p каждого нуклеотида в каждом окне 601 п.н. и оставляем только окна, в которых 3/4 всех нуклеотидов имеют значение p ниже 10 -5 .Если два окна перекрываются, мы оставляем одно в общей области с меньшими значениями p . Затем мы сравниваем сходство между кривыми репортерной кДНК и входными считываниями ДНК вставки и отбрасываем любое окно с оценкой сходства кривой выше произвольного порога. Наконец, мы корректируем 90 175 p 90 176 значений для каждого окна идентифицированного NRE с помощью теста Бенджамини-Хохберга (BH) и оставляем только те, у которых скорректированное значение 90 175 p 90 176 меньше 10 90 269 -5 90 270 .

РИСУНОК 1 .Конвейер идентификации отрицательного регулирующего элемента. BH, поправка Бенджамини–Хохберга.

p Расчет значений

Мы рассчитываем значения p с помощью кумулятивной функции плотности (CDF) отрицательного биномиального распределения для считываний секвенированных репортерных кДНК. Функция массы вероятности числа отказов k раз для отрицательного биномиального распределения равна

CDF(m,n,p)=P(xn≤m)=∑i=0m(i+n−1n−1)pn(1 −p)i,

, где CDF(m,n,p) возвращает вероятность, которая меньше, чем m неудачных попыток до n-й удачной попытки, с единственной вероятностью успеха p.Здесь m — этоtreatCount, полученный из отрицательного биномиального распределения, n — этоtreatTotal-treatCount, а p — это (controlTotal-controlCount)/controlTotal. treatTotal и controlTotal представляют собой общее количество фрагментов репортерной кДНК и входной ДНК-вставки в секвенированных библиотеках соответственно. treatCount и controlCount представляют собой количество репортерной кДНК и входной ДНК-вставки, покрывающей каждый нуклеотид, соответственно.

Сходство кривых

Мы сравниваем форму кривых считывания репортерной кДНК и исходной ДНК-вставки.Косинус, метод Пирсона, евклидов и внутренний метод градиента (линейная корреляция наклона) используются для расчета сходства кривых в этом исследовании.

Косинус

Метод косинуса вычисляет косинусное расстояние между одномерными массивами u и v:

Cos (u, v)=1−∑i=0nuivi∑i=0nui2∑i=0nvi2,

и vi представляют собой значения количества прочтений репортерной кДНК и входной ДНК-вставки в векторах u и v.

Евклидово

Евклидов метод вычисляет евклидово расстояние между одномерными массивами u и v: введите значения счетчика считывания ДНК вставки в векторах u и v.

Пирсон

Пирсон вычисляет коэффициент корреляции Пирсона между одномерными массивами u и v:

cor=∑i=0n(ui−u¯)(vi−v¯)∑i=0n(ui−u¯ )2∑i=0n(vi−v¯)2,

, где ui и vi представляют собой репортерную кДНК, а значения счетчика считываний входной ДНК-вставки в векторах u и v.

Градиент

Этот алгоритм вычисляет коэффициенты корреляции Пирсона между градиентами кривых репортерной кДНК и прочтений входной ДНК-вставки. Значения охвата и геномного местоположения каждого глушителя образуют двумерный массив, представленный y и x соответственно.Мы вычисляем градиент между двумя соседними точками в этом массиве по следующей формуле:

G(i)= (yi+1−yi)(xi+1−xi),

, где yi — значение покрытия, а xi — позиция значение точки i в 2D-массиве. Индекс сходства градиентной кривой представляет собой коэффициент корреляции Пирсона (как упоминалось выше) между массивами кДНК и входной вставки ДНК G(i).

p Коррекция значений

Коррекция Бонферрони и Бенджамини-Хохберга (BH) применяется для исправления p значений в нашей программе.

Наборы данных

Чтобы проверить эффективность Fast-NR, мы загрузили наборы данных STARR-seq для идентификации сайленсера в клетках K562 человека (GSE142207) (Doni Jayavelu et al., 2020) и для идентификации энхансера в необработанных клетках A549 (GSE114063) ( Джонсон и др., 2018) соответственно. Мы загрузили наборы данных модификации гистонов (h4K4me1 GSE91306; h4K27ac GSE91337; h4K4me3 GSE91218; h4K9me3 GSE91335) из ENCODE (Consortium, 2012). h4K27me3 (GSE75903) был загружен из NCBI (Sayers et al., 2022). Мы сопоставили чтения с эталонной версией генома человека hg19 (GRCh47) с использованием Bowtie2 (Langmead and Salzberg, 2012) с параметрами по умолчанию, кроме «-p 24 -X 2000 —sensive», затем отфильтровали и оставили только чтения со значением MAPQ ≥20. с помощью samtools (Danecek et al., 2021). Мы сохранили только уникальные чтения и отбросили дубликаты с помощью picardtools (Broad Institute, 2019), за исключением наборов данных K562 STARR-seq.

Результаты

Производительность Fast-NR и других потенциальных методов идентификации NRE протестирована на смоделированных данных

, 2016), MEDIPS (Lienhard et al., 2014), PePr (Zhang et al., 2014) и CRADLE (Kim et al., 2021) (см. Дополнительную таблицу S1) с использованием параметров по умолчанию. Мы использовали считывания входных вставок, которые получены путем секвенирования плазмид, извлеченных из трансфицированных клеток, и картировали их на хромосоме 22 в эксперименте STARR-seq по скринингу энхансеров в клетках A549 (GSE114063) в качестве основы моделирования. Хромосома 22 сканируется, группируется в окна по 400 п.н., и сохраняются только геномные области, охваченные не менее чем 100 секвенированными прочтениями. Мы выбрали 1000 областей в качестве симулированных сайленсеров (настоящих положительных сайленсеров), удалив чтения из этих областей на четырех разных процентных уровнях (30, 50, 70 и 90%), таким образом сохранив долю прочтений на уровне 70, 50, 30 и 10%. в смоделированных наборах данных соответственно.Эти четыре набора данных используются в качестве репортерных библиотек кДНК.

Программа csaw обнаруживает дифференциально обогащенные области в наборе данных ChIP-seq, используя стратегию скользящего окна. MEDIPS идентифицирует сайты с дифференциальным метилированием в наборе данных, полученном с помощью иммунопреципитационного секвенирования метилированной ДНК (MeDIP-seq). MEDIPS вообще не может обнаружить ни одного глушителя из библиотек, в которых сохраняется 30, 50 и 70% прочтений для смоделированных глушителей, в то время как csaw идентифицирует менее 100 глушителей независимо от того, какой процент прочтений сохраняется (рис. 2А).Эти результаты позволяют предположить, что MEDIPS и csaw могут не иметь мощности обнаружения NRE.

РИСУНОК 2 . Сравнение производительности программы на смоделированных наборах данных. (A) Количество глушителей, идентифицированных разными программами. Доля считываний, сохраненных для имитации глушителей, показана по оси x . p значение <10 −5 . (B) Мощность обнаружения глушителя различными программами с разным уровнем достоверности. Мощность обнаружения — это отношение количества идентифицированных глушителей к общему количеству смоделированных глушителей.

Программа PePr похожа на csaw по мощности обнаружения дифференциального сигнала для наборов данных ChIP-seq. PePr идентифицирует большинство смоделированных глушителей, когда считывания сохраняются на трех разных уровнях (10, 30 и 50%) (рис. 2А), что позволяет предположить, что PePr потенциально может быть пригодным для использования методом идентификации NRE. Программа CRADLE вызывает как положительные, так и отрицательные регуляторные элементы для наборов данных STARR-seq. Эта программа идентифицирует около 800 глушителей (815, 819, 821 и 812 соответственно) независимо от процента сохраненных чтений (рис. 2А).Fast-NR обнаруживает моделируемые глушители 897, 871, 712 и 317 при уровнях оставшегося чтения 10, 30, 50 и 70% (рис. 2А), что позволяет предположить, что его мощность идентификации NRE положительно коррелирует с процентом удаления чтения. Эти результаты вместе позволяют предположить, что PePr, CRADLE и Fast-NR могут быть пригодными для использования методами идентификации NRE. Кроме того, Fast-NR более чувствителен к уровням ослабления сигнала, чем другие программы.

Мощность обнаружения NRE для PePr, CRADLE и Fast-NR может изменяться при применении различных пороговых значений p .Действительно, все эти три метода обнаруживают меньше глушителей по мере того, как пороговое значение p становится более строгим (рис. 2B). Опять же, CRADLE нечувствителен к проценту удаления чтения. Интересно, что хотя Fast-NR обнаруживает меньше глушителей по мере уменьшения значения p , он определяет больше глушителей, чем CRADLE, когда сохраняются 10 и 30% считываний. PePr также чувствителен к изменению порогового значения p , особенно когда доля сохраненных прочтений составляет 70% (рис. 2В).Эти результаты показывают, что PePr и Fast-NR более чувствительны к остаточному чтению, чем CRADLE. Однако эти результаты не говорят о том, какая программа превосходит другие.

Эффективность Fast-NR и других потенциальных методов идентификации NRE протестирована на реальных наборах данных STARR-Seq

Теоретически предполагается, что геномная область репрессирующей активности транскрибируется меньше и недопредставлена ​​в репортерной библиотеке кДНК STARR-seq. Мы загрузили наборы данных STARR-seq для идентификации сайленсеров и энхансеров у человека K562 (Doni Jayavelu et al., 2020) и клетки A549 (Johnson et al., 2018) соответственно (дополнительная таблица S2). STARR-seq в K562 измеряет репрессирующую активность 7430 сайтов в доступных областях, которые предсказаны как потенциальные сайленсеры на основе эпигенетических состояний. Иными словами, STARR-seq в клетках A549 измеряет энхансерную активность по всему геному. Мы проверили мощность обнаружения NRE пяти программ на наборах данных, сгенерированных этими двумя экспериментами STARR-seq (рис. 3A). И Fast-NR, и CRADLE выявили сотни и тысячи NRE.Программа csaw определила 2399 глушителей в K562 и только 31 глушитель в A549. PePr идентифицировал 359 NRE в K562, но невероятно, 475 797 NRE в A549. MEDIPS почти не удалось идентифицировать какие-либо NRE в двух экспериментах STARR-seq. Эти результаты подтверждают, что MEDIPS не хватает мощности обнаружения NRE ни для смоделированных, ни для реальных экспериментальных данных. Программы csaw и PePr по-разному работают в двух экспериментах STARR-seq, и их низкая согласованность в производительности поставила под угрозу нашу уверенность в том, что их можно использовать для идентификации NRE.После этих сравнений мы оставили Fast-NR и CRADLE для дополнительных оценочных анализов.

РИСУНОК 3 . Сравнение производительности программы на наборах данных STARR-seq. (A) Количество глушителей, идентифицированных разными программами. p значение <10 −5 . (B) Процент глушителей, идентифицированных CRADLE и Fast-NR при различных уровнях достоверности. Количество глушителей, идентифицированных как p < 10 −2 , принимается за 100%. (C) Диаграммы Венна для глушителей, идентифицированных Fast-NR и CRADLE в K562 и A549 соответственно. p значение <10 −5 . (D) Распределение соотношения прочтений (репортерная кДНК/входные вставки) для сайленсеров, идентифицированных только с помощью CRADLE или Fast-NR в K562 и A549 соответственно. (E) Примеры глушителей, обозначенных только CRADLE (слева) или Fast-NR (справа). (F) Процент глушителей, идентифицированных Fast-NR и CRADLE ( p < 10 -5 ), согласно данным Doni Jayavelu et al.

Мы сравнили производительность Fast-NR и CRADLE, изменив пороговое значение p для идентификации NRE.Для K562 STARR-seq Fast-NR постоянно идентифицировал сайленсеры на высоких уровнях, и на них почти не влияло изменение порогового значения p (рис. 3B). Напротив, количество сайленсеров, идентифицированных CRADLE, резко сократилось до примерно 10% ( p < 1 × 10 -8 ) от числа идентифицированных при p < 0,01. Эти результаты побудили нас изучить частоту перекрытия глушителей, идентифицированных Fast-NR и CRADLE в K562. Фактически, приличное количество глушителей, идентифицированных этими двумя методами, перекрывалось у K562, но не у A549 (рис. 3C).Ожидалось, что идентифицированные сайленсеры будут иметь более низкие считывания кДНК, чем считывания входной ДНК-вставки. Мы рассчитали отношение (прочтений кДНК)/(прочтений вставок) для CRADLE-специфических и Fast-NR-специфических сайленсеров в K562 и A549. Сайленсеры, специфичные для CRADLE, показали меньшее снижение прочтений кДНК, чем сайленсеры, специфичные для Fast-NR (рис. 3D, E). Более 95% (1320/1383) глушителей, идентифицированных Fast-NR в K562, перекрываются с глушителями, о которых сообщалось (Doni Jayavelu et al., 2020) (рис. 3F). Напротив, только 56% глушителей, идентифицированных CRADLE, перекрываются с сообщенными глушителями (рис. 3F).Эти результаты предполагают, что многие глушители, специфичные для CRADLE, были идентифицированы из-за сложных процедур коррекции, которые являются неотъемлемой частью CRADLE (Kim et al., 2021). Эти специфичные для CRADLE сайленсеры оказались «ложноположительными» с точки зрения скорости редукции прочтений репортерной кДНК.

Чтобы выявить, какие факторы транскрипции могут связываться с сайленсерами, мы провели поиск в последовательностях сайленсеров и идентифицировали несколько мотивов ДНК, обогащенных для связывания факторов транскрипции (дополнительная таблица S3).Одним из этих мотивов был сайт связывания фактора сайленсинга REST (Chong et al., 1995), который был особенно обогащен в сайленсерах, идентифицированных Fast-NR. Мотив ДНК репрессора транскрипции PRDM6 также был обогащен (Davis et al., 2006). Метилирование гистона h5K20 является меткой, которая, как сообщается, связана с сайленсерами (Pang and Snyder, 2020). Мотив связывания (последовательность GC-box) для фактора транскрипции Sp1-подобных факторов также был обогащен как сайленсерами Fast-NR, так и CRADLE. Sp1-подобные факторы активируют или репрессируют транскрипцию в ответ на различные физиологические и патологические стимулы (Zhao and Meng, 2005).Мотивы ДНК PAX5 и FOS также были обогащены сайленсерами Faste-NR и CATDLE. Многие факторы транскрипции играют двойную функциональную роль в регуляции генов, и сообщалось, что сайленсеры могут переключаться на энхансеры во время развития и в разных типах клеток (Bessis et al., 1997; Cavalli, 2014; Gisselbrecht et al., 2020). Обогащение мотива связывания любого специфического транскрипционного фактора может не обязательно коррелировать с регуляторной активностью CRE в конкретном типе клеток. Тем не менее, в нашем анализе сайленсеры действительно обогащены определенными мотивами ДНК для репрессоров транскрипции, что позволяет предположить, что сайленсеры, идентифицированные с помощью Fast-NR, скорее всего, будут биологически функциональными.

Анализ сходства кривых в Fast-NR

По сравнению с четырьмя другими методами Fast-NR является единственным, который учитывает сходство между кривыми репортерной кДНК и входными сигналами ДНК-вставки. Мы исследовали, в какой степени сходство между кривыми прочтений репортерной кДНК и ДНК-вставки может повлиять на идентификацию NRE. Мы рассчитали значения индекса сходства (-log 2 CosineDistance) для NRE, идентифицированных в A549, и обнаружили, что косинусные расстояния между кривыми кДНК и плазмиды намного выше, чем случайно выбранные контрольные области генома (рис. 4A).Интересно, что значения индекса подобия отрицательно коррелируют с сильными сторонами глушителей (рис. 4B), предполагая, что более сильные глушители имеют низкое сходство кривых. Мы получили аналогичные результаты, используя другие методы расчета сходства кривых, такие как Пирсон, Евклидов и градиент (дополнительный рисунок S1A).

РИСУНОК 4 . Влияние сходства кривых на идентификацию глушителя. (A) Распределение косинусного расстояния для сайленсеров, идентифицированных с помощью Fast-NR, с учетом сходства, без учета сходства и контролями целых областей генома с размером 400 п.н. и перемешанными областями сайленсера.Расстояние отрицательно коррелирует со сходством. ** p < 10 −3 , *** p < 10 −4 , критерий суммы рангов Уилкоксона. (B) Корреляция между силой глушителя и подобием кривых. На оси X показано значение -log 2 (прочтения кДНК/прочтения вставки ДНК). По оси Y показан индекс подобия кривых −log 2 (косинусное расстояние) глушителей, рассчитанный методом косинуса. Синие точки — это глушители, которые превышают порог сходства кривых, равный 0.9, а серые точки — глушители, не преодолевающие порог подобия кривых.

Мы удалили требование подобия кривой в Fast-NR и определили больше глушителей (серые точки на рисунке 4B). Эти «новые» глушители имеют высокие значения индекса сходства кривых и низкую силу глушителя по сравнению с глушителями, идентифицированными с учетом подобия кривых (синие точки на рисунке 4B). Интересно, что сходство кривых плохо коррелирует со значениями p (дополнительная фигура S1B), предполагая, что сходство кривых в Fast-NR является признаком, не зависящим от соотношения между репортерной кДНК и считываниями входной ДНК-вставки.Коэффициенты корреляции Пирсона между сходством кривых и активностью глушителя могут быть положительными или отрицательными в зависимости от используемого метода (дополнительный рисунок S1C). Эти результаты вместе показывают, что сравнение сходства кривых также важно для надежной идентификации NRE.

Обсуждение

В этом исследовании мы представили программу Fast-NR, в которой учитываются как количество прочтений, так и сходство форм, для обнаружения NRE с использованием наборов данных STARR-seq и сравнение ее производительности с другими четырьмя программами csaw ( Лун и Смит, 2016), MEDIPS (Lienhard et al., 2014), PePr (Zhang et al., 2014) и CRADLE (Kim et al., 2021). Среди них MEDIPS, разработанный для анализа метилирования ДНК, демонстрирует наихудшую совместимость с идентификацией сайленсеров как в смоделированных, так и в экспериментальных наборах данных. Программы csaw и PePr обнаруживают значительно различающиеся области в данных ChIP-seq. Ни один из них не работает последовательно при применении к различным типам наборов данных. Помимо методов, проверенных в этом исследовании, другие методы, предназначенные для идентификации дифференциально обогащенных сигналов, также не подходят для идентификации глушителя.Например, DMRfinder (Gaspar and Hart, 2017), DSS (Park and Wu, 2016) и HMST-Seq-Analyzer (Farooq et al., 2020) требуют определенного формата входных данных, несовместимого с анализом NRE.

Fast-NR и CRADLE кажутся хорошим выбором как для смоделированных, так и для экспериментально созданных наборов данных. Однако многие сайленсеры, идентифицированные с помощью CRADLE, продемонстрировали лишь небольшое снижение сигнала репортерной кДНК по сравнению с входной ДНК-вставкой, и кривые этих сигналов были очень похожими. CRADLE использует подход GLM для исправления четырех типов смещения: структуры ДНК, влияющей на силу сдвига, свободной энергии Гиббса, влияющей на эффективность ПЦР, возможности картирования последовательностей чтения и G-квадруплекса, влияющего на процессивность ДНК-полимеразы (Kim et al., 2021). CRADLE рассматривает скорректированные сигналы как нормальное распределение и использует критерий t Уэлча для поиска различий. Как показано в нашем анализе, эти исправления приводят к обнаружению «сайленсеров», которые не могут быть идентифицированы на основе различий в количестве прочтений репортерной кДНК и входной ДНК-вставки.

В отличие от методов, использующих стратегию скользящего окна, Fast-NR обнаруживает разницу в количестве прочтений репортерной кДНК и входной ДНК-вставки с разрешением по одному основанию.Потенциально возможно использовать Fast-NR для выявления точного местоположения регуляторных элементов и сайтов связывания факторов транскрипции.

STARR-seq тестирует активность сайленсеров в эписомных репортерных плазмидах независимо от эндогенного хроматинового окружения. В идеале, регуляторная активность потенциальных CRE может быть протестирована в контексте их правильного хроматина. Методы анализа эндогенных CRE, такие как мультиплексный регуляторный анализ редактирования (MERA) (Rajagopal et al., 2016) и тысячи репортеров, интегрированных параллельно (TRIP) (Akhtar et al., 2013), можно использовать для измерения регуляторной активности геномных регионов в нативном клеточном контексте. Однако эти методы, как правило, неприменимы для объективного полногеномного анализа CRE. Тем не менее, сочетание этих методов и STARR-seq поможет добиться глобальной идентификации и, в то же время, широкомасштабной эндогенной проверки CRE.

Еще одна проблема, на которую мы хотели бы обратить внимание, касается промотора, используемого в репортерных плазмидах. В STARR-seq и родственных методах выбор промотора может повлиять на результат, поскольку используемый промотор может не реагировать на некоторые CRE.Мы предполагаем, что использование промоторов генов «домашнего хозяйства» и генов, специфичных для типа клеток, может позволить идентифицировать больше CRE, которые могут предпочесть регулировать различные типы промоторов. Чтобы сэкономить время вычислений, мы отфильтровали потенциальные NRE, последовательно применив пороги как к количеству прочтений, так и к значениям 90 175 p 90 176, что также теоретически может снизить уровень ложных срабатываний. Однако применяемые пороги могут быть слишком строгими и исключать некоторые настоящие глушители. Мы рекомендуем пользователям протестировать пороговые эффекты и выбрать соответствующие пороги для собственного анализа.

Хотя STARR-seq измеряет регуляторную активность тестируемого фрагмента ДНК в эписомальной среде, он предоставляет каталог CRE, которые можно дополнительно протестировать в их эндогенных локусах альтернативными методами. Мы не принимали во внимание погрешность секвенирования, потому что экспериментальные данные, которые можно использовать для определения того, в какой степени систематическая ошибка может повлиять на идентификацию NRE, были недоступны. Таким образом, объединив отрицательный биномиальный тест на основе подсчета прочтений и сравнение сходства форм, мы показали, что Fast-NR потенциально можно использовать для идентификации глушителя, тем самым обеспечивая мощный и надежный вычислительный метод для идентификации NRE.

Заключение

Сайленсеры являются негативными регуляторными элементами, которые контролируют точную экспрессию генов во время пролиферации и дифференцировки клеток. Растущие потребности в глобальной характеристике глушителя требуют надежного и удобного вычислительного метода. Наш метод Fast-NR объединяет информацию о количестве считываний отдельных нуклеотидов и графическую информацию для широкого обнаружения генома сайленсеров. Fast-NR идентифицирует NRE с одним базовым разрешением. Широкое применение Fast-NR ускорит генетические и эпигенетические исследования интригующих функциональных механизмов сайленсеров.

Заявление о доступности данных

Первоначальные материалы, представленные в исследовании, включены в статью/дополнительный материал; дальнейшие запросы можно направлять соответствующим авторам.

Вклад авторов

NH задумал исследование. NH и WW разработали программу. NH проанализировал данные. CF, YT и LL участвовали в разработке программы. CH руководил проектом. NH и CH написали статью.

Финансирование

Мы признательны за финансовую поддержку Национальной ключевой программы исследований и разработок Китая (номер.2018YFC1004500), Шэньчжэньской комиссии по инновациям в области науки и технологий (№ 20200925153547003) и при поддержке Центра вычислительной науки и техники Южного университета науки и технологий.

Конфликт интересов

Авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могли бы быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

Примечание издателя

Все претензии, изложенные в этой статье, принадлежат исключительно авторам и не обязательно представляют претензии их дочерних организаций, издателя, редакторов и рецензентов.Любой продукт, который может быть оценен в этой статье, или претензии, которые могут быть сделаны его производителем, не гарантируются и не поддерживаются издателем.

Благодарности

Мы благодарим доктора Лунцзянь Ню за техническую помощь и доктора Куньфэн Бай за комментарии.

Дополнительный материал

Дополнительный материал к этой статье можно найти в Интернете по адресу: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2022.818344/full#supplementary-material

Ссылки

Akhtar, W., де Йонг Дж., Пиндюрин А.В., Паги Л., Меулеман В., де Риддер Дж. и соавт. (2013). Эффекты положения хроматина, проанализированные тысячами репортеров, объединенных параллельно. сотовый 154, 914–927. doi:10.1016/j.cell.2013.07.018

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Арнольд, К. Д., Герлах, Д., Штельцер, К., Борынь, Л. М., Рат М. и Старк А. (2013). Полногеномные количественные карты активности энхансеров, идентифицированные с помощью STARR-Seq. Наука 339, 1074–1077.doi:10.1126/science.1232542

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Бессис А., Шамтьо Н., Шателен Л. и Шанже Ж.-П. (1997). Нейрон-рестриктивный элемент глушителя: двойной усилитель/глушитель, имеющий решающее значение для паттернированной экспрессии гена никотинового рецептора в головном мозге. Проц. Натл. акад. науч. 94, 5906–5911. doi:10.1073/pnas.94.11.5906

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Чонг Дж. А., Тапиа-Рамирес Дж., Kim, S., Toledo-Aral, J.J., Zheng, Y., Boutros, M.C., et al. (1995). REST: белок-глушитель млекопитающих, который ограничивает экспрессию генов натриевых каналов в нейронах. Сотовый 80, 949–957. doi:10.1016/0092-8674(95)
-8

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Кремона, М. А., Сюй, Х., Макова, К. Д., Раймхерр, М., Кьяромонте, Ф., и Мадригал, П. (2019). Функциональный анализ данных для вычислительной биологии. Биоинформатика 35, 3211–3213.doi:10.1093/bioinformatics/btz045

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Данечек П., Бонфилд Дж. К., Лиддл Дж., Маршалл Дж., Охан В., Поллард М. О. и др. (2021). Двенадцать лет SAMtools и BCFtools. Gigascience 10, giab008. doi:10.1093/gigascience/giab008

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Дэвис, К. А., Хаберланд, М., Арнольд, М. А., Сазерленд, Л. Б., Макдональд, О. Г., Ричардсон, Дж. А., и др.(2006). PRISM/PRDM6, репрессор транскрипции, который способствует программе пролиферативных генов в гладкомышечных клетках. Мол. Цел Биол 26, 2626–2636. doi:10.1128/mcb.26.7.2626-2636.2006

Полный текст CrossRef | Google Scholar

Дони Джайавелу, Н., Джаджодиа, А., Мишра, А., и Хокинс, Р. Д. (2020). Элементы-кандидаты-глушители для геномов человека и мыши. Нац. коммун. 11, 1061. doi:10.1038/s41467-020-14853-5

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Фарук, А., Grønmyr, S., Ali, O., Rognes, T., Scheffler, K., Bjørås, M., et al. (2020). HMST-Seq-Analyzer: новый инструмент Python для дифференциального анализа метилирования и гидроксиметилирования в различных данных секвенирования метилирования ДНК. Вычисл. Структура Биотехнолог. J. 18, 2877–2889. doi:10.1016/j.csbj.2020.09.038

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Гаспар, Дж. М., и Харт, Р. П. (2017). DMRfinder: эффективное определение областей с дифференциальным метилированием по данным MethylC-Seq. BMC Bioinformatics 18, 528. doi:10.1186/s12859-017-1909-0

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Ганди М., Мохаммад-Нури М., Гарегани Н., Ли Д., Гаррауэй Л. и Бир М. А. (2016). gkmSVM: пакет R для Gapped-Kmer SVM. Биоинформатика 32, 2205–2207. doi:10.1093/bioinformatics/btw203

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Гиссельбрехт С. С., Баррера Л. А., Порш М., Абухалил А., Эстеп, П.В., Веденко, А., и соавт. (2013). Высокопараллельные анализы тканеспецифических энхансеров в цельных эмбрионах дрозофилы. Нац. Методы 10, 774–780. doi:10.1038/nmeth.2558

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Гиссельбрехт С.С., Палаги А., Курланд Дж.В., Роджерс Дж.М., Озадам Х., Жан Ю. и др. (2020). Транскрипционные сайленсеры у дрозофилы выполняют двойную роль в качестве транскрипционных энхансеров в альтернативных клеточных контекстах. Мол. Сел 77, 324–337.doi:10.1016/j.molcel.2019.10.004

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Хаберле, В., и Старк, А. (2018). Эукариотические основные промоторы и функциональная основа инициации транскрипции. Нац. Преподобный Мол. Цел Биол 19, 621–637. doi:10.1038/s41580-018-0028-8

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Хайнц С., Беннер К., Спанн Н., Бертолино Э., Лин Ю. К., Ласло П. и др. (2010). Простые комбинации факторов транскрипции, определяющих происхождение, являются первичными цис-регуляторными элементами, необходимыми для идентичности макрофагов и В-клеток. Мол. Сел 38, 576–589. doi:10.1016/j.molcel.2010.05.004

CrossRef Полный текст | Google Scholar

Хуанг Д., Петриковска Х. М., Миллер Б. Ф., Ельницкий Л. и Овчаренко И. (2019). Идентификация сайленсеров человека путем корреляции межтканевых эпигенетических профилей и экспрессии генов. Рез. генома. 29, 657–667. doi:10.1101/gr.247007.118

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Джонсон Г. Д., Баррера А., Макдауэлл И.C., D’Ippolito, A.M., Majoros, W.H., Vockley, C.M., et al. (2018). Полногеномное измерение регуляторной активности, реагирующей на лекарственные средства. Нац. коммун. 9, 5317. doi:10.1038/s41467-018-07607-x

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Kim, Y.-S., Johnson, G.D., Seo, J., Barrera, A., Cowart, T.N., Majoros, W.H., et al. (2021). Исправление смещения сигнала и обнаружение регуляторных элементов в данных STARR-Seq. Рез. генома. 31, 877–889. дои: 10.1101/gr.269209.120

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Lee, D., Shi, M., Moran, J., Wall, M., Zhang, J., Liu, J., et al. (2020). STARRPeaker: унифицированная обработка и точная идентификация активных областей STARR-Seq. Геном Биол. 21, 298. doi:10.1186/s13059-020-02194-x

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Li, W., Xu, H., Xiao, T., Cong, L., Love, M. I., Zhang, F., et al. (2014). MAGeCK обеспечивает надежную идентификацию основных генов с помощью экранов нокаута CRISPR/Cas9 в масштабе генома. Геном Биол. 15, 554. doi:10.1186/s13059-014-0554-4

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Линхард М., Гримм К., Моркель М., Хервиг Р. и Чавес Л. (2014). MEDIPS: Полногеномный анализ дифференциального покрытия данных секвенирования, полученных в результате экспериментов по обогащению ДНК. Биоинформатика 30, 284–286. doi:10.1093/bioinformatics/btt650

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Лун, А. Т. Л., и Смит, Г.К. (2016). Csaw: пакет Bioconductor для дифференциального анализа связывания данных ChIP-Seq с использованием скользящих окон. Рез. нуклеиновых кислот. 44, е45. doi:10.1093/nar/gkv1191

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Мастон, Г. А., Эванс, С. К., и Грин, М. Р. (2006). Транскрипционные регуляторные элементы в геноме человека. год. Преподобный Геном. Гум. Жене. 7, 29–59. doi:10.1146/annurev.genom.7.080505.115623

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Мельников А., Murugan, A., Zhang, X., Tesileanu, T., Wang, L., Rogov, P., et al. (2012). Систематическое вскрытие и оптимизация индуцируемых энхансеров в клетках человека с использованием массивно-параллельного репортерного анализа. Нац. Биотехнолог. 30, 271–277. doi:10.1038/nbt.2137

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Могуно И., Квасьниески Дж. К. и Коэн Б. А. (2013). Массивно-параллельные анализы синтетических промоторов выявляют эффекты in vivo вариантов сайта связывания. Рез. генома. 23, 1908–1915 гг. doi:10.1101/gr.157891.113

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Петриковска Х.М., Вокли К.М. и Ельницкий Л. (2008). Обнаружение и характеристика сайленсеров и блокаторов-энхансеров в большом локусе CFTR. Рез. генома. 18, 1238–1246. doi:10.1101/gr.073817.107

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Раджагопал Н., Шринивасан С., Кушеш К., Го Ю., Edwards, M.D., Banerjee, B., et al. (2016). Высокопроизводительное картирование регуляторной ДНК. Нац. Биотехнолог. 34, 167–174. doi:10.1038/nbt.3468

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Робинсон, доктор медицины, Маккарти, Д. Дж., и Смит, Г. К. (2010). edgeR: пакет Bioconductor для анализа дифференциальной экспрессии цифровых данных экспрессии генов. Биоинформатика 26, 139–140. doi:10.1093/bioinformatics/btp616

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Сэйерс Э.В., Болтон, Э. Э., Бристер, Дж. Р., Канезе, К., Чан, Дж., и Комо, округ Колумбия (2022). Ресурсы базы данных Национального центра биотехнологической информации. Рез. нуклеиновых кислот. 50, Д20–Д26. doi:10.1093/nar/gkab1112

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Шэнь Л., Шао Н.-Ю., Лю Х., Мейз И., Фэн Дж. и Нестлер Э. Дж. (2013). diffReps: Обнаружение сайтов дифференциальной модификации хроматина по данным ChIP-Seq с биологическими повторами. PLoS One 8, e65598.doi:10.1371/journal.pone.0065598

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Sun, J., He, N., Niu, L., Huang, Y., Shen, W., Zhang, Y., et al. (2019). Глобальное количественное картирование энхансеров в рисе с помощью STARR-Seq. Геномика, протеомика и биоинформатика 17, 140–153. doi:10.1016/j.gpb.2018.11.003

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Томас Р., Томас С., Холлоуэй А.К. и Поллард К.С. (2017). Особенности, которые определяют лучшие алгоритмы вызова пиков ChIP-Seq. Бриф Биоинформ 18, 441–450. doi:10.1093/bib/bbw035

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Vanhille, L., Griffon, A., Maqbool, M.A., Zacarias-Cabeza, J., Dao, L.T.M., Fernandez, N., et al. (2015). Высокопроизводительная и количественная оценка активности энхансеров у млекопитающих с помощью CapStarr-Seq. Нац. коммун. 6, 6905. doi:10.1038/ncomms7905

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Ван, Х., Хе, Л., Гоггин С.М., Саадат А., Ван Л., Синнотт-Армстронг Н. и соавт. (2018). Полногеномное функциональное рассечение транскрипционных регуляторных областей и нуклеотидов с высоким разрешением у человека. Нац. коммун. 9, 5380. doi:10.1038/s41467-018-07746-1

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Ян Ф., Пауэлл Д. Р., Кертис Д. Дж. и Вонг Н. К. (2020). От чтения к пониманию: руководство автостопщика по анализу данных ATAC-Seq. Геном Биол. 21, 22.doi:10.1186/s13059-020-1929-3

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Цзэн В., Чен С., Цуй X., Чен X., Гао З. и Цзян Р. (2021). SilencerDB: обширная база данных глушителей. Рез. нуклеиновых кислот. 49, Д221–Д228. doi:10.1093/nar/gkaa839

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Zhang X., Robertson G., Krzywinski M., Ning K., Droit A., Jones S., et al. (2011). PICS: Вероятностный вывод для ChIP-Seq. Биометрия 67, 151–163. doi:10.1111/j.1541-0420.2010.01441.x

PubMed Abstract | Полный текст перекрестной ссылки | Google Scholar

Чжан Ю., Лин Ю.-Х., Джонсон Т. Д., Розек Л. С. и Сартор М. А. (2014). PePr: конвейер приоритезации пиков для выявления согласованных или дифференциальных пиков из реплицированных данных ChIP-Seq. Биоинформатика 30, 2568–2575.

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован.